ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| マーク2 |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オルソログ検索: PDBe RCSB |
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| 識別子 |
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| エイリアス | MARK2、EMK-1、EMK1、PAR-1、Par-1b、Par1b、微小管親和性調節キナーゼ 2 |
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| 外部ID | オミム:600526; MGI : 99638;ホモロジーン:69013;ジーンカード: MARK2; OMA :MARK2 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 19番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 19 A|19 5.32 cM | 始める | 7,252,761 bp [2] |
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| 終わり | 7,319,225 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 顆粒球
- 腹部の皮膚
- 横行結腸粘膜
- 脚の皮膚
- 単球
- 直腸
- 小唾液腺
- ランゲルハンス島
- 小脳の右半球
- 心の頂点
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| | トップの表現 | - 回腸上皮
- 受精卵
- 角膜実質
- 舌の上側
- CA3フィールド
- 乳腺
- 左心室の心筋組織
- 顆粒球
- 足底筋
- 二次卵母細胞
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- トランスフェラーゼ活性
- ヌクレオチド結合
- タンパク質キナーゼ活性
- タンパク質キナーゼ活性化因子活性
- 金属イオン結合
- キナーゼ活性
- タンパク質セリン/スレオニンキナーゼ活性
- タウタンパク質キナーゼ活性
- タンパク質結合
- ATP結合
- マグネシウムイオン結合
- 脂質結合
- RNA結合
- カドヘリン結合
- タウタンパク質結合
| | 細胞成分 |
- 微小管束
- 細胞質
- 側方細胞膜
- 膜
- 細胞膜
- ミトコンドリア
- アクチンフィラメント
- 細胞骨格
- 核質
- 樹状突起
- 細胞投影
| | 生物学的プロセス |
- 細胞分化
- 細胞内シグナル伝達
- リン酸化
- ミトコンドリアの局在
- ニューロンの移動
- Wntシグナル伝達経路
- 軸索形成の調節
- 多細胞生物の発達
- タンパク質リン酸化
- ミトコンドリアのオートファジー
- 上皮細胞の頂端/基底極性の確立または維持
- ニューロン投射発達の正の調節
- タンパク質の自己リン酸化
- ペプチジルスレオニンリン酸化
- タンパク質キナーゼ活性の活性化
- 細胞骨格組織の調節
- 細胞極性の確立
- 微小管細胞骨格組織
- ペプチジルセリンリン酸化
- 軸索の発達
- 微小管細胞骨格組織の制御
- 細胞極性の確立または維持、細胞形状の調節
- 微小管結合の調節
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_001039469 NM_001163296 NM_001163297 NM_004954 NM_017490 |
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NM_001080388 NM_001080389 NM_001080390 NM_007928 |
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| RefSeq (タンパク質) | |
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NP_001034558 NP_001156768 NP_001156769 NP_004945 NP_059672 |
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NP_001073857 NP_001073858 NP_001073859 NP_031954 |
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| 場所 (UCSC) | 11 章: 63.84 – 63.91 Mb | 19章: 7.25 – 7.32 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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セリン/スレオニンタンパク質キナーゼMARK2は、ヒトではMARK2遺伝子によってコードされる酵素である。[5] [6] [7]
関数
EMK (ELKL モチーフキナーゼ) は、細胞極性、微小管安定性、および癌の制御に関与する ser/thrタンパク質キナーゼの小さなファミリーです。ヒト ser/thr タンパク質キナーゼ EMK1 の 2 つのアイソフォームをコードする cDNA クローンがいくつか分離されています。これらのアイソフォームは、162 bp の代替エクソンの存在を特徴としており、このエクソンを含むものとエクソンを欠くものの 2 つのフォームが生じます。両方のフォームは、いくつかの選択された細胞株および組織サンプルで共発現していることがわかりました。ヒト EMK1 は、普遍的に発現する単一の mRNA によってコードされていることが示されました。[7]
インタラクション
MARK2はAKT1と相互作用することが示されている。[8]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000072518 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000024969 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Espinosa L、Navarro E (1998年10月)。「ヒトセリン/スレオニンタンパク質キナーゼEMK1:選択的スプライシングによって生成されるアイソフォームのゲノム構造とcDNAクローニング」。Cytogenet Cell Genet。81 ( 3–4): 278–82。doi :10.1159/ 000015046。PMID 9730619。S2CID 46869824 。
- ^ Navarro E (1999年10月). 「配列相同性検索による染色体バンド11q13のヒトEMK1遺伝子へのD11S1226の正確な位置特定」Cytogenet Cell Genet . 86 (1): 66–7. doi :10.1159/000015413. PMID 10516437. S2CID 26642331.
- ^ ab 「Entrez Gene: MARK2 MAP/微小管親和性調節キナーゼ2」。
- ^ Dickey CA、Koren J、Zhang YJ、Xu YF、Jinwal UK、Birnbaum MJ、Monks B、Sun M、Cheng JQ、Patterson C、Bailey RM、Dunmore J、Soresh S、Leon C、Morgan D、Petrucelli L (2008 年 3 月)。「Akt と CHIP は協調的な相互作用を通じてタウの分解を共制御する」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA 105 ( 9): 3622–7。Bibcode : 2008PNAS..105.3622D。doi : 10.1073 / pnas.0709180105。PMC 2265134。PMID 18292230。
さらに読む
- Courseaux A、Fernandes M、Grosgeorge J、Inglis J、Raynaud SD、Gaudray P (1995)。「ヒトEMK1は11q12-q13に位置し、COX8とFTH1に近い」。Mamm . Genome . 6 (4): 311–2. doi :10.1007/BF00352433. PMID 7613050. S2CID 37616665.
- Maruyama K, Sugano S (1994). 「オリゴキャッピング:真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置き換える簡単な方法」Gene . 138 (1–2): 171–4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Schultz SJ、Nigg EA (1994)。「Aspergillus nidulans の細胞周期調節因子 nimA に関連するファミリーの 3 つのメンバーを含む、21 種類の新規ヒトタンパク質キナーゼの同定」。Cell Growth Differ。4 ( 10): 821–30。PMID 8274451 。
- Bonaldo MF、Lennon G、Soares MB (1997)。「正規化と減算: 遺伝子発見を容易にする 2 つのアプローチ」。Genome Res . 6 (9): 791–806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548。
- Courseaux A、Grosgeorge J、Gaudray P、Pannett AA、Forbes SA、Williamson C、Bassett D、Thakker RV、Teh BT、Farnebo F、Shepherd J、Skogseid B、Larsson C、Giraud S、Zhang CX、Salandre J、Calender A (1997)。「近位 11q13 の 5-Mb 統合マップに基づく最小 MEN1 候補領域の定義。欧州 Men1 コンソーシアム (GENEM 1、Groupe d'Etude des Néoplasies Endocriniennes Multiples de type 1)」。Genomics。37 ( 3 ) : 354–65。doi :10.1006/geno.1996.0570。PMID 8938448 。
- Drewes G、Ebneth A、Preuss U、Mandelkow EM 、 Mandelkow E (1997)。「MARK、微小管関連タンパク質をリン酸化して微小管破壊を引き起こす新しいタンパク質キナーゼファミリー」。Cell。89 ( 2 ) : 297–308。doi : 10.1016/S0092-8674(00) 80208-1。PMID 9108484。S2CID 15647848 。
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). 「全長濃縮cDNAライブラリーおよび5'末端濃縮cDNAライブラリーの構築と特性評価」. Gene . 200 (1–2): 149–56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
- Sun TQ、Lu B、Feng JJ、Reinhard C、Jan YN、Fantl WJ、Williams LT (2001)。「PAR-1 は Dishevelled 関連キナーゼであり、Wnt シグナル伝達の正の調節因子である」。Nat . Cell Biol . 3 (7): 628–36. doi :10.1038/35083016. PMID 11433294. S2CID 1128604.
- Brajenovic M、Joberty G、Küster B、Bouwmeester T、Drewes G (2004)。「ヒト Par タンパク質複合体の包括的なプロテオーム解析により、相互接続されたタンパク質ネットワークが明らかになりました」。J . Biol. Chem . 279 (13): 12804–11. doi : 10.1074/jbc.M312171200 . PMID 14676191。
- バウミースター T、バウハ A、ラフナー H、アングランド PO、ベルガミニ G、クロートン K、クルシア C、エバーハルト D、ガグヌール J、ギデリ S、ホップ C、ヒューセ B、マンガーノ R、ミション AM、シルル M、シュレーグル J、シュワブ M 、スタイン MA、バウアー A、カサリ G、ドリューズ G、ギャビン AC、ジャクソン DB、ジョバティG、ノイバウアー G、リック J、クスター B、スーパーティフルガ G (2004)。 「ヒト TNF-α/NF-κ B シグナル伝達経路の物理的および機能的マップ」。ナット。セルバイオル。6 (2): 97-105。土井:10.1038/ncb1086。PMID 14743216。S2CID 11683986 。
- リスカノ JM、ゴランソン O、トス R、ディーク M、モーリス NA、ブードー J、ホーリー SA、ウッド L、マケラ TP、ハーディ DG、アレッシ DR (2005)。 「LKB1 は、MARK/PAR-1 を含む、AMPK サブファミリーの 13 個のキナーゼを活性化するマスター キナーゼです。」エンボ J . 23 (4): 833-43。土井:10.1038/sj.emboj.7600110。PMC 381014。PMID 14976552。
- Hueso M、Beltran V、Moreso F、Ciriero E、Fulladosa X、Grinyó JM、Serón D、Navarro E (2004)。「ヒト腎移植におけるスプライシングの変化:移植患者のプロトコル生検における炎症の増加と関連する発現を示すタンパク質キナーゼ Par1/Emk1 の新しいスプライスバリアントの検出」。Biochim . Biophys. Acta . 1689 (1): 58–65. doi :10.1016/j.bbadis.2004.01.008. PMID 15158914。
- Beausoleil SA、Jedrychowski M、Schwartz D、Elias JE、Villén J、Li J、Cohn MA、Cantley LC、Gygi SP (2004)。「HeLa 細胞核リン酸化タンパク質の大規模特性評価」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 101 ( 33 ): 12130–5。Bibcode : 2004PNAS..10112130B。doi : 10.1073/ pnas.0404720101。PMC 514446。PMID 15302935。
- Suzuki A, Hirata M, Kamimura K, Maniwa R, Yamanaka T, Mizuno K, Kishikawa M, Hirose H, Amano Y, Izumi N, Miwa Y, Ohno S (2004). 「aPKC は哺乳類上皮極性の確立と維持の両方において PAR-1b の上流で作用する」Curr. Biol . 14 (16): 1425–35. Bibcode :2004CBio...14.1425S. doi : 10.1016/j.cub.2004.08.021 . PMID 15324659. S2CID 293494.
- Cohen D, Rodriguez-Boulan E, Müsch A (2004). 「Par-1 は MDCK 細胞における肝モードの頂端タンパク質輸送を促進する」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 101 (38): 13792–7. Bibcode :2004PNAS..10113792C. doi : 10.1073/pnas.0403684101 . PMC 518835 . PMID 15365179.
- Hazarika P、McCarty MF、Prieto VG、George S、Babu D、Koul D、Bar-Eli M、Duvic M (2004)。「Flotillin-2 の上方制御はメラノーマの進行と関連しており、トロンビン受容体プロテアーゼ活性化受容体 1 の発現を調節する」。Cancer Res . 64 (20): 7361–9. doi : 10.1158/0008-5472.CAN-04-0823 . PMID 15492257。