マノリス・ケリス

マノリス・ケリス
2017年10月19日、フロリダ州オーランドで開催されたアメリカ人類遺伝学会（ASHG）の会議に出席したマノリス・ケリス氏
生まれる	マノリス・カムヴィセリス ギリシャ語: Μανώλης Καμβυσέλλης ( 1977-03-13 )1977年3月13日（47歳） アテネ、ギリシャ
母校	マサチューセッツ工科大学（博士号）
知られている	エンコード
受賞歴	大統領科学者・技術者若手キャリア賞（2010年） NSFキャリア賞（2007） スローン研究フェローシップ（2008）
科学者としてのキャリア
フィールド	計算ゲノム科学 エピゲノミクス 比較ゲノム学[1]
論文	計算比較ゲノミクス：遺伝子、制御、進化 （2003）
博士課程の指導教員	エリック・ランダー[2] ボニー・バーガー
Webサイト	翻訳:

マノリス・ケリス（ギリシャ語：Μανώλης Καμβυσέλλης、1977年生まれ）は、マサチューセッツ工科大学（MIT）のコンピュータサイエンスと計算生物学の教授であり、 MITとハーバード大学のブロード研究所のメンバーです。^[3]彼はMITの計算生物学グループの責任者であり、 ^{[4] MITの}コンピュータサイエンスと人工知能研究所（CSAIL）の主任研究員でもあります。^[5]

ケリスは、ゲノミクス、ヒト遺伝学、エピゲノミクス、遺伝子制御、ゲノム進化、疾患メカニズム、および単一細胞ゲノミクスへの貢献で知られています。彼は、ヒトエピゲノムの包括的なマップを作成するためのNIHロードマップエピゲノミクスプロジェクト^[6]の取り組み、 ^{[7] [8] [9]}ヒトゲノムの保存要素の包括的なマップを作成するための29種の哺乳類の比較分析、^{[10] [11]}ヒトゲノムとモデル生物の遺伝子、非コード要素、および回路を特徴付けるENCODE、GENCODE、およびmodENCODEプロジェクトを共同で主導しました。 ^{[12] [13] [14]}彼の研究の主な焦点は、遺伝的変異がヒトの疾患に及ぼす影響を理解することであり、^[15]肥満、^{[16] [17] [18]}糖尿病、^[19]アルツハイマー病、^{[20] [21] [22]}統合失調症、^{[23]癌[24] の}原因となっている。

ケリスはギリシャで生まれ、12歳のときに家族とフランスに移住し、1993年に米国に移住しました。^{[25]彼はMITで}博士号を取得し、そこでブロード研究所の創設所長であるエリック・ランダーやMIT教授のボニー・バーガーと共に働きました^[26]また、コンピュータサイエンスの最高の博士論文に贈られるスプロールズ賞と^[27]最初のパリ・カネラキス大学院フェローシップを受賞しました。^{[28]計算生物学の前は、MITと}ゼロックスパロアルト研究所で人工知能、スケッチと画像認識、ロボット工学、計算幾何学に取り組んでいました。^[26]

2018年7月現在、マノリス・ケリスは187本のジャーナル論文^[29]を執筆しており、その論文は68,380回引用されています。^[1]彼は、ロードマップ・エピゲノミクス・プロジェクト、^{[30] [7]} DNA要素百科事典（ENCODE）プロジェクト、^[31]遺伝子型組織発現（GTEx）プロジェクトなど、いくつかの大規模ゲノミクス・プロジェクトの指揮に携わってきました。^[15]

ケリスはMITの大学院生として酵母種のゲノムの比較を始めました。2003年にネイチャー誌に掲載されたこの研究の一環として^[32] 、彼は近縁ゲノム間の類似点と相違点のパターンを正確に特定する計算手法を開発しました。その目的は、ヒトゲノムに適用することを視野に入れたゲノム理解手法を開発することでした。

彼は酵母からハエ、そして最終的には哺乳類へと研究対象を移し、複数の種を比較して遺伝子、その制御要素、そしてヒトの疾患における遺伝子の調節解除を研究した。^[33] ケリスはヒト、^[33]哺乳類、^{[34] [10]}ハエ、^{[35] [36]}酵母におけるいくつかの比較ゲノムプロジェクトを主導した。^[37]

ケリス氏は、ヒトエピゲノムをカタログ化するNIH政府資金プロジェクトの共同リーダーを務めた。彼はMITテクノロジーレビューのインタビューで「ゲノムが生命の書だとすれば、エピゲノムは注釈とブックマークの完全なセットだ」と述べている^{[33] 。 [33]}彼の研究室では現在、この地図を使ってヒトの基本的なプロセスと疾患の理解を深めている。

ケリスと同僚はエピゲノムデータを用いて肥満との最も強い遺伝的関連性のメカニズム的基礎を調査し、ニューイングランド医学ジャーナルに発表した。^[16]彼らはこのメカニズムがヒトとマウスの両方の脂肪細胞で機能することを示し、関連するゲノム領域内の変化がどのようにしてエネルギーを熱として消散させること（熱発生）から脂肪としてエネルギーを蓄えることへの変化を引き起こすかを詳述した。^[18]この現象を完全に理解することで、「代謝が遅い」ために体重が増えてしまう人々に対する治療法が開発される可能性がある。^[17]

MITのケリス、リ・フエイ・ツァイらは、ヒトとマウスの脳のエピゲノムマーキングを用いてアルツハイマー病を引き起こすメカニズムを研究し、2015年にネイチャー誌に発表した。 ^[20]彼らは、この病気と長い間関連づけられてきた免疫細胞の活性化と炎症は、一部の研究者が主張するように、単に神経変性の結果ではないことを示した。むしろ、アルツハイマー病のような症状を発症するように設計されたマウスでは、神経の変化が観察される前に免疫細胞が変化し始めることを発見した。^[21]

ケリス研究室は、多数の死後ヒト脳を単一細胞解像度でプロファイリングし、遺伝的差異や疾患表現型に関連する個人間の差異を研究しており、アルツハイマー病の初の単一細胞トランスクリプトーム解析（Nature、2019年）、単一

ケリスは、疾患素因の基礎を解明することを目指す遺伝子型組織発現（GTEx）プロジェクトのメンバーである。これはNIHが後援するプロジェクトであり、糖尿病、心臓病、癌に関与するヒト組織の遺伝的変異を特徴づけることを目指している。^[15]

ケリスは、強化GTEx（eGTEx）コンソーシアムの主任研究員でもあり、複数のヒト組織にわたる調節要素のエピゲノム変化とRNA転写物のエピトランスクリプトーム変化を研究している。^[38]

現在までに、彼の研究室は肥満、^[17]、糖尿病、^{[ 19]、}アルツハイマー病、 [20]、統合失調症、^[23]、心臓病、^[39]、ALSおよびFTLD、^[40]、癌^{[24]における特定の領域の専門知識を開発してきました。}

研究に加えて、ケリスは数年間にわたり、ロン・リベスト教授、エリック・デメイン教授、ピオトル・インディク教授、スリニヴァス・デヴァダス教授らと共同 で、MITの学部必修アルゴリズム入門コース6.006:アルゴリズム入門と6.046:アルゴリズムの設計と分析^{[41] [42]を教鞭を}執った。

彼はまた、MITで「計算生物学：ゲノム、ネットワーク、進化」というタイトルの計算生物学コースを教えています。 ^[43]このコース（6.047/6.878）は、計算生物学のアルゴリズムと機械学習の基礎を学び、この分野の実践者になるために最新の研究の最前線に触れることを目指す、上級学部生と初期の大学院生を対象としています。^[44]彼は、6.881：計算パーソナルゲノミクス：完全なゲノムの理解と、6.883/9.S99：神経ゲノミクス：計算分子神経科学を開始しました。このコースは、個人間の配列の違いが遺伝子発現、疾患素因、治療への反応などの表現型の違いにどのようにつながるかを解釈することに関連する計算上の課題を探ることを目的としています。^[45]

ケリスは、米国大統領若手科学者・技術者賞（PECASE）^[46] 、国立科学財団CAREER賞^[47]、スローン研究フェローシップ[ ^48]、メンデル講演委員会による科学における優れた業績に対するグレゴール・メンデル賞、アテネ情報技術（AIT）科学技術ニキ賞^[49]、ルース・アンド・ジョエル・スピラ教育賞^[50]、MITのコンピュータサイエンスにおける最優秀博士論文に対するジョージ・M・スプロールズ賞^[27]を受賞した。比較ゲノミクスの研究により、テクノロジーレビューの35歳未満のトップ35イノベーターの一人に選ばれた^[51]。

• ゲノム革命の解読、 TEDx ケンブリッジ、2013 「MIT の計算生物学者マノリス・ケリスは、未来の医師の診察の様子を垣間見せ、自身の遺伝子変異を用いて、ゲノム革命がいかにして私たちが知っている医療を一変させる治療法を解き放っているかを示しています。」^[52]
• 複雑な疾患の調節ゲノム学とエピゲノム学、ウェルカム・トラスト、2014年「マノリス・ケリス、マサチューセッツ工科大学（米国）が、ケンブリッジ大学チャーチル・カレッジのウェルカム・ゲノム・キャンパス上級コースおよび科学会議チームが主催する「一般的な疾患のエピゲノム学」（2014年10月28日～31日）で基調講演を行った^[53]
• Manolis Kellis Reddit Ask Me Anything (AMA)、Reddit Science AMA シリーズ: 「私は MIT のコンピューター サイエンスの教授、Manolis Kellis です。肥満、アルツハイマー病、がん、その他の病気の原因を解明するためにヒトゲノムを研究しています。コンピューター バイオとエピゲノミクス、そしてそれらが人間の健康に及ぼす影響について AMA します。」