| メド15 |
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| 利用可能な構造物 |
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| PDB | オルソログ検索: PDBe RCSB |
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| 識別子 |
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| 別名 | MED15、ARC105、CAG7A、CTG7A、PCQAP、TIG-1、TIG1、TNRC7、メディエーター複合体サブユニット15 |
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| 外部ID | オミム: 607372 ; MGI : 2137379 ;ジーンカード: MED15 ; OMA : MED15 - オルソログ |
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| RNA発現パターン |
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| Bgee | | 人間 | マウス(相同体) |
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| トップは | - 腓腹神経
- 顆粒球
- 左副腎
- 右副腎
- 左副腎皮質
- 左肺上葉
- 膝窩動脈
- 脛骨動脈
- 右副腎皮質
- 子宮体部
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| | トップは | - 接合子
- 二次卵母細胞
- 生殖器結節
- 胚の尾
- 上前頭回
- 網膜の神経層
- 一次視覚野
- 海馬歯状回顆粒細胞
- 顆粒球
- リップ
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| | より多くの参照発現データ |
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| バイオGPS |  | | より多くの参照発現データ |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 | | | 細胞成分 | | | 生物学的プロセス | - RNAポリメラーゼIIによる転写の調節
- RNAポリメラーゼIIプロモーターからの転写開始
- 転写の調節、DNA鋳型
- 転写、DNA鋳型
- 幹細胞集団の維持
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| アントレ | | |
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| アンサンブル | | |
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| UniProt | | |
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| RefSeq(mRNA) | | NM_001003891 NM_001293234 NM_001293235 NM_001293236 NM_001293237 |
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NM_015889 |
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NM_001040683 NM_001285884 NM_001285886 NM_033609 NM_001358404 |
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| RefSeq(タンパク質) | | NP_001003891 NP_001280163 NP_001280164 NP_001280165 NP_001280166 |
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NP_056973 |
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NP_001035773 NP_001272813 NP_001272815 NP_001345333 NP_291087 |
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| 所在地(UCSC) | Chr 22: 20.5 – 20.59 Mb | Chr 16: 17.47 – 17.55 MB |
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| PubMed検索 | [ 3 ] | [ 4 ] |
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| ウィキデータ |
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RNAポリメラーゼII転写サブユニット15のメディエーター(酵母では Gal11、Spt13、ヒトではPCQAP、ARC105、TIG-1としても知られる)は、 MED15遺伝子によってコードされるタンパク質である。[ 5 ]
関数
MED15は、 RNAポリメラーゼII依存性転写に関与するメディエーター複合体の一般的な転写補因子であり、元々はGal11およびSpt13と呼ばれ、T.FukasawaおよびF.Winston研究室によって酵母においてGal4依存性転写活性化の必須因子として発見された。転写因子Gcn4、Pho4、Msn2、Ino2、Gal4ファミリーのメンバー(Gal4)、Oaf1、Pdr1、およびウイルスVP16が酵母MED15と相互作用することが報告されている。[ 6 ]
これらの転写因子のほとんどは、 MED15のKIXドメインと直接相互作用する同じ転写活性化ドメイン9aaTADを共有している。 [ 7 ]
さらに、ヒトMED15は、VP16やSREBPなどの転写因子とともにメディエーター複合体(以前はPC2、ARC、またはDRIPとして知られていた)で協力します 。ヒトSREBPはステロール応答性遺伝子発現を調節し、この調節作用は遺伝学的モデル生物である線虫C. elegans (相同体MDT-15およびSBP-1)でも保存されています。C . elegansでも、MDT-15はいくつかのストレス(絶食、重金属、毒素、酸化ストレス)への応答に必須であり、少なくとも部分的には、MDT-15とNHR-49を含む核内受容体との相互作用によって絶食応答がもたらされます。 [ 5 ]
遺伝子
MED15遺伝子はトリヌクレオチド反復配列を含み、ディジョージ症候群で欠失する22番染色体領域に位置している。この遺伝子には、異なるアイソフォームをコードする2つの転写バリアントが見つかっている。[ 5 ]
参考文献
- 1 2 3 GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000099917 – Ensembl、2017年5月
- 1 2 3 GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000012114 – Ensembl、2017年5月
- ↑ 「ヒトPubMed参照:」。米国国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ↑ 「マウス PubMed 参照:」。米国国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- 1 2 3 "Entrez Gene: PCQAP PC2 (正の補因子 2、多タンパク質複合体) グルタミン/Q リッチ関連タンパク質"。
- ↑鈴木 裕、野木 裕、阿部 明、深澤 徹 (1988 年 11 月)。 「GAL11 タンパク質、サッカロミセス セレビシエのガラクトース代謝酵素をコードする遺伝子の補助転写活性化因子」。分子細胞生物学。8 ( 11): 4991–9。doi : 10.1128 / mcb.8.11.4991。PMC 365593。PMID 3062377。 ; Fassler JS、Winston F (1989 年 12月)。「Saccharomyces cerevisiae の SPT13/GAL11 遺伝子は転写において正と負の両方の調節的役割を持つ」。Molecular and Cellular Biology。9 ( 12 ) : 5602–9。doi : 10.1128 / mcb.9.12.5602。PMC 363730。PMID 2685570。 ; Swanson MJ、Qiu H、Sumibcay L、Krueger A、Kim SJ、Natarajan K、Yoon S、Hinnebusch AG (2003 年 4 月)。「 Gcn4pは生体内の個々のプロモーターで複数の共活性化因子を必要とする」。Molecular and Cellular Biology。23 ( 8): 2800–20。doi : 10.1128 / MCB.23.8.2800-2820.2003。PMC 152555。PMID 12665580。 ; Bryant GO、Ptashne M (2003 年 5 月)。 「Gal4による転写に必要な 2つの複合体の生体内での独立したリクルート」。Molecular Cell。11 ( 5): 1301–9。doi : 10.1016/S1097-2765(03) 00144-8。PMID 12769853。 Jedidi I、Zhang F、Qiu H、Stahl SJ、Palmer I、Kaufman JD、Nadaud PS、Mukherjee S、Wingfield PT、Jaroniec CP、Hinnebusch AG (2010年1月) 「活性化因子Gcn4は、KIXドメインを含むMed15/Gal11の複数のセグメントを利用して、生体内で標的遺伝子にメディエーターをリクルートする」。The Journal of Biological Chemistry。285 ( 4): 2438–55。doi : 10.1074 / jbc.M109.071589。PMC 2807301。PMID 19940160。 ; Thakur JK、Arthanari H、Yang F、Chau KH、Wagner G、Näär AM (2009年2月)。「メディエーターサブユニットGal11p/MED15は、酵母転写因子Oaf1pによる脂肪酸依存性遺伝子活性化に必要である」。The Journal of Biological Chemistry。284 ( 7) : 4422–8。doi : 10.1074 / jbc.M808263200。PMC 3837390。PMID 19056732。
- ↑ Piskacek S、Gregor M 、 Nemethova M、Grabner M、Kovarik P、Piskacek M ( 2007年6月) 。 「 9アミノ酸転写活性化ドメイン:確立と予測有用性」。Genomics。89 ( 6): 756–68。doi : 10.1016/ j.ygeno.2007.02.003。PMID 17467953。 ; Piskacek M (2009年11月) 「共通転写活性化モチーフ9aaTADは、複数の一般的な共活性化因子TAF9、MED15、CBP、およびp300をリクルートする」 Nature Precedings . doi : 10.1038/npre.2009.3488.2 .; Thakur JK、Arthanari H、Yang F、Chau KH、Wagner G、Näär AM (2009年2月)。「メディエーターサブユニットGal11p/MED15は、酵母転写因子Oaf1pによる脂肪酸依存性遺伝子活性化に必要である」。The Journal of Biological Chemistry。284 ( 7) : 4422–8。doi : 10.1074 / jbc.M808263200。PMC 3837390。PMID 19056732。 ; Piskacek M (2009年11月). "9aaTAD予測結果(2006)" . Nature Precedings . doi : 10.1038/npre.2009.3984.1 .; Piskacek M (2009年11月) 「共通転写活性化モチーフ9aaTADは、複数の一般的な共活性化因子TAF9、MED15、CBP、およびp300をリクルートする」 Nature Precedings . doi : 10.1038/npre.2009.3488.2 .; Piskacek M (2009年11月) 「9aaTADsはDNAを模倣してMed15の擬似DNA結合ドメインKIX(分子カメレオン)と相互作用する」 Nature Precedings . doi : 10.1038/npre.2009.3939.1 .
さらに読む
- Taubert S、Hansen M、Van Gilst MR、Cooper SB、Yamamoto KR (2008年2月)。Mango SE (編) 「メディエーターサブユニットMDT-15は摂取物質への代謝適応をもたらす」 PLOS Genetics 4 ( 2) e1000021. doi : 10.1371/journal.pgen.1000021 . PMC 2265483 . PMID 18454197 .

- Margolis RL、Abraham MR、Gatchell SB、Li SH、Kidwai AS、Breschel TS、Stine OC、Callahan C、McInnis MG、Ross CA (1997年7月)「ヒト脳由来の長いCAGトリヌクレオチド反復配列を持つcDNA」Human Genetics . 100 (1): 114–22 . doi : 10.1007/s004390050476 . PMID 9225980. S2CID 25999127 .
- Näär AM 、 Beaurang PA、Zhou S、Abraham S、Solomon W、Tjian R (1999年4月)。「複合共活性化因子ARCはクロマチン指向性転写活性化を媒介する」。Nature。398 ( 6730 ) : 828–32。Bibcode : 1999Natur.398..828N。doi : 10.1038 / 19789。PMID 10235267。S2CID 23646963。
- Taubert S、Van Gilst MR、Hansen M、Yamamoto KR (2006 年 5 月)。「メディエーターサブユニット MDT-15 は、C. elegans において NHR-49 依存性および非依存性経路による脂肪酸代謝の調節を統合する」。Genes & Development。20 ( 9 ) : 1137–49。doi : 10.1101 / gad.1395406。PMC 1472473。PMID 16651656。
- Abraham S、Solomon WB (2000年9月)「胎盤および骨髄組織で優先的に発現する新規グルタミンリッチ推定転写アダプタータンパク質(TIG-1)」Gene.255 ( 2): 389–400.doi : 10.1016 / S0378-1119 ( 00)00292-4.PMID 11024300 .
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- デ・ルーカ A、コンティ E、グリフォーネ N、アマティ F、スパレッタ G、カルタジローネ C、ボナヴィリ G、パジーニ A、ジェンナレッリ M、ステファノ B、ベルティ L、ミトラー G、マイスターンスト M、ダラピッコラ B、ノヴェッリ G (2003 年 1 月)。 「PCQAP遺伝子(PC2グルタミン/Qリッチ関連タンパク質)のCAGトリヌクレオチドリピートと統合失調症との関連研究」。American Journal of Medical Genetics パート B。116B (1): 32–5 .土井: 10.1002/ajmg.b.10008。PMID 12497610。S2CID 28657663。
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