ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| LRRC8D |
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| 識別子 |
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| エイリアス | LRRC8D、LRRC5、8 つのファミリー メンバーを含むロイシン リッチ リピート D、8 つのファミリー メンバーを含むロイシン リッチ リピート D、8 つの VRAC サブユニットを含むロイシン リッチ リピート D、HsLRRC8D |
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| 外部ID | オミム:612890; MGI : 1922368;ホモロジーン: 10004;ジーンカード:LRRC8D; OMA :LRRC8D - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 5番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 5|5 E5 | 始める | 105,847,835 bp [2] |
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| 終わり | 105,980,302 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 迷走神経下神経節
- 視床下核
- 三叉神経節
- 外淡蒼球
- 延髄
- 上前庭核
- 脳梁
- 腹側被蓋野
- 歯肉上皮
- 海馬のI領域
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| | トップの表現 | - 耳石器官
- 卵形嚢
- 上頸部神経節
- 血管条
- 髄質集合管
- 三叉神経節
- 吻側回遊流
- 中央隆起
- 積雲細胞
- 前庭感覚上皮
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS |  | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 | | | 細胞成分 |
- 細胞質
- 膜の不可欠な構成要素
- 細胞膜の不可欠な構成要素
- 小胞体膜
- 膜
- 小胞体
- イオンチャネル複合体
- 細胞膜
| | 生物学的プロセス |
- 陰イオン膜輸送
- イオン輸送
- 陰イオン輸送の調節
- シグナル伝達
- 膜輸送
- 輸送
- 細胞容積恒常性
- 無機陰イオン輸送
- タウリン輸送
- アスパラギン酸膜輸送
- 浸透圧ストレスに対する細胞反応
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| ウィキデータ |
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ロイシンリッチリピート含有タンパク質8Dは、ヒトではLRRC8D遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5]研究者らは、このタンパク質が他のLRRC8タンパク質LRRC8A、LRRC8B、LRRC8C、およびLRRC8Eとともに、ヘテロマータンパク質容積制御陰イオンチャネルのサブユニットであることを発見した。[6]容積制御陰イオンチャネル(VRAC)は、塩化物イオンやタウリンやグルタミン酸などのさまざまな有機浸透圧調節物質を細胞膜を越えて輸送することにより、細胞の大きさを調節するために不可欠である。[7]これらのチャネルが関連付けられている機能はそれだけではない。
LRRC8DはVRACを構成する多くのタンパク質の1つですが、実際にはチャネルの機能にとって最も重要なサブユニットの1つです。もう1つの重要なタンパク質はLRRC8Aです。[8] [9] しかし、特定のVRAC機能に必要であることはわかっていますが、他の研究では、通常のVRAC活動の全範囲には十分ではないことがわかりました。[10]ここで、他のLRRC8タンパク質が登場します。これらのサブユニットの異なる構成がVRACの特異性の範囲に影響を与えるからです。[11] [12]
VRACにおける役割に加えて、LRRC8タンパク質ファミリーは無ガンマグロブリン血症-5とも関連している。[13]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000171492 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000046079 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「Entrez Gene: LRRC8A ロイシンリッチリピートを含む 8 ファミリー、メンバー A」。
- ^ フォス FK、ウルリッヒ F、ミュンシュ J、ラザロウ K、ルッター D、マー N、アンドラーデ=ナバロ MA、フォン クリース JP、ストウバー T、イェンシュ TJ (2014 年 5 月)。 「体積調節陰イオンチャネル VRAC の必須成分としての LRRC8 ヘテロマーの同定」(PDF)。科学。344 (6184): 634– 8. Bibcode :2014Sci...344..634V。土井:10.1126/science.1252826。PMID 24790029。S2CID 24709412 。
- ^ Jentsch TJ (2016年5月). 「細胞容積の調節などにおけるVRACとその他のイオンチャネルおよびトランスポーター」Nature Reviews Molecular Cell Biology . 17 (5): 293– 307. doi :10.1038/nrm.2016.29. PMID 27033257. S2CID 40565653.
- ^ Hyzinski-García MC、Rudkouskaya A、Mongin AA (2014 年 11 月)。「LRRC8A タンパク質はラットアストロサイトの腫脹活性化および ATP 誘導性興奮性アミノ酸放出に不可欠である」。The Journal of Physiology。592 ( 22 ): 4855– 62。doi :10.1113/ jphysiol.2014.278887。PMC 4259531。PMID 25172945。
- ^ Yamada T, Wondergem R, Morrison R, Yin VP, Strange K (2016年10月). 「ロイシンリッチリピート含有タンパク質LRRC8Aは、ゼブラフィッシュの腫脹活性化Cl-電流と胚発生に必須である」.生理学的レポート. 4 (19): e12940. doi :10.14814/phy2.12940. PMC 5064130. PMID 27688432 .
- ^ Okada T, Islam MR, Tsiferova NA, Okada Y, Sabirov RZ (2017年3月). 「容積感受性外向き整流性陰イオンチャネル(VSOR)の活性におけるLRRC8Aの特異的かつ必須だが十分ではない役割」. Channels . 11 ( 2): 109– 120. doi :10.1080/19336950.2016.1247133. PMC 5398601. PMID 27764579.
- ^ Lutter D、Ullrich F、 Lueck JC、Kempa S、Jentsch TJ(2017年3月)。「異なる容積調節LRRC8陰イオンチャネルによる神経伝達物質と調節因子の選択的輸送」。Journal of Cell Science。130(6):1122–1133。doi:10.1242/jcs.196253。PMID 28193731。
- ^ Planells-Cases R、Lutter D、Guyader C、Gerhards NM、Ullrich F、Elger DA、Kucukosmanoglu A、Xu G、Voss FK、Reincke SM、Stauber T、Blomen VA、Vis DJ、Wessels LF、Brummelkamp TR、Borst P、Rottenberg S、Jentsch TJ (2015 年 12 月)。「VRAC チャネルのサブユニット構成が基質特異性と Pt ベースの抗がん剤に対する細胞抵抗性を決定する」。EMBOジャーナル 。34 ( 24 ) : 2993– 3008。doi : 10.15252 /embj.201592409。PMC 4687416。PMID 26530471。
- ^ 澤田A、滝原裕、キムJY、松田橋井裕、時正S、藤崎H、久保田K、遠藤H、小野寺T、太田H、大園K、原J (2003年12月)。 「新規遺伝子LRRC8の先天的変異は、ヒトの無ガンマグロブリン血症を引き起こす」。臨床研究ジャーナル。112 (11): 1707–13 .土井:10.1172/JCI18937。PMC 281644。PMID 14660746。
さらに読む
- Eggermont J、Trouet D、Carton I、Nilius B (2001)。「細胞機能と容積調節陰イオンチャネルの制御」。細胞生化学および生物物理学。35 ( 3): 263– 74。doi : 10.1385 /CBB:35: 3 :263。PMID 11894846。S2CID 31821726。
- Mongin AA (2016 年 3 月). 「容積調節陰イオンチャネル - 脳内の友敵」. Pflügers Archiv . 468 (3): 421– 41. doi :10.1007/s00424-015-1765-6. PMC 4752865. PMID 26620797 .
- 永瀬 剛、菊野 亮、石川 紀、広沢 正、小原 修 (2000 年 2 月)。「未確認ヒト遺伝子のコード配列の予測。XVI。in vitro で大型タンパク質をコードする脳由来の 150 個の新しい cDNA クローンの完全な配列」。DNA 研究。7 ( 1 ): 65– 73。doi : 10.1093/dnares/7.1.65。PMID 10718198。
- Maruyama K, Sugano S (1994年1月). 「オリゴキャッピング:真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置き換える簡単な方法」. Gene . 138 ( 1–2 ): 171–4 . doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Andersson B、Wentland MA、Ricafrente JY、Liu W 、 Gibbs RA (1996 年 4 月)。「改良されたショットガン ライブラリ構築のための「ダブル アダプター」法」。Analytical Biochemistry。236 ( 1): 107– 13。doi :10.1006/ abio.1996.0138。PMID 8619474 。
- Yu W、Andersson B、Worley KC、Muzny DM、Ding Y、Liu W、Ricafrente JY、Wentland MA、Lennon G、Gibbs RA (1997 年 4 月)。「大規模連結 cDNA シーケンシング」。ゲノム研究。7 ( 4 ): 353– 8。doi :10.1101/ gr.7.4.353。PMC 139146。PMID 9110174 。
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997年10月). 「全長濃縮cDNAライブラリーおよび5'末端濃縮cDNAライブラリーの構築と特性評価」. Gene . 200 ( 1– 2): 149– 56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
- Lehner B、 Sanderson CM (2004年7 月)。「ヒト mRNA分解 のためのタンパク質相互作用フレームワーク」。ゲノム研究。14 (7): 1315–23。doi :10.1101/gr.2122004。PMC 442147。PMID 15231747。
- ルアル JF、ヴェンカテサン K、ハオ T、弘實=岸川 T、ドリコット A、リー N、ベリス GF、ギボンズ FD、ドレーゼ M、アイヴィ=グエデフスー N、クリットゴード N、サイモン C、ボクセム M、ミルスタイン S、ローゼンバーグ J、ゴールドバーグDS、チャン LV、ウォン SL、フランクリン G、リー S、アルバラ JS、リム J、フロートン C、ラモサス E、セビック S、ベックス C、ラメシュ P、シコルスキー RS、ヴァンデンハウト J、ゾグビ HY、スモリャル A、ボサック S、セケーラ R、ドゥセット スタム L、キュージック ME、ヒル DE、ロス FP、ビダル M ( 2005 年 10 月)。 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。自然。437 (7062): 1173– 8. Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
- Kubota K, Kim JY, Sawada A, Tokimasa S, Fujisaki H, Matsuda-Hashii Y, Ozono K, Hara J (2004 年 4 月). 「B 細胞発達に関与する LRRC8 は、ロイシンリッチリピートタンパク質の新しいファミリーに属します」. FEBS Letters . 564 ( 1– 2): 147– 52. doi : 10.1016/S0014-5793(04)00332-1 . PMID 15094057.
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- 大月 哲、太田 哲、西川 哲、林 和、鈴木 裕、山本 丈、若松 亜、木村 和、坂本 和、波多野 直、河合 裕、石井 俊、斉藤 和、小島 俊、杉山 達、小野 達也、岡野 和、吉川 裕、青塚 S、佐々木 N、服部 A、奥村 K、永井 K、菅野 S、磯貝 T (2007)。 「オリゴキャップされたcDNAライブラリーからの分泌タンパク質または膜タンパク質をコードする完全長ヒトcDNAの選択のためのシグナル配列およびキーワードトラップのインシリコ」。DNA 研究。12 (2): 117–26 .土井: 10.1093/dnares/12.2.117。PMID 16303743。
- Olsen JV、Blagoev B、Gnad F、Macek B、Kumar C、Mortensen P、Mann M (2006 年 11 月)。「シグナル伝達ネットワークにおける全体的、生体内、および部位特異的なリン酸化ダイナミクス」。Cell . 127 (3): 635– 48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983. S2CID 7827573。