ＬＮＸ１

ＬＮＸ１
利用可能な構造
ＰＤＢ	オルソログ検索: PDBe RCSB
PDB IDコードのリスト
	3B76
識別子
エイリアス	LNX1、LNX、MPDZ、PDZRN2、numbタンパク質X 1のリガンド
外部ID	オミム：609732; MGI : 1278335;ホモロジーン: 7819;ジーンカード：LNX1; OMA :LNX1 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
クロ。	染色体4（ヒト）
終わり	53,701,405 bp
遺伝子の位置（マウス）
クロ。	5番染色体（マウス）
終わり	74,863,573 bp
RNA発現パターン
	トップの表現
	中側頭回; ; 耳下腺; ; ブロードマン領域23; ; 内皮細胞; ; ブロードマン領域46; ; 口腔; ; 羊水; ; 腕の皮膚; ; 上前頭回; ; 小腸粘膜;
	トップの表現
	運動ニューロン; ; 顔面運動核; ; 黒質; ; 蝸牛管の前庭膜; ; パネートセル; ; 右心室; ; 胃の上皮; ; 涙腺; ; 膀胱移行上皮; ; 脊髄前角;
	参照表現データの詳細
	該当なし
遺伝子オントロジー
分子機能	PDZドメインバインディング; タンパク質結合; 金属イオン結合; ユビキチンタンパク質転移酵素活性; トランスフェラーゼ活性; 亜鉛イオン結合;
細胞成分	細胞質;
生物学的プロセス	タンパク質ホモオリゴマー化; タンパク質のユビキチン化; ユビキチン依存性タンパク質分解プロセス;
	出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
	84708
	16924
	ENSG00000072201
	ENSMUSG00000029228
	翻訳
	O70263
	NM_001126328 ; NM_032622
NM_001159577 ; NM_001159578 ; NM_001159579 ; NM_001159580 ; NM_010727;
	NM_001359074
	NP_001119800 ; NP_116011
NP_001153049 ; NP_001153050 ; NP_001153051 ; NP_001153052 ; NP_034857;
	NP_001346003
	ウィキデータ
人間の表示/編集	マウスの表示/編集

E3ユビキチンタンパク質リガーゼLNXは、ヒトではLNX1遺伝子によってコードされる酵素である。^[5]^[6]^[7]

インタラクション

LNX1はNAGK ^[8]、NUMB ^[6]、PAFAH1B3 ^[8]と相互作用することが示されている。

参考文献

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さらに読む

Dho SE、Jacob S、Wolting CD、French MB、Rohrschneider LR、McGlade CJ (1998 年 4 月)。「哺乳類の numb ホスホチロシン結合ドメイン。結合特異性の特性評価と、新規 PDZ ドメイン含有 numb 結合タンパク質 LNX の同定」。The Journal of Biological Chemistry。273 ( 15): 9179–87。doi : 10.1074/jbc.273.15.9179。PMID 9535908。
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クラーク HF、ガーニー AL、アバヤ E、ベイカー K、ボールドウィン D、ブラッシュ J、チェン J、チョウ B、チューイ C、クロウリー C、カレル B、デュエル B、ダウド P、イートン D、フォスター J、グリマルディ C、グ Q 、ハス PE、ヘルデンズ S、ファン A、キム HS、クリモフスキー L、ジン Y、ジョンソン S、リー J、ルイス L、リャオ D、マークM、ロビー E、サンチェス C、シェーンフェルド J、セシャギリ S、シモンズ L、シン J、スミス V、スティンソン J、ヴァグツ A、バンドレン R、ワタナベ C、ウィアンド D、ウッズ K、シェ MH、ヤンスラ D、イー S、 Yu G、Yuan J、Zhang M、Zhang Z、Goddard A、Wood WI、Godowski P、Grey A (10 月) 2003年）。「分泌タンパク質発見イニシアチブ（ SPDI ）、新規ヒト分泌タンパク質および膜貫通タンパク質を特定するための大規模な取り組み：バイオインフォマティクス評価」。ゲノム研究。13 （10）：2265–70。doi ：10.1101/ gr.1293003。PMC 403697 . PMID 12975309.
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[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000029228 – Ensembl、2017 年 5 月

[3] 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[4] 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[pmid11521506-5] Xie Y, Zhao W, Wang W, Zhao S, Tang R, Ying K, Zhou Z, Mao Y (2001 年 4 月). 「複数の PDZ ドメインを含むヒト LNX タンパク質の同定」.生化学遺伝学. 39 (3–4): 117–26. doi :10.1023/A:1010269908398. PMID 11521506. S2CID 9150813.

[pmid11782429-6] Nie J、McGill MA、Dermer M、Dho SE、Wolting CD、McGlade CJ (2002 年 1 月)。「LNX は、細胞運命決定因子 Numb を標的としてユビキチン依存性分解を行う RING 型 E3 ユビキチンリガーゼとして機能する」。The EMBO Journal。21 ( 1–2 ) : 93–102。doi :10.1093/emboj/21.1.93。PMC 125803。PMID 11782429 。

[entrez-7] 「Entrez Gene: numb-protein X 1 の LNX1 リガンド」。

[pmid16189514-8] ルアル JF、ヴェンカテサン K、ハオ T、弘實＝岸川 T、ドリコット A、リー N、ベリス GF、ギボンズ FD、ドレーゼ M、アイヴィ＝グエデフスー N、クリットゴード N、サイモン C、ボクセム M、ミルシュタイン S、ローゼンバーグ J 、ゴールドバーグ DS、チャン LV、ウォン SL、フランクリン G、リー S、アルバラ JS、リムJ、フロートン C、ラモサス E、セビック S、ベックス C、ラメシュ P、シコルスキー RS、ヴァンデンハウト J、ゾグビ HY、スモリャル A、ボサック S、セケーラ R、ドゥセットスタム L、キュージック ME、ヒル DE、ロス FP、ビダルM (2005 年 10 月)。「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。自然。437 (7062): 1173–8. Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.