汚染された細胞株のリスト

生物医学研究に広く使用されている細胞株の多くは、他のより攻撃的な細胞によって増殖し過ぎています。たとえば、甲状腺細胞株と思われていたものが実は黒色腫細胞であったり、前立腺組織と思われていたものが実は膀胱がんであったり、正常な子宮培養物と思われていたものが実は乳がんであったりします。^{[1]これは、他}の細胞によって交差汚染され増殖し過ぎた細胞株の一覧です。白血病リンパ腫細胞株のスクリーニングに基づく推定では、これらの細胞株の約 15% が通常想定されているものを代表するものではないことが示唆されています。^[2]現在、誤った帰属による研究上の誤りを回避するために、汚染された細胞株を列挙して名前を変更するプロジェクトが進行中です。^[3]^[4]^[a]

汚染された細胞株は、その真の性質が知られずに研究に広く利用されてきました。たとえば、内皮細胞ECV-304 や巨核球DAMI 細胞株に関する研究のほとんど、あるいはすべてが、実際にはそれぞれ膀胱癌細胞や赤白血病細胞で行われてきました。したがって、これらの細胞株を使用した内皮細胞や巨核球特有の機能に関する研究はすべて誤ったものでした。

細胞株が汚染される主な方法は 2 つあります。細胞培養は研究グループ間で頻繁に交換されます。取り扱い中にサンプルが汚染されてから渡されると、その後の細胞交換で汚染集団が確立されますが、想定される細胞株の一部は依然として本物です。より深刻なのは、発生源での汚染です。元の細胞株の確立中に、汚染細胞が誤って培養物に持ち込まれ、やがて目的の細胞よりも増殖してしまいます。この場合、最初のテストでは細胞株が本物で新しいものであることが示唆されますが、実際には確立後すぐに消えてしまい、そのような細胞株のすべてのサンプルが実際に汚染細胞です。細胞株が汚染された正確な場所を特定するには、長い調査が必要です。汚染と評価された混乱は、実際には 2 つの細胞株の単なる混同である可能性がありますが、通常は汚染が想定されます。^{[引用が必要]}

細胞株が汚染されていることが判明すると、通常、その細胞株は、想定されていた特定の種類の細胞株であることが求められる研究には二度と使用されません。汚染された細胞株のほとんどは廃棄されますが、汚染細胞が新しい特性を獲得し (例えば、突然変異やウイルスによるトランスフェクションにより、例えばHeLa由来の Det98)、真に新しい系統を構成する場合があるため、廃棄されることはありません。細胞株が汚染されていると考えられる場合、通常は真正性について検査されます。^[b] HeLa 細胞の広範な汚染は、光学顕微鏡下での単純なギムザ染色核型分析により、 Walter Nelson-Reesによって最初に認識されました。この技術は、これらの細胞が特徴的な染色体異常を有するため、HeLa 細胞を認識するのに有効です。新しい細胞株は増殖され、確立後できるだけ早くATCCなどの保管施設に配布および/または寄託され、細胞株が汚染によって損なわれる可能性を最小限に抑えます。実験室環境で維持される（つまり、長期保管されない）細胞株については、その品質と完全性が維持されていることを確認するために、HeLa 細胞やその他の一般的な汚染物質による汚染がないか定期的に検査することが推奨されています。^[^{引用が必要}^]

汚染された細胞株のリスト

このリストには488個の細胞株が含まれており、2016年12月1日に最終更新されました。^[c]

Cellosaurusは「問題のある」細胞株のリストも管理しています。^[6]このリストは、データベース内のすべての細胞株から動的に生成され、「問題のある細胞株」という専用の単語を含むコメントが付けられています。2017年1月17日現在^{[アップデート]}、リストには757のエントリが含まれています。

以下の表の個々の項目に種が指定されていない場合、表の種は想定される細胞タイプと実際の細胞タイプの両方に適用されます。

以下の表で「仮想」とマークされている細胞株は、発生源での汚染が判明している例です。これらの細胞株は絶滅したか、そもそも存在していませんでした。汚染されていない細胞株が判明しているか、存在すると強く疑われる場合は、「存在」とマークされています。

汚染されたヒト細胞株

汚染された非ヒト細胞株

注記

^ 元の引用では、どちらの引用が参照されているかが不明瞭であったため、ここでは両方が追加されました。
^ この記事の引用には、一般的な汚染物質を認識する方法に関する論文がいくつか含まれています。
^ 最新のリストは国際細胞株認証委員会のウェブサイトから入手できます。^[5]

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外部リンク

Cellosaurusにおける問題のある（汚染された/誤認された）細胞株のリスト

[5] 元の引用では、どちらの引用が参照されているかが不明瞭であったため、ここでは両方が追加されました。

[6] この記事の引用には、一般的な汚染物質を認識する方法に関する論文がいくつか含まれています。

[8] 最新のリストは国際細胞株認証委員会のウェブサイトから入手できます。^[5]

[Science-1] Jill Neimark (2015年2月27日). 「攻撃のライン」. Science . 347 (6225): 938–940. Bibcode :2015Sci...347..938N. doi : 10.1126/science.347.6225.938 . PMID 25722392.

[2] Masters, John R. (2002 年 4 月). 「HeLa 細胞 50 年後: 良い点、悪い点、そして醜い点」. Nature Reviews Cancer . 2 (4): 315–319. doi :10.1038/nrc775. ISSN 1474-175X. PMID 12001993. S2CID 991019.

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[4] Drexler, Hans G.; Uphoff, Cord C.; Dirks, Willy G.; MacLeod, Roderick AF (2002-04-01). 「取り違えとマイコプラズマ：内部の敵」.白血病研究. 26 (4): 329–333. doi :10.1016/S0145-2126(01)00136-9. ISSN 0145-2126. PMID 11839374.

[7] 「交差汚染または誤認細胞株のデータベース」（PDF） iclac.org 2016年1月12日2019年5月10日閲覧。

[9] 「Cellosaurus 検索結果: 「問題のある細胞株」で 757 件ヒット」Cellosaurus .スイスバイオインフォマティクス研究所. 2018 年1 月 17 日閲覧。参照には、検索結果にリンクされたページのリストが含まれます。

[:0-10] qrstu vwxyz aa ab ac ad ae af ag ah Dirks, Wilhelm G.; MacLeod, Roderick AF; Drexler, Hans G. (1999 年 11 月). 「ECV304 (内皮細胞) は実際には T24 (膀胱癌) である: 発生源での細胞株の相互汚染」. In Vitro Cellular & Developmental Biology - Animal . 35 (10): 558–559. doi :10.1007/s11626-999-0091-8. ISSN 1071-2690. PMID 10614862. S2CID 31347874.

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