ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| ヘルパド1 |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オルソログ検索: PDBe RCSB |
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| 識別子 |
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| エイリアス | HERPUD1、HERP、Mif1、SUP、ユビキチン様ドメイン1を持つホモシステイン誘導性ERタンパク質 |
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| 外部ID | オミム:608070; MGI : 1927406;ホモロジーン: 40973;ジーンカード:HERPUD1; OMA :HERPUD1 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 染色体8(マウス)[2] |
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| | バンド | 8|8 C5 | 始める | 95,113,066 bp [2] |
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| 終わり | 95,122,005 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 膵臓の体
- 眼瞼結膜
- 鼻咽頭上皮
- 扁桃腺
- 気管
- 脛骨
- 壁側胸膜
- 直腸
- 嗅球
- 幽門
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| | トップの表現 | - 涙腺
- 耳下腺
- 右腎臓
- 精嚢
- 顎下腺
- 肝臓の左葉
- ランゲルハンス島
- 幽門洞
- 頭蓋冠
- 胆嚢
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS |  | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- 膜貫通トランスポーター結合
- タンパク質結合
- 分子機能
- ユビキチンリガーゼ基質アダプター活性
| | 細胞成分 |
- 膜の不可欠な構成要素
- レビー小体コア
- カルシウムチャネル複合体
- 小胞体膜
- 膜
- 小胞体
| | 生物学的プロセス |
- 小胞体ストレス誘導性内因性アポトーシスシグナル伝達経路の負の制御
- アポトーシス過程に関与するシステイン型エンドペプチダーゼ活性の負の調節
- ユビキチン依存性タンパク質分解プロセス
- 内因性アポトーシスシグナル伝達経路の負の調節
- タンパク質のユビキチン化の制御
- 小胞体ストレス誘導性内因性アポトーシスシグナル伝達経路の調節
- 細胞カルシウムイオン恒常性
- 小胞体カルシウムイオン恒常性
- 小胞体ストレスへの反応
- PERKを介した未折り畳みタンパク質応答
- ER関連ユビキチン依存性タンパク質分解プロセスの正の制御
- ER関連ユビキチン依存性タンパク質分解過程の調節
- 折り畳まれていないタンパク質に対する反応
- 逆行性タンパク質輸送、ERからサイトゾルへ
- タンパク質結合の正の調節
- 小胞体未折り畳みタンパク質応答
- タンパク質のユビキチン化
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_001010989 NM_001010990 NM_001272103 NM_014685 |
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| RefSeq (タンパク質) | |
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NP_001010989 NP_001259032 NP_055500 NP_001259032.1 |
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| 場所 (UCSC) | 16 章: 56.93 – 56.94 Mb | 8 章: 95.11 – 95.12 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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ホモシステイン応答性小胞体ユビキチン様ドメインメンバー1タンパク質は、ヒトではHERPUD1遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6] [7]
小胞体 (ER) における未折り畳みタンパク質の蓄積は、ER ストレス応答を引き起こします。この応答には、未折り畳みタンパク質のさらなる蓄積を防ぐための翻訳の阻害、未折り畳みタンパク質応答 (UPR) として知られるポリペプチド折り畳みに関与するタンパク質の発現増加、およびER 関連タンパク質分解 (ERAD)システムによるミスフォールドタンパク質の破壊が含まれます。この遺伝子は UPR と ERAD の両方で役割を果たす可能性があります。その発現は UPR によって誘導され、プロモーター領域に ER ストレス応答要素を持ち、コードされるタンパク質には ERAD システムと相互作用する可能性のある N 末端ユビキチン様ドメインがあります。このタンパク質はプレセニリンタンパク質と相互作用し、過剰発現後にアミロイドベータタンパク質のレベルを上昇させることが示されています。この遺伝子の選択的スプライシングにより、複数の転写バリアントが生成され、いくつかは異なるアイソフォームをコードします。すべての転写バリアントの全長の性質は決定されていません。[7]
インタラクション
HERPUD1はUBQLN1 [8]およびUBQLN2 [8]と相互作用することが示されている。
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000051108 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000031770 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Kokame K, Agarwala KL, Kato H, Miyata T (2000 年 10 月). 「Herp、小胞体ストレスによって誘導される新しいユビキチン様膜タンパク質」. The Journal of Biological Chemistry . 275 (42): 32846–53. doi : 10.1074/jbc.M002063200 . PMID 10922362.
- ^ ファン ラール T、スハウテン T、フーガーヴォルスト E、ファン エック M、ファン デル Eb AJ、テルレス C (2000 年 3 月)。 「新規MMS誘導性遺伝子Mif1/KIAA0025は、折り畳まれていないタンパク質応答経路の標的である。」FEBS レター。469 (1): 123-31。土井:10.1016/S0014-5793(00)01253-9。PMID 10708769。S2CID 6419566 。
- ^ ab 「Entrez 遺伝子: HERPUD1 ホモシステイン誘導性、小胞体ストレス誘導性、ユビキチン様ドメインメンバー 1」。
- ^ ab Kim TY、Kim E、Yoon SK、Yoon JB (2008 年 5 月)。「Herp はユビキリンをリクルートすることで ER 関連タンパク質の分解を促進する」。生化学および生物物理学的研究通信。369 (2): 741–6。doi :10.1016/ j.bbrc.2008.02.086。PMID 18307982 。
さらに読む
- van Laar T、van der Eb AJ、Terleth C (2001 年 6 月)。「Mif1: 折り畳まれていないタンパク質の応答経路と ER関連タンパク質の分解との間の失われたリンク?」Current Protein & Peptide Science。2 ( 2): 169–90。doi : 10.2174 /1389203013381189。PMID 12370023 。
- Nomura N, Miyajima N, Sazuka T, Tanaka A, Kawarabayasi Y, Sato S, et al. (1995). 「未確認ヒト遺伝子のコード配列の予測。I. ヒト未熟骨髄細胞株 KG-1 からランダムにサンプリングした cDNA クローンの分析により推定された 40 個の新しい遺伝子 (KIAA0001-KIAA0040) のコード配列」。DNA 研究。1 ( 1 ) : 27–35。doi : 10.1093/ dnares /1.1.27。PMID 7584026 。
- Maruyama K, Sugano S (1994年1月). 「オリゴキャッピング: 真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置換する簡単な方法」. Gene . 138 (1–2): 171–4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Andersson B、 Wentland MA、Ricafrente JY、Liu W 、 Gibbs RA (1996 年 4 月)。「改良されたショットガン ライブラリ構築のための「ダブル アダプター」法」。Analytical Biochemistry。236 ( 1): 107–13。doi :10.1006/abio.1996.0138。PMID 8619474 。
- Yu W、Andersson B、Worley KC、Muzny DM、Ding Y 、 Liu W、他 (1997 年 4 月)。「大規模連結 cDNA シーケンシング」。 ゲノム研究。7 ( 4): 353–8。doi : 10.1101/gr.7.4.353。PMC 139146。PMID 9110174。
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997年10月). 「全長濃縮cDNAライブラリーおよび5'末端濃縮cDNAライブラリーの構築と特性評価」. Gene . 200 (1–2): 149–56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
- Kokame K、Kato H 、 Miyata T (2001 年 3 月)。「ATF6 依存性哺乳類非折り畳みタンパク質応答を担う新しいシス作用要素 ERSE-II の同定」。The Journal of Biological Chemistry。276 ( 12): 9199–205。doi : 10.1074/ jbc.M010486200。PMID 11112790。
- Sai X、Kawamura Y、Kokame K、Yamaguchi H、Shiraishi H、Suzuki R、他 (2002 年 4 月)。「小胞体ストレス誘導性タンパク質 Herp はプレセニリンを介したアミロイド β タンパク質の生成を促進する」。The Journal of Biological Chemistry . 277 (15): 12915–20. doi : 10.1074/jbc.M112372200 . PMID 11799129。
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- Sai X、Kokame K、Shiraishi H、Kawamura Y、Miyata T、Yanagisawa K、Komano H (2003 年 10 月)。「Herp のユビキチン様ドメインは Herp の分解に関与しているが、アミロイド β タンパク質生成の促進には必須ではない」。FEBS Letters。553 ( 1–2 ) : 151–6。doi : 10.1016 /S0014-5793(03) 01009-3。PMID 14550564。S2CID 1109038 。
- Schulze A、Standera S、Buerger E、Kikkert M、van Voorden S、Wiertz E、他 (2005 年 12 月)。「ユビキチンドメインタンパク質 HERP は、小胞体関連分解経路の成分と複合体を形成する」。Journal of Molecular Biology。354 ( 5): 1021–7。doi :10.1016/ j.jmb.2005.10.020。PMID 16289116 。
- Lim J、Hao T、Shaw C、Patel AJ、Szabó G、Rual JF、他 (2006 年 5 月)。「ヒト遺伝性運動失調症およびプルキンエ細胞変性症のタンパク質間相互作用ネットワーク」。Cell . 125 (4): 801–14. doi : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . PMID 16713569. S2CID 13709685。
- Liang G、Audas TE、Li Y、Cockram GP、Dean JD、Martyn AC、他 (2006 年 11 月)。「Luman/CREB3 は、ER ストレス応答エレメントを介して小胞体 (ER) ストレス応答タンパク質 Herp の転写を誘導する」。分子 細胞生物学。26 (21 ) : 7999–8010。doi :10.1128/MCB.01046-06。PMC 1636730。PMID 16940180。
- Lenz B、Bleich S、Beutler S、Schlierf B、Schwager K、Reulbach U、他 (2006 年 12 月)。「ホモシステインが AARE および CREB 結合部位に関与する DNA メチル化によって Herp の発現を制御する」。実験細胞研究。312 (20): 4049–55。doi :10.1016/ j.yexcr.2006.09.004。PMID 17020760 。