東京科学研究所

• 1881年5月：東京工業大学の前身である東京職業学校が設立される^{[ 9 ]}

• 1928年10月：東京医科歯科大学の前身である東京高等歯科学校が、最初の国立歯科教育機関として設立される^{[ 9 ]。}

• 1929年4月：東京高等技術学校の地位が学位授与大学に昇格し、後に東京工業大学と改称される^{[ 9 ]。}

• 1946年8月：東京医科歯科大学が設立される^{[ 9 ]}

• 2024年10月：東京工業大学と東京医科歯科大学が合併し、東京理工大学が設立される

• 理学部
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• 生命科学技術学部
  • 生命科学技術学部
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  • 技術革新マネジメント／イノベーション科学部門

• 医歯学研究科
  • 医学・歯学専攻（博士課程）
  • 共同学位プログラム（博士課程）
  • 生物医学科学・工学分野（博士課程）
  • 健康科学および生物医学工学（修士課程）
  • 医療・歯学科学技術修士課程（医療管理学修士）
  • グローバルヘルス分野の公衆衛生学修士課程（修士課程）

• 医療科学大学院
  • 看護革新科学専攻（5年間の統合型博士課程）

• 医学部
  • 医学部（6年間）
  • 医療科学部（4年制）
    • 看護科学専攻
    • 医療技術コース
• 歯学部
  • 歯学部（6年間）
  • 口腔保健科学部（4年制）
    • 口腔保健科学専攻
    • 口腔保健工学専攻

• リベラルアーツ研究所

• 統合研究研究所
  • 材料・構造研究所（MSL）
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• 未来科学研究所
  • 地球生命科学研究所（ELSI）
• 新産業インキュベーション研究所

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• 科学研究所東京病院
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  • 情報インフラストラクチャセンター
  • 放射線安全管理センター
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  • 教職員医療センター
  • 国際サポートセンター
  • 博物館とアーカイブ

湯島（ゆしま）キャンパスは、文京区に位置し、お茶の水駅に近い医歯学部のメインキャンパスです。高さ126mのM&Dタワーをはじめとする大学病院や研究施設が集まっています。湯島キャンパスはもともと、東京女子高等師範学校（現在のお茶の水女子大学）の敷地の一部で、断続的に賃貸されていました。東京高等師範学校（旧制度）時代には、校舎拡張の必要性から、文部省が1930年に東京女子高等師範学校を文京区大塚に移転させ、メインキャンパスを拡張しました。現在、湯島キャンパスと駿河台キャンパスは限られた土地に建ち並び、建蔽率を最大限に高めた高層ビルが密集しています。特に研究棟は高層ビルで、国立研究機関としては独特な外観を呈しています。敷地面積は45,090m2 ^、建物面積は273,054m2^です。^{[ 16 ]}

駿河台（駿河台、Surugadai）キャンパスは、お茶の水駅にも近く、生体材料・バイオエンジニアリング研究所、M&Dデータセンター、医学研究所の一部が入居しています。敷地面積は5,597m² ^、建築面積は18,028m²^です。^{[ 16 ]}

国府台（こうのだい）キャンパスは、医学部と歯学部の学部生が大学での学習を始める場所であり、旧教養学部、国府台図書館、学生寮、グラウンド、体育館、その他の施設があります。このキャンパスは千葉県市川市にあり、湯島キャンパスから電車で約40分です。敷地面積は61,049m² ^{、建物面積は13,965m²}です。^{[ 16 ]}

• ガーナ・サイエンス東京研究協力センター（野口記念医学研究所内）
• CU-サイエンス東京研究教育連携センター
• ラテンアメリカ共同研究センター（LACRC）
• サイエンス東京-MUパートナーシップシリラートオフィス
• サイエンス東京アネックスバンコク
• サイエンス東京アネックスアーヘン
• サイエンス東京アネックス バークレー
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