ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| ITGB4 |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オルソログ検索: PDBe RCSB |
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| PDB IDコードのリスト |
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1QG3、2YRZ、3F7P、3F7Q、3F7R、3FQ4、3FSO、3H6A、4Q58、4WTW、4WTX |
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| 識別子 |
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| エイリアス | ITGB4、CD104、GP150、インテグリンサブユニットβ4、JEB5A、JEB5B |
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| 外部ID | オミム: 147557; MGI : 96613;ホモロジーン: 179;ジーンカード:ITGB4; OMA :ITGB4 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 11番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 11 E2|11 80.91 cM | 始める | 115,865,535 bp [2] |
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| 終わり | 115,899,238 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 脛骨神経
- 小唾液腺
- 脚の皮膚
- 腓骨神経
- 腹部の皮膚
- 鼻粘膜の嗅覚領域
- 横行結腸粘膜
- 右子宮管
- 胃の本体
- 胃粘膜
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| | トップの表現 | - 角膜実質
- リップ
- 坐骨神経
- 臼歯
- 回腸上皮
- 食道
- 幽門洞
- 大腸
- 結腸
- 外耳の皮膚
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- タンパク質結合
- Gタンパク質共役受容体結合
- ニューレグリン結合
- インスリン様成長因子I結合
- インテグリン結合
| | 細胞成分 |
- 膜の不可欠な構成要素
- 膜
- 受容体複合体
- 細胞膜
- ヘミデスモソーム
- 細胞表面
- インテグリン複合体
- 細胞接合
- セル先端
- 細胞外エクソソーム
- 核
- 焦点接着
| | 生物学的プロセス |
- ヘミデスモソームアセンブリ
- 腎臓系の発達
- 爪の発達
- 細胞運動性
- 細胞外マトリックスの組織化
- オートファジー
- 細胞コミュニケーション
- 細胞接着
- 負傷に対する反応
- 中胚葉細胞の分化
- インテグリンを介したシグナル伝達経路
- 消化管の発達
- 細胞-マトリックス接着
- 皮膚の発達
- アメロジェネシス
- 細胞移動
- インテグリンを介した細胞接着
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_000213 NM_001005619 NM_001005731 NM_001321123 |
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| RefSeq (タンパク質) | |
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NP_000204 NP_001005619 NP_001005731 NP_001308052 |
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NP_001005608 NP_598424 NP_001392055 NP_001392056 |
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| 場所 (UCSC) | 17章: 75.72 – 75.76 Mb | 11 章: 115.87 – 115.9 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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インテグリンβ4(ITGB4 )はCD104(Cluster of Differentiation 104)としても知られ、ヒト遺伝子である。[5]
関数
インテグリンは、非共有結合した膜貫通糖タンパク質受容体であるαおよびβサブユニットからなるヘテロ二量体である。αおよびβポリペプチドの異なる組み合わせは、リガンド結合特異性が異なる複合体を形成する。インテグリンは細胞間または細胞間の接着を媒介し、遺伝子発現および細胞増殖を制御するシグナルを伝達する。この遺伝子は、ラミニンの受容体であるインテグリンβ4サブユニットをコードする。このサブユニットはα6サブユニットと関連する傾向があり、浸潤癌の生物学において極めて重要な役割を果たす可能性がある。この遺伝子の変異は、幽門閉鎖を伴う表皮水疱症に関連している。この遺伝子には、異なるアイソフォームをコードする複数の選択的スプライシング転写バリアントが見つかっている。[5]
インタラクション
ITGB4はコラーゲンXVII型α1、[6] [7] EIF6 [8]およびエルビン[9]と相互作用することが示されている。
参照
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000132470 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000020758 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ ab 「Entrez Gene: ITGB4 インテグリン、ベータ 4」。
- ^ Aho S, Uitto J (1998 年 2 月)。「水疱性類天疱瘡抗原 2 (BP180) の細胞内ドメインと、基底ケラチノサイトのヘミデスモソーム成分であるベータ 4 インテグリンとの直接的な相互作用」。生化学および生物物理学的研究通信。243 (3): 694– 9。doi :10.1006/bbrc.1998.8162。PMID 9500991 。
- ^ Schaapveld RQ、Borradori L、Geerts D、van Leusden MR、Kuikman I、Nievers MG、Niessen CM、Steenbergen RD、Snijders PJ、Sonnenberg A (1998 年 7 月)。「ヘミデスモソームの形成は、β4 インテグリンサブユニットによって開始され、β4 と HD1/プレクチンの複合体形成を必要とし、β4 と水疱性類天疱瘡抗原 180 との直接的な相互作用を伴う」。The Journal of Cell Biology。142 (1): 271– 84。doi : 10.1083/jcb.142.1.271。PMC 2133016。PMID 9660880。
- ^ Biffo S、Sanvito F、Costa S、Preve L、Pignatelli R、Spinardi L、Marchisio PC (1997 年 11 月)。「上皮細胞で高度に発現する新規 beta4 インテグリン結合タンパク質 (p27(BBP)) の単離」。The Journal of Biological Chemistry。272 ( 48): 30314– 21。doi : 10.1074/jbc.272.48.30314。PMID 9374518。
- ^ Favre B、Fontao L、Koster J、Shafaatian R、Jaunin F、Saurat JH、Sonnenberg A、Borradori L (2001 年 8 月)。「ヘミデスモソームタンパク質水疱性類天疱瘡抗原 1 とインテグリン β 4 サブユニットは ERBIN に結合する。ERBIN の複数の選択的スプライス変異体の分子クローニングとそれらの組織発現の分析」。The Journal of Biological Chemistry。276 ( 35): 32427– 36。doi : 10.1074/ jbc.M011005200。PMID 11375975。
さらに読む
- Lipscomb EA、 Mercurio AM (2005 年 9 月)。「シグナル伝達能のある α6β4 インテグリンの動員と活性化が癌の進行に寄与する」。Cancer and Metastasis Reviews。24 (3): 413– 23。doi : 10.1007 /s10555-005-5133-4。PMID 16258729。S2CID 26150860。
- Sonnenberg A、Linders CJ、Modderman PW、Damsky CH、Aumailley M、Timpl R (1990 年 6 月)。「ラミニンのさまざまな細胞結合フラグメント (P1、E3、E8) のインテグリン認識と、フラグメント E8 の主要な受容体としてアルファ 6 ベータ 1 は機能するがアルファ 6 ベータ 4 は機能しないという証拠」。The Journal of Cell Biology。110 ( 6): 2145– 55。doi :10.1083/ jcb.110.6.2145。PMC 2116116。PMID 1693624。
- Tamura RN、Rozzo C、Starr L、Chambers J、Reichardt LF、Cooper HM、Quaranta V (1990 年 10 月)。「上皮インテグリン α 6 β 4: α 6 の完全な一次構造と β 4 の変異体」。The Journal of Cell Biology。111 ( 4 ): 1593– 604。doi :10.1083/jcb.111.4.1593。PMC 2116232。PMID 1976638。
- Hogervorst F、Kuikman I、van Kessel AG、Sonnenberg A (1991 年 7 月)。「ヒト α 6 インテグリンサブユニットの分子クローニング。α 6 mRNA の選択的スプライシングとα 6 およびβ 4 遺伝子の染色体局在」。European Journal of Biochemistry。199 ( 2): 425– 33。doi : 10.1111 /j.1432-1033.1991.tb16140.x。PMID 2070796。
- Vogel BE、Tarone G、Giancotti FG 、 Gailit J、Ruoslahti E (1990 年 4 月)。「予想外のサブユニット構成を持つ新規フィブロネクチン受容体 (α v β 1)」。 The Journal of Biological Chemistry。265 ( 11): 5934–7。doi : 10.1016 /S0021-9258(19)39268-3。PMID 2138612。
- 鈴木 誠、内藤 勇 (1990 年 3 月)。「新規インテグリン β 4 サブユニットのアミノ酸配列と上皮細胞における mRNA の一次発現」。EMBOジャーナル。9 ( 3 ) : 757– 63。doi :10.1002/ j.1460-2075.1990.tb08170.x。PMC 551732。PMID 2311577。
- Hogervorst F、Kuikman I、von dem Borne AE、Sonnenberg A (1990 年 3 月)。「β-4 cDNA のクローニングと配列分析: ユニークな 118 kd 細胞質ドメインを含むインテグリンサブユニット」。EMBOジャーナル 。9 ( 3 ) : 765– 70。doi :10.1002/ j.1460-2075.1990.tb08171.x。PMC 551734。PMID 2311578。
- Kajiji S、Tamura RN 、 Quaranta V (1989 年 3 月)。「ヒト上皮細胞からの新規インテグリン (α E β 4) は、インテグリン接着受容体の第 4 のファミリーを示唆している」。EMBOジャーナル 。8 ( 3 ): 673– 80。doi :10.1002/ j.1460-2075.1989.tb03425.x。PMC 400860。PMID 2542022。
- Hemler ME、Crouse C、Sonnenberg A (1989 年 4 月)。「VLA アルファ 6 サブユニットと新規タンパク質の結合。特定の細胞株における一般的な VLA ベータ 1 サブユニットの代替候補」。The Journal of Biological Chemistry。264 ( 11): 6529– 35。doi : 10.1016/ S0021-9258 (18)83380-4。PMID 2649503。
- ビダル F、アバーダム D、ミケル C、クリスティアーノ AM、プルキネン L、ウイット J、オルトンヌ JP、メネグッツィ G (1995 年 6 月)。 「幽門閉鎖を伴う接合部表皮水疱症に関連するインテグリン ベータ 4 変異」。自然遺伝学。10 (2): 229–34 .土井:10.1038/ng0695-229。PMID 7545057。S2CID 24894174 。
- Mainiero F、Pepe A、Wary KK、Spinardi L、Mohammadi M、Schlessinger J、Giancotti FG (1995 年 9 月)。「アルファ 6 ベータ 4 インテグリンによるシグナル伝達: 異なるベータ 4 サブユニット部位が Shc/Grb2 のリクルートメントとヘミデスモソームの細胞骨格との関連を仲介する」。EMBOジャーナル。14 ( 18 ) : 4470– 81。doi : 10.1002/j.1460-2075.1995.tb00126.x。PMC 394539。PMID 7556090。
- Clarke AS、 Lotz MM、Mercurio AM (1994 年 4 月)。「ヒト β 4インテグリンcDNA の新規構造変異体」。細胞接着とコミュニケーション。2 (1): 1– 6。doi :10.3109/15419069409014197。PMID 7982032 。
- Weeks BS、Desai K、Loewenstein PM、Klotman ME、Klotman PE、Green M、Kleinman HK (1993 年 3 月)。「HIV-1 Tat タンパク質およびその 90 kDa 細胞表面結合タンパク質における新規細胞接着ドメインの同定」。The Journal of Biological Chemistry。268 ( 7 ): 5279–84。doi : 10.1016/S0021-9258(18)53530-4。PMID 8444901 。
- Iacovacci S、Gagnoux-Palacios L、Zambruno G、Meneguzzi G、D'Alessio M (1997 年 6 月)。「ヒトインテグリン β4 遺伝子のゲノム構成」。哺乳類ゲノム。8 ( 6 ): 448– 50。doi : 10.1007/s003359900467。PMID 9166594。S2CID 41037975。
- Mainiero F、Murgia C、Wary KK、Curatola AM、Pepe A、Blummemberg M、Westwick JK、Der CJ、Giancotti FG (1997 年 5 月)。「Shc を介した Ras-MAP キナーゼ経路への alpha6beta4 インテグリンの結合がケラチノサイトの増殖を制御する」。EMBOジャーナル 。16 ( 9 ): 2365– 75。doi : 10.1093/ emboj /16.9.2365。PMC 1169837。PMID 9171350。
- Pulkkinen L、Kurtz K、Xu Y、Bruckner-Tuderman L、Uitto J (1997 年 6 月)。「インテグリン ベータ 4 遺伝子 (ITGB4) のゲノム構成: 幽門閉鎖症を伴う接合部表皮水疱症患者におけるホモ接合スプライス サイト変異」。実験室調査。76 (6): 823–33。PMID 9194858 。
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- von Bredow DC、Nagle RB、 Bowden GT、Cress AE (1997年10 月)。「マトリリシンによるベータ 4 インテグリンの切断」。実験細胞研究。236 (1): 341– 5。doi :10.1006/excr.1997.3711。PMID 9344615 。
- Biffo S、Sanvito F、Costa S、Preve L、Pignatelli R、Spinardi L、Marchisio PC (1997 年 11 月)。「上皮細胞で高度に発現する新規 beta4 インテグリン結合タンパク質 (p27(BBP)) の単離」。The Journal of Biological Chemistry。272 ( 48): 30314– 21。doi : 10.1074/ jbc.272.48.30314。PMID 9374518。
- プルキネン L、キム DU、ウイット J (1998 年 1 月)。 「幽門閉鎖を伴う表皮水疱症: β4 インテグリン遺伝子 (ITGB4) の新規変異」。アメリカ病理学ジャーナル。152 (1 ) : 157–66。PMC 1858138 。PMID 9422533。
- Hughes AE、Bradley DT、Campbell M、Lechner J、Dash DP、Simpson DA、Willoughby CE (2011 年 11 月)。「miR-184 シード領域を変化させる変異が白内障を伴う家族性円錐角膜を引き起こす」。American Journal of Human Genetics。89 ( 5): 628– 33。doi :10.1016/ j.ajhg.2011.09.014。PMC 3213395。PMID 21996275。
外部リンク
- GeneReviews/NCBI/NIH/UW の幽門閉鎖症を伴う表皮水疱症に関するエントリー
- 米国国立医学図書館の医学件名標目表(MeSH)の ITGB4+タンパク質、+ヒト
- ITGB4 情報 (Cell Migration Gateway のリンク付き) 2014-12-11 にWayback Machineでアーカイブされました
この記事には、パブリック ドメインである米国国立医学図書館のテキストが組み込まれています。