ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| ARHGAP35 |
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| 利用可能な構造 |
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| 電子データ | オルソログ検索: PDBe RCSB |
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| PDB IDコードのリスト |
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2K85、3C5H、3FK2 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | ARHGAP35、GRF-1、GRLF1、P190-A、P190A、p190ARhoGAP、p190RhoGAP、Rho GTPase活性化タンパク質35 |
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| 外部ID | オミム: 605277; MGI : 1929494;ホモロジーン: 35136;ジーンカード:ARHGAP35; OMA :ARHGAP35 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 染色体7(マウス)[2] |
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| | バンド | 7|7 A2 | 始める | 16,227,644 bp [2] |
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| 終わり | 16,348,918 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - ブロードマン領域23
- 内皮細胞
- 中側頭回
- 中心後回
- 嗅内皮質
- 上前庭核
- 左精巣
- 緻密部
- 上前頭回
- 右精巣
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| | トップの表現 | - 球形嚢
- 耳板
- 性器結節
- 耳小胞
- 胎児の尾
- 海馬歯状回顆粒細胞
- 視覚野
- 一次視覚野
- 上前頭回
- 二次卵母細胞
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- DNA結合
- RNAポリメラーゼII転写調節領域配列特異的DNA結合
- 転写コリプレッサー活性
- GTP結合
- DNA結合転写抑制活性、RNAポリメラーゼII特異的
- リン脂質結合
- GTPase活性化活性
- GTPase活性
- ヌクレオチド結合
- 脂質結合
| | 細胞成分 |
- 細胞質
- 細胞質
- アクチン細胞骨格
- 核
- 細胞骨格
- 細胞投影
- 細胞膜
- 膜
- 毛様体基底小体
| | 生物学的プロセス |
- 転写の調節、DNAテンプレート
- Rhoタンパク質シグナル伝達の負の制御
- RNAポリメラーゼIIによる転写の負の制御
- 転写、DNAテンプレート
- 神経管閉鎖
- 細胞形状の調節
- 前脳の発達
- カメラ型眼の開発
- 転写の負の調節、DNAテンプレート
- 低分子量GTPaseを介したシグナル伝達の制御
- シグナル伝達
- 血管透過性の負の調節
- GTPase活性の正の調節
- 軸索誘導
- 軸索線維束性収縮
- アクチンの重合または脱重合の調節
- ニューロン投射発達の正の調節
- 細胞移動
- 中枢神経系ニューロン軸索形成
- 乳腺の発達
- アクチン細胞骨格極性の確立または維持
- 細胞外刺激に対する細胞反応
- アクチン細胞骨格組織の制御
- 傷の治癒、細胞の拡散
- 繊毛形成の正の調節
- 軸索形成の調節
- ニューロン投射ガイダンス
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| ウィキデータ |
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グルココルチコイド受容体DNA結合因子1は、ヒトではGRLF1遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
関数
ヒトグルココルチコイド受容体 DNA 結合因子は、グルココルチコイド受容体遺伝子 (hGR 遺伝子) のプロモーター領域と関連し、グルココルチコイド受容体転写のリプレッサーです。cDNA 配列から推定されるアミノ酸配列には、ジンクフィンガーに特徴的な 3 つの配列モチーフと、ロイシンの代わりに 1 つのシステインが見つかるロイシンジッパーを示唆する 1 つのモチーフの存在が示されています。GRLF1 は、野生型 hGR 遺伝子発現の相同ダウンレギュレーションを強化します。生化学分析では、GRLF1 の相互作用は配列特異的であり、GRLF1 の転写効率は特定の配列モチーフとの相互作用を通じて制御されることが示唆されています。発現レベルはグルココルチコイドによって制御されます。[6]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000160007 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000058230 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ LeClerc S、Palaniswami R、Xie BX、Govindan MV (1991年9月)。「ヒトグルココルチコイド受容体遺伝子に結合し、その発現を抑制する因子の分子クローニングと特性評価」。The Journal of Biological Chemistry。266 ( 26): 17333–40。doi : 10.1016/S0021-9258(19)47378- X。PMID 1894621 。
- ^ ab 「Entrez Gene: GRLF1 グルココルチコイド受容体 DNA 結合因子 1」。
さらに読む
- 中島 D、岡崎 N、山川 H、菊野 R、大原 O、長瀬 T (2002 年 6 月)。 「KIAA 遺伝子の発現準備が整った cDNA クローンの構築: 330 個の KIAA cDNA クローンの手動キュレーション」。DNA 研究。9 (3): 99-106。土井:10.1093/dnares/9.3.99。PMID 12168954。
- Warriar N、Pagé N 、Govindan MV (1996 年 8 月)。「ヒトグルココルチコイド受容体遺伝子の発現と核タンパク質 と転写制御要素との相互作用」。The Journal of Biological Chemistry。271 ( 31): 18662–71。doi : 10.1074/jbc.271.31.18662。PMID 8702520。
- Tikoo A、Czekay S、Viars C、White S、Heath JK、Arden K、Maruta H (2000 年 10 月)。「ヒト腫瘍抑制遺伝子 p190-A は、一部の神経膠腫で欠失していると報告されている染色体領域 19q13.3 にマッピングされます」。Gene . 257 ( 1 ): 23–31。doi :10.1016/S0378-1119(00)00387-5。PMID 11054565 。
- 永瀬 剛、菊野 亮、服部 明、近藤 裕、奥村 功、小原 修 (2000 年 12 月)。「未確認ヒト遺伝子のコード配列の予測。XIX。in vitro で大型タンパク質をコードする脳由来の 100 個の新しい cDNA クローンの完全配列」 。DNA研究。7 ( 6 ): 347–55。doi : 10.1093/dnares/7.6.347。PMID 11214970。
- Beausoleil SA、Jedrychowski M、Schwartz D、Elias JE、Villén J、Li J、Cohn MA、Cantley LC、Gygi SP (2004 年 8 月)。「HeLa 細胞核リン酸化タンパク質の大規模特性評価」。米国科学アカデミー紀要。101 (33): 12130–5。Bibcode : 2004PNAS..10112130B。doi : 10.1073 / pnas.0404720101。PMC 514446。PMID 15302935。
- Rush J、Moritz A、Lee KA、Guo A、Goss VL、Spek EJ、Zhang H、Zha XM、Polakiewicz RD、Comb MJ (2005 年 1 月)。「がん細胞におけるチロシンリン酸化の免疫親和性プロファイリング」。Nature Biotechnology 23 ( 1): 94–101. doi :10.1038/nbt1046. PMID 15592455. S2CID 7200157.
- Barberis D、Casazza A、Sordella R、Corso S、Artigiani S、Settleman J、Comoglio PM、Tamagnone L (2005 年 10 月)。「p190 Rho-GTPase 活性化タンパク質はプレキシンと関連し、セマフォリンシグナル伝達に必要である」( PDF ) 。Journal of Cell Science。118 ( Pt 20): 4689–700。doi : 10.1242/ jcs.02590。PMID 16188938。S2CID 15559113 。
- Holinstat M、Knezevic N、Broman M、Samarel AM、Malik AB、Mehta D (2006 年 1 月)。「フォーカル アドヒージョン キナーゼ誘導による p190RhoGAP 活性化による RhoA 活性の抑制: 内皮透過性の調節における役割」。The Journal of Biological Chemistry。281 ( 4): 2296–305。doi : 10.1074/ jbc.M511248200。PMID 16308318。
- Oh JH、Yang JO、Hahn Y、Kim MR、Byun SS、Jeon YJ、Kim JM、Song KS、Noh SM、Kim S、Yoo HS、Kim YS、Kim NS (2005 年 12 月)。「ヒト胃癌のトランスクリプトーム解析」。哺乳類 ゲノム。16 ( 12): 942–54。doi : 10.1007 /s00335-005-0075-2。PMID 16341674。S2CID 69278 。
- Olsen JV、Blagoev B、Gnad F、Macek B、Kumar C、Mortensen P、Mann M (2006 年 11 月)。「シグナル伝達ネットワークにおける全体的、生体内、および部位特異的なリン酸化ダイナミクス」。Cell . 127 ( 3): 635–48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983. S2CID 7827573。
- Mammoto T、Parikh SM、Mammoto A、Gallagher D、Chan B、Mostoslavsky G、Ingber DE、Sukhatme VP (2007 年 8 月)。「Angiopoietin-1 は、生体内で血管漏出を防ぐために p190 RhoGAP を必要とする」。The Journal of Biological Chemistry。282 ( 33): 23910–8。doi : 10.1074/jbc.M702169200。PMID 17562701。
外部リンク
この記事には、パブリックドメインである米国国立医学図書館のテキストが組み込まれています。