ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| SYVN1 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | SYVN1、DER3、HRD1、シノビオリン1 |
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| 外部ID | オミム：608046; MGI : 1921376;ホモロジーン：32700;ジーンカード：SYVN1; OMA :SYVN1 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置（マウス） |
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 | | クロ。 | 19番染色体（マウス）[2] |
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| | バンド | 19|19A | 始める | 6,096,606 bp [2] |
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| 終わり | 6,103,742 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス（相同遺伝子） |
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| トップの表現 | - 回腸粘膜
- 膵臓の体
- 肝臓の右葉
- 骨髄細胞
- 付録
- 子宮内膜間質細胞
- ランゲルハンス島
- 甲状腺の右葉
- リンパ節
- 甲状腺の左葉
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| | トップの表現 | - 腸間膜リンパ節
- 涙腺
- 唾液腺
- 脱落膜
- 肝臓の左葉
- ランゲルハンス島
- 臼歯
- 脾臓
- 精嚢
- 腎小体
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- シャペロンバインディング
- 折り畳まれていないタンパク質の結合
- ATPase結合
- 金属イオン結合
- タンパク質結合
- ユビキチン特異的プロテアーゼ結合
- ユビキチンタンパク質リガーゼ活性
- トランスフェラーゼ活性
| | 細胞成分 |
- 膜の不可欠な構成要素
- 小胞体膜
- 核質
- 滑面小胞体
- 小胞体膜の不可欠な構成要素
- 小胞体品質管理区画
- デルリン-1 レトロトランスロケーション複合体
- Hrd1p ユビキチンリガーゼ複合体
- Hrd1p ユビキチンリガーゼ ERAD-L 複合体
- 膜
- 小胞体
| | 生物学的プロセス |
- タンパク質の安定化
- タンパク質K48結合ユビキチン化
- 逆行性タンパク質輸送、ERからサイトゾルへ
- IRE1を介した未折り畳みタンパク質応答
- 小胞体ストレス誘導性内因性アポトーシスシグナル伝達経路の負の制御
- アスパラギンを介したタンパク質N結合型糖鎖
- 小胞体マンノーストリミング
- ERAD経路
- 小胞体未折り畳みタンパク質応答
- ユビキチン依存性ERAD経路
- タンパク質のユビキチン化
- ユビキチン依存性タンパク質分解プロセス
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| ウィキデータ |
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E3ユビキチンタンパク質リガーゼシノビオリンは、ヒトではSYVN1遺伝子によってコードされる酵素である。[5] [6]
関数
この遺伝子は、小胞体（ER）関連分解に関与するタンパク質をコードしています。コードされたタンパク質は、 ERストレス中に蓄積された未折り畳みタンパク質を、 ERから細胞質への逆行輸送によって除去します。このタンパク質は、未折り畳みタンパク質をさらに分解するために、ユビキチン-プロテアソームシステムも使用します。この遺伝子とミトコンドリアリボソームタンパク質L49遺伝子は、それぞれの3' UTRで同じゲノム配列の一部を使用しています。配列解析により、異なるアイソフォームをコードする2つの転写バリアントが特定されました。[6]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000162298 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000024807 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 天野哲也、山崎信也、柳下直也、土持和弘、新H、川原和也、荒谷信也、藤田弘、張L、池田R、藤井R、三浦直也、小宮信也、西岡和也、丸山I、深水A、中島T (2003 年 10 月)。 「関節症の新規病原因子としてのE3ユビキチンリガーゼであるシノビオリン/Hrd1」。遺伝子と発生。17 (19): 2436–49。土井：10.1101/gad.1096603。PMC 218080。PMID 12975321。
- ^ ab 「Entrez Gene: SYVN1 滑膜アポトーシス抑制因子 1、シノビオリン」。
さらに読む
- Simpson JC、Wellenreuther R、 Poustka A、Pepperkok R 、 Wiemann S (2000 年 9 月)。「大規模 cDNA シーケンシングによって同定された新規タンパク質の系統的細胞内局在」。EMBO レポート。1 ( 3 ): 287–92。doi :10.1093/embo-reports/kvd058。PMC 1083732。PMID 11256614。
- 長瀬 孝文、中山 正之、中島 大輔、菊野 亮、小原 修 (2001 年 4 月)。「未確認ヒト遺伝子のコード配列の予測。XX。in vitro で巨大タンパク質をコードする脳由来の 100 個の新しい cDNA クローンの完全配列」。DNA 研究。8 ( 2 ): 85–95。doi : 10.1093/dnares/8.2.85。PMID 11347906。
- 金子正人、石黒正人、新沼裕人、上杉正人、野村有紀 (2002 年 12 月)。 「ヒトHRD1はER関連分解を介してERストレス誘発性アポトーシスを防御する」。FEBS レター。532 (1-2): 147-52。土井：10.1016/S0014-5793(02)03660-8。PMID 12459480。S2CID 44570384 。
- Nadav E、Shmueli A、Barr H、 Gonen H、Ciechanover A、Reiss Y (2003 年 3 月)。「酵母 Hrd1 と相同性のある新しい哺乳類小胞体ユビキチンリガーゼ」。生化学および生物物理学的研究通信。303 (1): 91–7。doi : 10.1016 /S0006-291X(03)00279-1。PMID 12646171 。
- キッカート M、ドールマン R、ダイ M、アヴナー R、ハシンク G、ファン フォルデン S、セネダー S、ロイテルマン J、チャウ V、ヴィアーツ E (2004 年 1 月)。 「ヒトHRD1は、小胞体からのタンパク質の分解に関与するE3ユビキチンリガーゼです。」生物化学ジャーナル。279 (5): 3525–34。土井：10.1074/jbc.M307453200。PMID 14593114。
- Lilley BN、Ploegh HL (2005 年 10 月)。「転位、ユビキチン化、および小胞体膜からの誤って折り畳まれたタンパク質の抽出をリンクする多タンパク質複合体」。米国 科学アカデミー紀要。102 (40): 14296–301。Bibcode : 2005PNAS..10214296L。doi : 10.1073 / pnas.0505014102。PMC 1242303。PMID 16186509。
- Ye Y、Shibata Y、Kikkert M、van Voorden S、Wiertz E、Rapoport TA (2005 年 10 月)。「小胞体膜の逆転座部位への p97 ATPase およびユビキチンリガーゼのリクルートメント」。米国科学アカデミー紀要。102 (40): 14132–8。Bibcode : 2005PNAS..10214132Y。doi : 10.1073 / pnas.0505006102。PMC 1242302。PMID 16186510 。
- Schulze A、Standera S、Buerger E、Kikkert M、van Voorden S、Wiertz E、Koning F、Kloetzel PM、Seeger M (2005 年 12 月)。 「ユビキチンドメインタンパク質HERPは、小胞体関連分解経路の構成要素と複合体を形成します。」分子生物学ジャーナル。354 (5): 1021–7。土井：10.1016/j.jmb.2005.10.020。PMID 16289116。
- Lim J、Hao T、Shaw C、Patel AJ、Szabó G、Rual JF、Fisk CJ、Li N、Smolyar A、Hill DE、Barabási AL、Vidal M、Zoghbi HY (2006 年 5 月)。「ヒトの遺伝性運動失調症およびプルキンエ細胞変性症のタンパク質間相互作用ネットワーク」。Cell . 125 ( 4): 801–14. doi : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . PMID 16713569. S2CID 13709685。
- 山崎 哲也、柳下 直子、土持 和也、加藤 裕也、佐々木 哲也、天野 哲也、別府 正樹、青木 裕、中村 裕、西岡 和也、中島 哲也 (2006 年 7 月)。 「小胞体ストレスに対する耐性は、リウマチ性滑膜細胞が獲得した細胞特性です。」分子医学の国際ジャーナル。18 (1): 113-7。土井：10.3892/ijmm.18.1.113。PMID 16786162。
- Toh ML、Marotte H、Blond JL、Jhumka U、Eljaafari A、Mougin B、Miossec P (2006 年 7 月)。「関節リウマチ患者の末梢血および滑膜細胞におけるシノビオリンの過剰発現と、インフリキシマブ治療に反応しない患者における持続的な上昇」。関節炎とリウマチ。54 (7): 2109–18。doi : 10.1002/ art.21926。PMID 16802346 。
- Arteaga MF、Wang L、Ravid T、Hochstrasser M、Canessa CM (2006 年 7 月)。「両親媒性ヘリックスが血清およびグルココルチコイド誘導キナーゼ 1 を小胞体関連ユビキチン結合機構に標的化する」。米国科学アカデミー紀要。103 (30): 11178–83。Bibcode : 2006PNAS..10311178A。doi : 10.1073 / pnas.0604816103。PMC 1544061。PMID 16847254 。
- 大村 哲、金子 正樹、大熊 泰、オルバ ワイ、長島 和、高橋 隆、藤谷 直、松村 晋、秦 亜、久保田 和、村橋 和、上原 達、野村 裕 (2006 年 12 月)。 「ユビキチンリガーゼHRD1は、パーキンの基質であるPael受容体の分解を促進する」。神経化学ジャーナル。99 (6): 1456–69。土井：10.1111/j.1471-4159.2006.04155.x。hdl : 2115/17141。PMID 17059562。S2CID 6256027 。
- Yang H、Zhong X、Ballar P、Luo S、Shen Y、Rubinsztein DC、Monteiro MJ、Fang S (2007 年 2 月)。「ユビキチンリガーゼ Hrd1 はポリグルタミン拡張ハンチンチンの分解を促進し、毒性を抑制する」。実験細胞研究。313 (3): 538–50。doi :10.1016/ j.yexcr.2006.10.031。PMID 17141218 。
- 山崎誠、柳下直人、佐々木隆、中沢実、加藤勇、山寺隆、裵英、鳥山真、池田隆、張龍、藤谷和、兪栄、土持和、太田隆、新谷直、藤田英、荒谷真、江口 和、小宮 信、丸山 勇、東 N、佐藤 正、妹尾 英、越智 哲、横山 信、天野 哲、キム ジェイ、ゲイ S、深水 亜、西岡 和、田中 和、中島T (2007 年 1 月)。 「小胞体常在ユビキチンリガーゼ「シノビオリン」によるp53の細胞質破壊」。EMBO ジャーナル。26 (1): 113-22。土井：10.1038/sj.emboj.7601490。PMC 1782373。PMID 17170702。
外部リンク
