ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| GPC6 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | GPC6、OMIMD1、グリピカン6 |
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| 外部ID | オミム:604404; MGI : 1346322;ホモロジーン: 55922;ジーンカード:GPC6; OMA :GPC6 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 14番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 14|14 E4 | 始める | 117,162,727 bp [2] |
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| 終わり | 118,213,956 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 軟骨組織
- 脛骨
- 大静脈
- 浅側頭動脈
- 伏在静脈
- 精嚢
- 膵臓上皮細胞
- 脊髄神経節
- 滑膜
- 精巣上体頭
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| | トップの表現 | - 上行大動脈
- 大動脈弁
- 外頸動脈
- 内頸動脈
- 坐骨神経
- 性器結節
- 上顎突出
- 下顎突出
- 胎児の尾
- 人間の胎児
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- ヘパラン硫酸プロテオグリカン結合
- Wntシグナル伝達経路、平面細胞極性経路に関与する共受容体活性
- タンパク質結合
| | 細胞成分 |
- ゴルジ体腔
- 核
- 細胞膜の不可欠な構成要素
- 細胞外領域
- 膜の固定された構成要素
- リソソーム腔
- 膜
- 細胞膜
- 細胞外空間
- 細胞膜の固定成分
- コラーゲン含有細胞外マトリックス
- グルタミン酸シナプス
- 細胞表面
- シナプス
| | 生物学的プロセス |
- グリコサミノグリカン代謝プロセス
- レチノイド代謝プロセス
- 細胞移動
- グリコサミノグリカンの生合成プロセス
- グリコサミノグリカンの分解過程
- Wntシグナル伝達経路、平面細胞極性経路
- シグナル伝達の調節
- 神経伝達物質受容体のシナプス後特殊化膜への局在の制御
- 膜へのタンパク質局在の制御
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| ウィキデータ |
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グリピカン6は、ヒトではGPC6遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
グリピカンは、グリコシルホスファチジルイノシトールで固定されたヘパラン硫酸プロテオグリカンのファミリーを構成します。グリピカンは、細胞の成長と分裂の制御に関与していると考えられています。グリピカン6は、成長因子、細胞外マトリックスタンパク質、プロテアーゼ、抗プロテアーゼの推定細胞表面受容体です。[6]
参照
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000183098 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000058571 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Paine- Saunders S、Viviano BL、Saunders S (1999 年 8 月)。「グリピカン遺伝子ファミリーの新規メンバーである GPC6 は、GPC4 と構造的に関連する産物をコードし、ヒト染色体 13 上で GPC5 と共存しています」。Genomics . 57 (3): 455–8. doi :10.1006/geno.1999.5793. PMID 10329016。
- ^ ab "Entrez Gene: GPC6 グリピカン 6".
さらに読む
- Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの現状、品質、拡大: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。
- Dunham A、Matthews LH、Burton J、他 (2004)。「ヒト染色体 13 の DNA 配列と分析」。Nature 428 ( 6982 ) : 522–8。Bibcode : 2004Natur.428..522D。doi : 10.1038 /nature02379。PMC 2665288。PMID 15057823。
- Clark HF、Gurney AL、Abaya E、他 (2003)。「分泌タンパク質発見イニシアチブ (SPDI)、新規ヒト分泌タンパク質および膜貫通タンパク質を同定するための大規模な取り組み: バイオインフォマティクス評価」。Genome Res . 13 (10): 2265–70. doi :10.1101/gr.1293003. PMC 403697. PMID 12975309 。
- Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
- Veugelers M、De Cat B、Ceulemans H、et al. (1999)。「グリピカン-6、細胞表面ヘパラン硫酸プロテオグリカンのグリピカンファミリーの新しいメンバー」。J . Biol. Chem . 274 (38): 26968–77. doi : 10.1074/jbc.274.38.26968 . PMID 10480909。
- Watanabe K, Yamada H, Yamaguchi Y (1995). 「K-グリピカン:発達中の脳と腎臓で高度に発現する新規GPIアンカー型ヘパラン硫酸プロテオグリカン」J. Cell Biol . 130 (5): 1207–18. doi :10.1083/jcb.130.5.1207. PMC 2120559. PMID 7657705 .
外部リンク