ジョセフ・デリシ

ジョセフ・デリシ
国籍	アメリカ人
母校	スタンフォード大学、カリフォルニア大学サンタクルーズ校
知られている	ViroChip、 SARSウイルスの特定、熱帯熱マラリア原虫の遺伝子発現に関する研究
科学者としてのキャリア
フィールド	生物学
機関	カリフォルニア大学サンフランシスコ校 ハワード・ヒューズ医学研究所
論文	出芽酵母サッカロミセス・セレビシエ における全ゲノム遺伝子発現の解析（1999）
博士課程の指導教員	パトリック・O・ブラウン

ジョセフ・ライマン・デリシは、分子生物学、寄生虫学、ゲノミクス、ウイルス学、計算生物学を専門とするアメリカの生化学者です。

デリシはカリフォルニア州カーマイケルで育ち、デル・カンポ高校を卒業した。^{[1] 1992年に}カリフォルニア大学サンタクルーズ校で生化学と分子生物学の学士号を取得した。^[2]

デリシは1999年にスタンフォード大学で生化学の博士号を取得した。パトリック・O・ブラウンの研究室で働き、分子生物学におけるDNAマイクロアレイの作製と使用法を開発し、学位論文は出芽酵母S. cerevisiaeの全ゲノム発現解析であった。^{[3] [4] [5]卒業後、デリシは}カリフォルニア大学サンフランシスコ校のサンドラーフェローに就任した。^{[2] [6]}

デリシは1999年からUCSF生化学・生物物理学部の教員を務めている。2022年現在、彼は生化学と生物物理学の教授であり、UCSFの画期的生物医学研究のためのサンドラープログラムのディレクターも務めている。^{[2] [6]}

デリシ氏は、初の全ゲノム発現アレイの印刷、^[7]癌細胞における遺伝子発現の差に関する初の広範な分析、^{[8]マラリア}を引き起こす原生動物である熱帯熱マラリア原虫のライフサイクル全体にわたる遺伝子発現のプロファイリング、^[9] SARS -CoV-1ウイルスのゲノム特性の解明、 ^[10]遺伝子ハイブリダイゼーションアレイとDNAシーケンシング技術を用いた先駆的なウイルス発見で知られています。^[11]

デリシはキャリアの初期にマイクロアレイの先駆者であり、マイクロアレイ用のハードウェアとソフトウェアの両方を設計・構築した。彼はマイクロアレイ技術へのオープンアクセスの提唱者であり^[5]、マイクロアレイ操作用のソフトウェアとプロトコルを掲載したウェブサイトを運営していた。^{[4]彼はまた、}オープンアクセス出版の提唱者でもある。^[12]

2002年、デリシと共同研究者のデイビッド・ワンは、血液や組織のサンプル内のウイルスを迅速に特定するために使用できるDNAマイクロアレイであるViroChipを開発した。[ ^13]彼は2003年にこのツールを使ってSARS-CoV-1ウイルスを特定した。2004年、デリシはViroChipとゲノム診断技術に関する研究でマッカーサーフェローに選ばれた。^{[12] [14]}

デリシは2005年にハワード・ヒューズ医学研究所（HHMI）の研究員となり、研究のためにHHMIから資金援助を受けた。^{[6] [15]}彼は2016年まで研究員を務めた。^[16]

デリシと彼の同僚は、メタゲノム次世代シーケンシング（mNGS）を、感染性脳炎や髄膜炎の原因物質の特定、自己免疫性原因と感染性原因の区別、従来の臨床検査技術では解読が難しい症例の診断などの用途に使用している。^{[13] [17]}メタゲノムシーケンシングを使用して、デリシは、ヒト、およびオウムやオカメインコからミツバチやボアコンストリクターに至るまでの動物の病原性ウイルスを特定した。^{[13] [18]}彼と研究パートナーのドン・ガネムは、ミツバチのコロニー崩壊の原因と思われる寄生虫、ノゼマ・セラネを^{特定した。 [19]}彼はまた、ウイルスと特定のヒト癌のサブセットとの関係を否定した。^[20]

デリシと彼の同僚であるマイケル・ウィルソン博士は、ファージディスプレイを使用して、自己免疫症状のある患者から採取した抗体サンプルをヒトタンパク質のライブラリーに対してスクリーニングし、症状の原因となる癌関連の自己抗原を特定することを可能にした。^{[20] [21]}

UCSFのデリシ研究室では、マラリアを引き起こす病原体である熱帯マラリア原虫の遺伝学を理解するための研究も行っている。熱帯マラリア原虫は、最も致命的な形態のヒトマラリアの原因物質である。^{[12] [22]}デリシ研究グループは、マラリア治療の候補薬を開発してきた。^[23] 2011年、研究グループは、アピコンプレックス類に特有の細胞小器官であるアピコプラストの機能を決定し、前臨床候補であった抗マラリア薬の標的を特定した。^{[24] [25]}

2016年、デリシはスティーブン・クエイクとともに新設されたCZバイオハブの共同社長に就任した。^[26] CZバイオハブに参加した後、デリシはUCSFの研究室のコードを基にクラウドベースのメタゲノム診断プラットフォームを作成するための開発者チームを設立した。当時IDSeqと名付けられたこのプラットフォームは、2018年に小規模なグループによって当初はテスト用に立ち上げられた。^{[27] [17]}開発とコンピューティングのコストは、チャン・ザッカーバーグ・イニシアチブとCZバイオハブによって支援された。^[17]このプラットフォームは、メタゲノム配列データから病原体を迅速に特定するために使用され、^[28] 2022年現在はCZ-IDとして知られている。^[29]

2020年、 COVID-19パンデミックの初期に、デリシ氏はチームを率いて、CZバイオハブに隣接する空き研究室スペースを8日間でCLIA認定のCOVID-19検査施設に変えた。 ^{[30] [31]} CLIAhubは国内有数のCOVID-19検査センターとなり、1日数千件の検査を処理し、国のモデルとなった。^{[32] [33] [34]}デリシ氏によるパンデミックの早期警告と迅速検査技術の開発は、マイケル・ルイス氏の著書『予感：パンデミックの物語』に記録されている。^{[35] [36]}同時に、デリシ氏はCOVID-19ウイルスの変異を特定し監視するための国家COVID-19監視システムの開発を積極的に推進した。^{[37] [38] [33]}

• 2001 サール奨学生賞、サール奨学生プログラム、ノースブルック、イリノイ州
• 2001 JP モルガン チェース ヘルス アワード、テック ミュージアムオブ イノベーション、サンノゼ、カリフォルニア州
• 2002カリフォルニア大学サンフランシスコ校ゴードン・トムキンス生化学・生物物理学教授
• 2003 パッカード科学工学フェローシップ、デビッド・アンド・ルシール・パッカード財団、カリフォルニア州ロスアルトス
• 2004 マッカーサーフェローシップ、ジョン・D・アンド・キャサリン・T・マッカーサー財団、シカゴ、イリノイ州
• 2004 Wired RAVE 賞、健康と医学、WIRED マガジン、サンフランシスコ、カリフォルニア州
• 2005 ベイバイオ科学功績賞、ベイバイオ、サンフランシスコ、カリフォルニア州
• 2006 卒業生功労賞、カリフォルニア大学サンタクルーズ校、カリフォルニア州サンタクルーズ
• 2007 シャボット科学賞、シャボット宇宙科学センター、カリフォルニア州オークランド
• 2008年 第14回ハインツ技術・経済・雇用賞、ペンシルベニア州ピッツバーグ
• 2014年米国科学アカデミーより科学の進歩に対するジョン・J・カーティ賞^[39]
• イーライリリー・アンド・カンパニー研究賞受賞者^[2]

科学組織の会員には以下のものが含まれます。

• 2013年カリフォルニア科学アカデミー会員に選出^[40]
• 2013年アメリカ微生物学会会員に選出。^[41]
• 2015年アメリカ芸術科学アカデミー会員に選出^[42]
• 2016年米国科学アカデミー会員に選出^[43]
• 2016年米国医学アカデミー会員に選出^[44]

• デリシラボ
• ジョセフ・デリシ博士の略歴はハワード・ヒューズ医学研究所のサイトでご覧いただけます
• microarrays.org (インターネットアーカイブのコピー)
• ジョセフ・L・デリシ、サール奨学生プログラムサイトのプロフィール
• テックアワード、2001年健康賞受賞者、ジョセフ・L・デリシ
• パッカード科学工学フェローシップ
• 2004年マッカーサーフェロー発表
• 2004 ワイアード RAVE アワード
• ベイバイオパンテオン
• 卒業生功績賞
• 2007 シャボー科学賞
• ハインツ賞、ジョセフ・デリシのプロフィール
• ジョー・デリシが医療の謎を解く、TEDトーク