ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| MYCBP2 |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オルソログ検索: PDBe RCSB |
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| 識別子 |
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| エイリアス | MYCBP2、PAM、Myc-bp2、Phr、MYC 結合タンパク質 2、E3 ユビキチンタンパク質リガーゼ、PHR1、MYC 結合タンパク質 2 |
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| 外部ID | オミム:610392; MGI : 2179432;ホモロジーン:9005;ジーンカード:MYCBP2; OMA :MYCBP2 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 14番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 14 E2.3|14 51.79 cM | 始める | 103,350,847 bp [2] |
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| 終わり | 103,584,250 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - ブロードマン領域23
- 中側頭回
- 毛包
- 視床の外側核群
- ブロードマン領域10
- 正面ポール
- 小脳虫部
- 乳首
- 橋
- 緻密部
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| | トップの表現 | - 腹内側核
- 前扁桃体領域
- 内側膝状体
- 外側視床下部
- 外側中隔核
- 視床下部室傍核
- 乳頭体
- 外側膝状体
- 腹側被蓋野
- 内側背核
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | 
 | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- タンパク質結合
- 金属イオン結合
- トランスフェラーゼ活性
- グアニルヌクレオチド交換因子活性
- 亜鉛イオン結合
- タンパク質ホモ二量体化活性
- ユビキチンタンパク質リガーゼ活性
| | 細胞成分 |
- 膜
- 核
- 細胞質
- 細胞骨格
- 微小管細胞骨格
- 軸索
- 細胞投影
- 細胞内膜で囲まれた細胞小器官
| | 生物学的プロセス |
- 転写の調節、DNAテンプレート
- タンパク質のユビキチン化
- 転写、DNAテンプレート
- 運動ニューロン軸索誘導
- 鰓運動ニューロン軸索誘導
- 中枢神経系投射ニューロン軸索形成
- タンパク質の局在の制御
- タンパク質分解過程の負の調節
- ニューロンの分化に関わる細胞形態形成
- 神経筋プロセス
- 細胞骨格組織の調節
- 軸索誘導の調節
- タンパク質ユビキチン化の正の制御
- 遺伝子発現の概日リズム調節
- リズミカルなプロセス
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| ウィキデータ |
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おそらくE3ユビキチンタンパク質リガーゼMYCBP2は、 myc結合タンパク質2またはmycと関連するタンパク質(PAM)としても知られ、ヒトではMYCBP2遺伝子によってコードされる酵素です。[5] [6]
構造
PAMにはN末端 ロイシンジッパー、中央MYC結合、C末端 ヒストン結合タンパク質相同ドメインが含まれています。[5]
インタラクション
MYCBP2はMycと相互作用することが示されている。[5]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000005810 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000033004 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ abc Guo Q, Xie J, Dang CV, Liu ET, Bishop JM (1998年9月). 「RCC1様リピートを含む大きなMyc結合タンパク質の同定」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 95 (16): 9172–7. Bibcode :1998PNAS...95.9172G. doi : 10.1073/pnas.95.16.9172 . PMC 21311 . PMID 9689053.
- ^ 「Entrez Gene: MYCBP2 MYC 結合タンパク質 2」。
さらに読む
- 中島大輔、岡崎直人、山川英、菊野理、大原央、永瀬哲也 (2002) 「KIAA 遺伝子の発現準備が整った cDNA クローンの構築: 330 個の KIAA cDNA クローンの手動キュレーション」。DNA研究所9 (3): 99-106。土井:10.1093/dnares/9.3.99。PMID 12168954。
- 永瀬 孝文、石川 健、須山 正之、菊野 亮、広沢 正之、宮島 直樹、田中 明、小谷 秀、野村 直、小原 修 (1998)。「未確認ヒト遺伝子のコード配列の予測。XII. 試験管内で巨大タンパク質をコードする脳由来の100個の新しいcDNAクローンの完全配列」。DNA Res . 5 (6): 355–64. doi : 10.1093/dnares/5.6.355 . PMID 10048485。
- Zhang QH、Ye M、Wu XY、Ren SX、Zhao M、Zhao CJ、Fu G、Shen Y、Fan HY、Lu G、Zhong M、Xu XR、Han ZG、Zhang JW、Tao J、Huang QH、Zhou J、Hu GX、Gu J、Chen SJ、Chen Z (2000)。「CD34+造血幹細胞/前駆細胞で発現する、これまで未定義だった300遺伝子のオープンリーディングフレームを持つcDNAのクローニングと機能解析」。Genome Res . 10 (10): 1546–60. doi :10.1101/gr.140200. PMC 310934. PMID 11042152 。
- Murthy V、Han S、Beauchamp RL、Smith N、Haddad LA、Ito N、Ramesh V (2004)。「Pam とその相同遺伝子である highwire は TSC1.TSC2 複合体と相互作用し、負に制御する可能性がある」。J . Biol. Chem . 279 (2): 1351–8. doi : 10.1074/jbc.M310208200 . PMID 14559897。
- Brandenberger R、Wei H、Zhang S、Lei S、Murage J、Fisk GJ、Li Y、Xu C、Fang R、Guegler K、Rao MS、Mandalam R、Lebkowski J、Stanton LW (2004)。「トランスクリプトーム特性評価により、ヒト ES 細胞の成長と分化を制御するシグナル伝達ネットワークが解明」Nat. Biotechnol . 22 (6): 707–16. doi :10.1038/nbt971. PMID 15146197. S2CID 27764390.
- Pierre SC、Häusler J 、Birod K、Geisslinger G、Scholich K (2004)。「PAM はスフィンゴシン-1-リン酸による cAMP シグナル伝達の持続的阻害を媒介する」。EMBO J. 23 (15): 3031–40. doi :10.1038/sj.emboj.7600321. PMC 514936. PMID 15257286 。
- Beausoleil SA、Jedrychowski M、Schwartz D、Elias JE、Villén J、Li J、Cohn MA、Cantley LC、Gygi SP (2004)。「HeLa 細胞核リン酸化タンパク質の大規模特性評価」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 101 ( 33 ): 12130–5。Bibcode : 2004PNAS..10112130B。doi : 10.1073/ pnas.0404720101。PMC 514446。PMID 15302935。
- Jin J、Smith FD、Stark C、Wells CD、Fawcett JP、Kulkarni S、Metalnikov P、O'Donnell P、Taylor P、Taylor L、Zougman A、Woodgett JR、Langeberg LK、Scott JD、Pawson T (2004)。「細胞骨格調節と細胞組織化に関与する生体内14-3-3結合タンパク質のプロテオーム、機能、およびドメインベースの分析」。Curr . Biol . 14 (16): 1436–50。Bibcode : 2004CBio ...14.1436J。doi : 10.1016/j.cub.2004.07.051。PMID 15324660。
- Gao X、Patel TB (2005)。「Myc に関連するタンパク質のヒスチジン残基 912 および 913 は、アデニル酸シクラーゼ活性の阻害に必要である」。Mol . Pharmacol . 67 (1): 42–9. doi :10.1124/mol.104.005355. PMID 15470080. S2CID 6049319。
- Benzinger A、Muster N、Koch HB、Yates JR、Hermeking H (2005)。「がんにおいて一般的にサイレンシングされる p53 エフェクター、14-3-3 シグマの標的プロテオーム解析」。Mol . Cell. Proteomics . 4 (6): 785–95. doi : 10.1074/mcp.M500021-MCP200 . PMID 15778465。
- Olsen JV、Blagoev B、Gnad F、Macek B、Kumar C、Mortensen P、Mann M (2006)。「シグナル伝達ネットワークにおける全体的、生体内、および部位特異的なリン酸化ダイナミクス」。Cell . 127 (3): 635–48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983。
- Ewing RM、Chu P、Elisma F、Li H、Taylor P、Climie S、McBroom-Cerajewski L、Robinson MD、O'Connor L、Li M、Taylor R、Dharsee M、Ho Y、Heilbut A、Moore L、Zhang S、Ornatsky O、Bukhman YV、Ethier M、Sheng Y、Vasilescu J、Abu-Farha M、Lambert JP、Duewel HS、Stewart II、Kuehl B、Hogue K、Colwill K、Gladwish K、Muskat B、Kinach R、Adams SL、Moran MF、Morin GB、Topaloglou T、Figeys D (2007)。「質量分析法によるヒトタンパク質間相互作用の大規模マッピング」。Mol . Syst. Biol . 3 (1): 89. doi :10.1038/msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931 .