ヒトのタンパク質コード遺伝子
ホップス 利用可能な構造 ＰＤＢ オルソログ検索: PDBe RCSB
識別子 エイリアス HOPX 、カメオ、HOD、HOP、LAGY、NECC1、OB1、SMAP31、TOTO、HOPホメオボックス 外部ID オミム ：607275; MGI : 1916782; ホモロジーン : 15859; ジーンカード ：HOPX; OMA :HOPX - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 5番染色体（マウス） [2] バンド 5|5 C3.3 始める 77,234,835 bp [2] 終わり 77,262,968 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 太ももの皮 精巣上体 ヒップの皮膚 咽頭粘膜 人間のペニス 口腔 腹部の皮膚 外陰部 右肺 左肺の上葉
トップの表現 右肺葉 左肺 舌の上側 右心室 左心室の心筋組織 左肺葉 原腸胚 食道 心室中隔 膀胱移行上皮
参照表現データの詳細
バイオGPS 参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー 分子機能
DNA結合 タンパク質結合 DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的 細胞成分 生物学的プロセス
RNAポリメラーゼIIによる転写の調節 細胞分化の負の調節 多細胞生物の発達 転写の調節、DNAテンプレート 転写、DNAテンプレート 栄養外胚葉細胞の分化 シャペロンを介したタンパク質複合体の組み立て 細胞分化 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_001145459 NM_001145460 NM_032495 NM_139211 NM_139212
NM_001159900 NM_001159901 NM_175606
RefSeq (タンパク質) NP_001138931 NP_001138932 NP_115884 NP_631957 NP_631958
NP_001153372 NP_001153373 NP_783199
場所 (UCSC) 4 章: 56.65 – 56.68 Mb 5 章: 77.23 – 77.26 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
ホメオドメインのみのタンパク質 は、ヒトでは HOPX 遺伝子によってコードされる タンパク質 である 。 [5]これは 心臓の発達 の重要な調節因子であり [6] 、 海馬 神経幹細胞 の マーカー でもある。 [7] [8]
関数 この遺伝子によってコードされるタンパク質は、 DNA結合に必要な特定の保存残基を欠く ホメオドメイン タンパク質である。絨毛癌細胞株および組織はこの遺伝子を発現しないことが報告されており、この遺伝子が胎盤栄養芽細胞の悪性転換に関与している可能性が示唆されている。マウスの研究では、このタンパク質が血清応答因子（SRF）と相互作用し、SRF依存性の心臓特異的遺伝子発現および心臓発達を調節する可能性があることが示唆されている。 [6] 同じタンパク質をコードする複数の選択的スプライシング転写バリアントが観察されているが、そのうちのいくつかについてのみ全長の性質が決定されている。 [5]
参考文献
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さらに読む
Kook H、Epstein JA (2003 年 10 月)。「ビートに合わせてホッピング。ホップ による心臓遺伝子発現の調節」。Trends in Cardiovascular Medicine。13 ( 7): 261–264。doi :10.1016/S1050-1738(03)00107-5。PMID 14522464 。 Hartley JL、Temple GF、 Brasch MA (2000 年 11 月)。「in vitro 部位特異的組み換えを用いた DNA クローニング」。 ゲノム 研究 。10 ( 11): 1788–1795。doi :10.1101/gr.143000。PMC 310948。PMID 11076863 。 浅野間 和人、松田 哲也、近藤 英人、加藤 和也、岸野 哲也、新川 直也、他(2003 年 1 月)。 「NECC1、ホメオドメインコンセンサスモチーフをコードする絨毛癌抑制遺伝子の候補」。 ゲノミクス 。 81 (1): 15-25。 土井 ：10.1016/S0888-7543(02)00011-3。 PMID 12573257。 Chen Y、Petersen S、Pacyna-Gengelbach M、Pietas A、Petersen I (2003)。「肺癌でダウンレギュレーションされる新規ホメオボックス含有遺伝子 LAGY の同定」。 腫瘍 学 。64 ( 4 ): 450–458。doi : 10.1159 /000070306。PMID 12759545。S2CID 3205741。 Kook H、Lepore JJ、Gitler AD、Lu MM、Wing-Man Yung W、Mackay J、他 (2003 年 9 月)。「非定型ホメオドメインタンパク質 Hop を介した心臓肥大とヒストン脱アセチル化酵素依存性転写抑制」。The Journal of Clinical Investigation。112 ( 6 ): 863–871。doi :10.1172/JCI19137。PMC 193673。PMID 12975471 。 Adu J、Leong FT、Smith NR、Leek JP、Markham AF、Robinson PA、他 (2002 年 12 月)。「マウスの発達中における、新規の非定型 73 アミノ酸 K50 ホメオドメイン タンパク質 mOb1 の発現」。Mechanisms of Development。119。119 Suppl 1 ( Suppl 1): S43 – S47。doi : 10.1016/S0925-4773(03)00090- X。PMID 14516659。S2CID 11648378 。 Lemaire F, Millon R, Muller D, Rabouel Y, Bracco L, Abecassis J, et al. (2004 年 7 月). 「頭頸部扁平上皮癌における HOP 腫瘍抑制因子発現の消失」. British Journal of Cancer . 91 (2): 258–261. doi :10.1038/sj.bjc.6601952. PMC 2409811. PMID 15213722 . Pauws E、Sijmons GG、Yaka C、Ris-Stalpers C (2004 年 7 月)。「甲状腺癌で過剰発現する新規ホメオボックス遺伝子」。 甲状腺 。14 ( 7): 500–505。doi : 10.1089 /1050725041517020。PMID 15307938 。 Toruner GA、Ulger C、Alkan M、 Galante AT、Rinaggio J、Wilk R、他 (2004 年 10 月)。「口腔扁平上皮癌における遺伝子発現プロファイルと腫瘍浸潤との関連性」。Cancer Genetics and Cytogenetics。154 (1): 27–35。doi :10.1016/j.cancergencyto.2004.01.026。PMID 15381369 。 浅野 克己、加藤 秀、井上 剛、松田 剛、和気 暢（2004 年 8 月）。「絨毛癌の増殖抑制と栄養芽細胞の分化に関連する候補遺伝子の解析」生殖 医学 ジャーナル 49 (8): 617–626。PMID 15457851 。 Wiemann S、Arlt D、Huber W、Wellenreuther R、 Schleeger S 、 Mehrle A、他 (2004 年 10 月)。「ORFeome から生物学へ: 機能ゲノミクス パイプライン」。 ゲノム 研究 。14 ( 10B): 2136–2144。doi :10.1101/gr.2576704。PMC 528930。PMID 15489336 。 Mehrle A、Rosenfelder H、Schupp I、del Val C、Arlt D、Hahne F、他 (2006 年 1 月)。「2006 年の LIFEdb データベース」。 核酸 研究 。34 ( データベース 号 ): D415–D418。doi :10.1093/nar/gkj139。PMC 1347501。PMID 16381901 。 Kook H、Yung WW、Simpson RJ、Kee HJ 、 Shin S、Lowry JA、他 (2006 年 9 月)。「転写コレギュレーター HOP の構造と機能の分析」。 生化学 。45 ( 35): 10584–10590。doi :10.1021/bi060641s。PMID 16939210 。 Kee HJ、Kim JR、Nam KI、Park HY、Shin S、Kim JC、他 (2007 年 3 月)。「ポリコーム 1 のエンハンサーは、新規ホメオドメインのみのタンパク質結合パートナーであり、骨格筋の分化を誘導する」。The Journal of Biological Chemistry。282 ( 10): 7700–7709。doi : 10.1074/jbc.M611198200。PMID 17192267 。 Americo TA、Chiarini LB、Linden R (2007 年 6 月)。「ホップ/STI-1 によって誘導されるシグナル伝達はエンドサイトーシスに依存する」。 生化学 および生物物理学的研究通信 。358 (2): 620–625。doi :10.1016/ j.bbrc.2007.04.202。PMID 17498662 。
外部リンク 米国国立医学図書館の 医学主題標目表 (MeSH)における HOPX+タンパク質、+ヒト
この記事には、 パブリックドメイン である 米国国立医学図書館 のテキストが組み込まれています。
