オーストリアのマルガレーテ(ドイツ語: Margarethe von Österreich、1204年頃- 1266年10月29日)は、バーベンベルク家の出身で、最初の結婚でハインリヒ7世と結婚し、1225年から1235年までドイツ女王を務め、 2度目の結婚でオットカル2世と結婚し、1253年から1260年までボヘミア女王を務めた。
マルガレーテは、オーストリア公レオポルド6世(1230年没)と、ビザンツ帝国のアンゲルス王朝の一員である妻テオドラ・アンジェリーナの長女であった。1198年以来、ゲオルゲンベルク協定に基づき、レオポルド公はオーストリアとシュタイアーマルクの両公国を統治した。ウィーンの宮廷は中世のミンネザングの中心地として知られるようになり、ホーエンシュタウフェン朝の皇帝フリードリヒ2世と教皇グレゴリウス9世の間の争いの仲裁役を務めるなど、帝国の政策において重要な役割を果たした。
1225年11月29日、帝国都市ニュルンベルクにおいて、21歳のマルガレーテは、皇帝フリードリヒ2世の長男で1222年からローマ王に選出されていた14歳のハインリヒと結婚した。フリードリヒの顧問であるケルン大司教エンゲルベルトは当初、イングランド王家アンジュー家から花嫁を迎えることを計画していたが、この試みは失敗に終わった。また、ハインリヒが以前婚約していたボヘミア王オットカル1世の娘、プシェミスル朝の王女アグネスとの婚約も破談となった。
マルガレーテのローマ女王としての戴冠式は、1227年3月23日にアーヘン大聖堂で行われた。ハインリヒ王とマルガレーテ女王には、ハインリヒ(1242年頃/1245年頃没)とフリードリヒ(1251年頃/1252年頃没)という2人の短命な息子がいた。1228年、ハインリヒはドイツ王国の統治を引き継ぎ、諸侯の権力を制限しようとしたが、それによって破門の脅迫のもとで臣従を強要した父の帝国政策を混乱させた。
1235年、ハインリヒは諸侯の反対派と同盟を結び、皇帝に対して公然と反乱を起こしたが、父の軍勢に敗れ、廃位された。フリードリヒは彼をプーリアのいくつかの城に幽閉し、そこで1242年2月12日、落馬事故により死亡した。おそらく自殺未遂であったと思われる。一方、彼の妻マルガレーテ(おそらく二度と夫に会うことはなかった)はトリーアのドミニコ会修道院に隠棲し、1244年にはヴュルツブルクに移り、聖マルクス修道院で隠遁生活を送った。
1246年、マーガレットの兄でバーベンベルク王朝最後の末裔であるオーストリア公フリードリヒ2世がライタ川の戦いで子を残さずに亡くなり、後継者問題が生じた。オーストリア公国とシュタイアーマルク公国の後継者を主張する主な人物は2人の女性であった。1人はマーガレット(故公の長姉として血縁関係を主張)、もう1人は彼女の姪ゲルトルート(故フリードリヒ2世の長兄で、父レオポルド6世公より先に亡くなっていたメードリングのハインリヒの唯一の娘として長子相続権を主張)であった。
ボヘミア王ヴェンツェル1世は、自国の南に位置する公国を支配下に置きたいと考え、長男で後継者であるモラヴィア辺境伯ヴラディスラウス3世とゲルトルートの結婚を取り決めた。二人はオーストリア公爵夫妻にまでなったが、ヴラディスラウスは翌年(1247年)に死去した。オーストリアの次の統治者はゲルトルートの二番目の夫であるバーデン辺境伯ヘルマン6世であったが、彼は1250年に死去し、オーストリアとシュタイアーマルクは再び君主不在となった。

オーストリア貴族は、ヴェンツェル王の次男で新たな王位継承者オットカール2世に公国の統治を申し出た。しかし、貴族たちは一つの条件を課した。オットカールがオーストリアとシュタイアーマルクを統治できるのは、バーベンベルク家の相続人の一人と結婚する場合に限るというものだった。オットカールは、兄の未亡人との結婚はレビ記で禁じられているため拒否し、26歳年上のマルガレーテと結婚することにした。結婚式は1252年2月11日、ハインブルク・アン・デア・ドナウの城内礼拝堂(ドイツ語: Burgkapelle)で行われた。
オットカールは、皇帝フリードリヒ2世が認めた特権付与令(Privilegium Minus)に基づき、金印勅書で封印された皇帝特権を獲得した。この特権付与令は、マルガレーテが血縁関係により最後の公爵の相続人であったことから、オーストリアとシュタイアーマルクに対する彼の権利主張を正当化するものであった。こうして彼女はオーストリアとシュタイアーマルクの公国の統治権を夫に譲渡した。ゲルトルートとマルガレーテの間でこれまで幾度も立場を変えてきた教皇インノケンティウス4世は、1252年5月6日、両公国に対するオットカールの正当な統治を承認した。ボヘミアの行政官が彼の名の下に両公国を統治した。
その1年後の1253年9月23日、ヴェンツェル1世が崩御し、オットカールとマルガレーテがボヘミア王と王妃となった。バーベンベルク公国を獲得したオットカールは、すでに50歳になっていたマルガレーテが子供を産むことはないだろうと悟った。そこで王は、マルガレーテの侍女の一人であるクエンリングのアグネスとの間に生まれた非嫡出子を正当な後継者として教皇に認めさせようとした。しかし教皇がこれを拒否したため、1260年にオットカールはマルガレーテとの婚姻の無効を勝ち取った。
オットカルはハンガリー王ベーラ4世の孫娘であるハーリッチのクニグンダと結婚したが、拒絶された王妃マルグリットはボヘミアを去り、オーストリアの祖国に戻った。彼女はクルマウ・アム・カンプに住居を構え、冬はクレムスで過ごしました。無効化後、彼女はロマノルム・クオンダム・レジーナ(「ローマ人の元女王」)と呼ばれた。しかし、彼女はドゥシッサ・オーストリア・エ・スティリー(オーストリアおよびシュタイアーマルク公爵夫人)の称号を維持した。 1266年、彼女は父親にちなんでタイトルを「quondam filia Livpoldi illustris ducis Austrie et Sirie et Romanorum Regina 」に変更しました。

クルマウで亡くなる前に、彼女は父の隣に埋葬される場所としてリリエンフェルト修道院を選んだ。彼女の死亡日は議論の的となっている。1266年とする資料もあれば、1267年10月2日/12日とする資料もある。オットカル2世はオーストリアとシュタイアーマルクを保持し、1269年には離婚協定でマルガレーテが指名した相続人であると主張して、カルニオラ辺境伯領とともにケルンテン公国も獲得した。彼は何度か皇帝の冠の候補者にもなったが、1276年にドイツ王ルドルフ1世によって廃位され、 2年後のマルヒフェルトの戦いで戦死した。