ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| 労働組合 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | 脂肪腫における優先転座パートナーを含むLPP 、 LIM ドメイン |
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| 外部ID | OMIM : 600700; MGI : 2441849;ホモロジーン: 4075;ジーンカード:LPP; OMA :LPP - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 16番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 16|16 B1 | 始める | 24,393,507 bp [2] |
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| 終わり | 24,992,578 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 伏在静脈
- 尿道
- 大静脈
- 乳首
- 幽門
- 精巣上体の尾
- 噴門
- 精嚢
- 結腸上皮
- 浅側頭動脈
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| | トップの表現 | - 上行大動脈
- 大動脈弁
- パネートセル
- 臍帯
- 大動脈領域の中膜
- リンパ管の内皮細胞
- 結膜円蓋
- 膀胱
- 頸部
- 回腸上皮
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS |  | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 | | | 細胞成分 |
- 細胞接合
- 細胞膜
- 膜
- 核
- 焦点接着
- 細胞質
- 細胞質
- ストレスファイバー
| | 生物学的プロセス | | | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | NM_001167671 NM_001167672 NM_005578 NM_001375455 NM_001375456
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NM_001375457 NM_001375458 NM_001375459 NM_001375460 NM_001375461 NM_001375462 NM_001375463 NM_001375464 NM_001375465 |
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NM_001145952 NM_001145954 NM_178665 |
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| RefSeq (タンパク質) | NP_001161143 NP_001161144 NP_005569 NP_001362384 NP_001362385
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NP_001362386 NP_001362387 NP_001362388 NP_001362389 NP_001362390 NP_001362391 NP_001362392 NP_001362393 NP_001362394 |
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NP_001139424 NP_001139426 NP_848780 |
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| 場所 (UCSC) | 3 章: 188.15 – 188.89 Mb | 16章: 24.39 – 24.99 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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脂肪腫優先パートナーは、ヒトではLPP遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
関数
脂肪腫優先パートナーは、N末端プロリンリッチ領域と3つのC末端LIMドメインを特徴とするLIMドメインタンパク質のサブファミリーです。コード化されたタンパク質は、接着斑の細胞周辺に局在し、細胞間接着と細胞運動に関与している可能性があります。このタンパク質は核内を往復し、転写共活性化因子として機能する可能性があります。この遺伝子は、特定の疾患関連染色体転座の接合部に位置し、腫瘍の成長を促進する可能性のある融合タンパク質の発現を引き起こします。[6]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000145012 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000033306 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Petit MM、Mols R、Schoenmakers EF、Mandahl N、Van de Ven WJ (1997 年 2 月)。「脂肪腫における HMGIC の優先融合パートナー遺伝子である LPP は、LIM タンパク質遺伝子ファミリーの新規メンバーです」。Genomics . 36 ( 1): 118– 29. doi :10.1006/geno.1996.0432. PMID 8812423。
- ^ ab 「Entrez Gene: 脂肪腫における優先転座パートナーを含む LPP LIM ドメイン」。
さらに読む
- Schoenmakers EF、Wanschura S、Mols R、et al. (1995)。「良性間葉系腫瘍における高移動度グループタンパク質遺伝子 HMGI-C の反復再配列」。Nat . Genet . 10 (4): 436– 44. doi :10.1038/ng0895-436. PMID 7670494. S2CID 29935721。
- Petit MM、Swarts S、 Bridge JA、Van de Ven WJ (1998)。「骨傍脂肪腫におけるHMGIC遺伝子とLPP遺伝子の相互融合転写産物の発現」。Cancer Genet。Cytogenet。106 ( 1 ): 18– 23。doi :10.1016/S0165-4608(98)00038-7。PMID 9772904 。
- Petit MM、Fradelizi J、Golsteyn RM、et al. (2000)。「Zyxin に関連するアクチン細胞骨格タンパク質 LPP は、核輸出シグナルと転写活性化能力を保有している」。Mol . Biol. Cell . 11 (1): 117– 29. doi :10.1091/mbc.11.1.117. PMC 14761. PMID 10637295 。
- Rogalla P、Lemke I、Kazmierczak B、Bullerdiek J (2001)。「同一のHMGIC-LPP融合転写産物は、t(3;12)(q27-28;q14-15)を伴う肺軟骨過誤腫で一貫して発現している」。Genes Chromosomes Cancer。29 ( 4 ): 363– 6。doi : 10.1002 /1098-2264(2000)9999:9999<1::AID-GCC1043>3.0.CO;2-N。PMID 11066083。S2CID 35883889 。
- Harrington JJ、Sherf B、Rundlett S、et al. (2001)。「遺伝子発現のランダム活性化を用いたゲノムワイドなタンパク質発現ライブラリの作成」。Nat . Biotechnol . 19 (5): 440– 5. doi :10.1038/88107. PMID 11329013. S2CID 25064683.
- Dahéron L、Veinstein A、Brizard F、et al. (2001)。「ヒトLPP遺伝子は、at(3;11) (q28;q23)を伴う二次性急性白血病においてMLLと融合している」。遺伝子 染色体がん。31 ( 4 ): 382– 9。doi : 10.1002/gcc.1157。PMID 11433529。S2CID 32921978 。
- Lemke I、Rogalla P、Bullerdiek J (2002)。「新しい LPP 融合遺伝子は、脂肪腫および肺軟骨過誤腫における切断型 LPP タンパク質の重要な役割を示唆している」。Cytogenet。Cell Genet。95 ( 3–4 ) : 153–6。doi : 10.1159 / 000059338。PMID 12063392。S2CID 42951388 。
- Petit MM、Meulemans SM、Van de Ven WJ (2003)。「LIM 含有脂肪腫優先パートナー (LPP) タンパク質の焦点接着および核標的化能力」。J . Biol. Chem . 278 (4): 2157– 68. doi : 10.1074/jbc.M206106200 . PMID 12441356。
- Lemke I、Rogalla P、Grundmann F、et al. (2003)。「核型が正常な肺軟骨過誤腫61例中1例のみにHMGA2-LPP融合転写産物が発現」。Cancer Genet。Cytogenet。138 ( 2 ) : 160– 4。doi :10.1016/S0165-4608(02)00595-2。PMID 12505264。
- Salomon AR, Ficarro SB, Brill LM, et al. (2003). 「質量分析法を用いたヒト細胞におけるチロシンリン酸化経路のプロファイリング」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 100 (2): 443– 8. Bibcode :2003PNAS..100..443S. doi : 10.1073/pnas.2436191100 . PMC 141014 . PMID 12522270.
- Li B、Zhuang L、Reinhard M、Trueb B (2003)。「脂肪腫の優先パートナーであるLPPはα-アクチニンと相互作用する」。J . Cell Sci . 116 (Pt 7): 1359– 66. doi : 10.1242/jcs.00309 . PMID 12615977。
- Gorenne I、Nakamoto RK、Phelps CP、他 (2003)。「平滑筋で高度に発現する LIM タンパク質 LPP」。Am . J. Physiol.、Cell Physiol . 285 (3): C674–85. doi :10.1152/ajpcell.00608.2002. PMID 12760907。
- Brill LM、Salomon AR、Ficarro SB、他 (2004)。「固定化金属アフィニティークロマトグラフィーとタンデム質量分析法を用いたヒトT細胞からのチロシンリン酸化部位の堅牢なホスホプロテオームプロファイリング」。Anal . Chem . 76 (10): 2763– 72. doi :10.1021/ac035352d. PMID 15144186。
- Rush J、Moritz A、Lee KA、他 (2005)。「がん細胞におけるチロシンリン酸化の免疫親和性プロファイリング」。Nat . Biotechnol . 23 (1): 94– 101. doi :10.1038/nbt1046. PMID 15592455. S2CID 7200157.
- Petit MM、Meulemans SM、Alen P、他 (2006)。「腫瘍抑制因子 Scrib は、細胞接着部位と核の間を行き来するジキシン関連タンパク質 LPP と相互作用する」。BMC Cell Biol . 6 (1): 1. doi : 10.1186/1471-2121-6-1 . PMC 546208 . PMID 15649318。
- Zhang Y、Wolf-Yadlin A、Ross PL、他 (2005)。「上皮成長因子受容体シグナル伝達ネットワークにおけるチロシンリン酸化部位の時間分解質量分析により動的モジュールが明らかに」。Mol . Cell. Proteomics . 4 (9): 1240– 50. doi : 10.1074/mcp.M500089-MCP200 . PMID 15951569。
- Tao WA、Wollscheid B、O'Brien R、他 (2005)。「デンドリマー結合化学とタンデム質量分析法を用いた定量的ホスホプロテオーム分析」。Nat . Methods . 2 (8): 591– 8. doi :10.1038/nmeth776. PMID 16094384. S2CID 20475874.
- von Ahsen I、Rogalla P、Bullerdiek J (2006)。「t(3;12)(q27 約 28;q14 約 15) を伴う肺軟骨過誤腫における LPP-HMGA2 融合転写産物の発現パターン」。Cancer Genet。Cytogenet。163 ( 1 ): 68– 70。doi : 10.1016/j.cancergencyto.2005.02.023。PMID 16271958 。
- Kubo T, Matsui Y, Goto T, et al. (2006). 「HMGA2-LPP融合転写産物の過剰発現は、α2型XIコラーゲン遺伝子の発現を促進する」。Biochem . Biophys. Res. Commun . 340 (2): 476– 81. doi :10.1016/j.bbrc.2005.12.042. PMID 16375854。
この記事には、パブリックドメインである米国国立医学図書館のテキストが組み込まれています。