ヒトのタンパク質コード遺伝子
ガルント6 識別子 エイリアス GALNT6 、GALNAC-T6、GalNAcT6、ポリペプチド N-アセチルガラクトサミニルトランスフェラーゼ 6 外部ID オミム ：605148; MGI : 1891640; ホモロジーン : 5218; ジーンカード ：GALNT6; OMA :GALNT6 - オルソログ RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 耳下腺 気管 精巣上体 気管支上皮細胞 幽門 小腸粘膜 十二指腸 子宮内膜間質細胞 単球 脳梁
参照表現データの詳細
バイオGPS 参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー 分子機能
炭水化物結合 グリコシルトランスフェラーゼ活性 金属イオン結合 トランスフェラーゼ活性 ポリペプチドN-アセチルガラクトサミニルトランスフェラーゼ活性 細胞成分
膜 細胞質の核周囲領域 ゴルジ膜 膜の不可欠な構成要素 ゴルジ体 生物学的プロセス
O-グリカン処理 タンパク質のO結合型糖鎖 タンパク質の糖化 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_001161767 NM_001161768 NM_172451
RefSeq (タンパク質) NP_001155239 NP_001155240 NP_766039
場所 (UCSC) 12 章: 51.35 – 51.39 Mb 該当なし PubMed 検索 [2] [3]
ウィキデータ
ポリペプチドN-アセチルガラクトサミニルトランスフェラーゼ6 は、ヒトでは GALNT6 遺伝子によってコードされる 酵素 である 。 [4] [5]
この遺伝子は、UDP-N-アセチル-α-D-ガラクトサミン:ポリペプチド N-アセチルガラクトサミニルトランスフェラーゼ (GalNAc-T) ファミリーの酵素のメンバーをコードします。GalNAc-T は、標的タンパク質のセリンおよびスレオニン残基への GalNAc の転移を触媒することにより、ゴルジ体でムチン型 O 結合型グリコシル化を開始します。これらは、N 末端膜貫通ドメイン、ステム領域、GT1 モチーフおよび Gal/GalNAc トランスフェラーゼ モチーフを含む内腔触媒ドメイン、および C 末端リシン/レクチン様ドメインによって特徴付けられます。GalNAc-T は、異なるが重複する基質特異性と発現パターンを持っています。コードされたタンパク質は、in vitro でフィブロネクチン ペプチドをグリコシル化することができ、線維芽細胞株で発現されることから、癌胎児性フィブロネクチンの合成に関与している可能性が示唆されます。 [5]
参考文献
^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000139629 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ 「Human PubMed Reference:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ Bennett EP、Hassan H、Mandel U、Hollingsworth MA、Akisawa N、Ikematsu Y、Merkx G、van Kessel AG、Olofsson S、Clausen H (1999 年 10 月)。「ヒト UDP-N-アセチル-α-D-ガラクトサミン:ポリペプチド N-アセチルガラクトサミン転移酵素-T3 の近縁ホモログ (GalNAc-T6 と命名) のクローニングと特性解析。機能的冗長性ではなく遺伝的冗長性の証拠」。J Biol Chem . 274 (36): 25362–70。doi : 10.1074 /jbc.274.36.25362。hdl : 2066 / 184726。PMID 10464263 。 ^ ab "Entrez Gene: GALNT6 UDP-N-アセチル-アルファ-D-ガラクトサミン:ポリペプチド N-アセチルガラクトサミニルトランスフェラーゼ 6 (GalNAc-T6)"。
さらに読む
Maruyama K, Sugano S (1994). 「オリゴキャッピング：真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置き換える簡単な方法」 Gene . 138 (1–2): 171–4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298. Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, et al. (1997). 「全長濃縮および5'末端濃縮cDNAライブラリーの構築と特性評価」. Gene . 200 (1–2): 149–56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149. Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932 。 Argüeso P、Tisdale A、Mandel U、et al. (2003)。「眼表面上皮における GalNAc トランスフェラーゼの細胞層および細胞タイプ特異的分布は角質化中に変化する」。Invest . Ophthalmol. Vis. Sci . 44 (1): 86–92. doi : 10.1167/iovs.02-0181 . PMID 12506059。 太田 孝文、鈴木 勇、西川 孝文、他 (2004)。「21,243 個の完全長ヒト cDNA の完全な配列決定と特性解析」。Nat . Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039。 Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの状況、品質、および拡張: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。 Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。 Otsuki T, Ota T, Nishikawa T, et al. (2007). 「オリゴキャップ cDNA ライブラリーから分泌タンパク質または膜タンパク質をコードする全長ヒト cDNA を選択するためのシリコでのシグナル配列とキーワードトラップ」。DNA Res . 12 (2): 117–26. doi : 10.1093/dnares/12.2.117 . PMID 16303743。 Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, et al. (2006). 「転写調節の多様化: ヒト遺伝子の推定代替プロモーターの大規模な同定と特性評価」 Genome Res . 16 (1): 55–65. doi :10.1101/gr.4039406. PMC 1356129. PMID 16344560 .
