ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
GABPB1 利用可能な構造 電子データ オルソログ検索: PDBe RCSB
識別子 エイリアス GABPB1 、BABPB2、E4TF1、E4TF1-47、E4TF1-53、E4TF1B、GABPB、GABPB2、NRF2B1、NRF2B2、GABPB-1、GA 結合タンパク質転写因子ベータサブユニット 1、GA 結合タンパク質転写因子サブユニット ベータ 1 外部ID オミム ：600610; MGI : 95611; ホモロジーン : 7723; ジーンカード ：GABPB1; OMA :GABPB1 - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 染色体2（マウス） [2] バンド 2 F1|2 61.76 cM 始める 126,469,362 bp [2] 終わり 126,518,257 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 二次卵母細胞 軟骨組織 骨髄細胞 心室帯 神経節隆起 アキレス腱 子宮内膜間質細胞 睾丸 生殖腺 乳管
トップの表現 胎児の尾 心室帯 顆粒球 性器結節 胸腺 神経節隆起 胚葉上層 精子細胞 胚 一次卵母細胞
参照表現データの詳細
バイオGPS 参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー 分子機能
DNA結合転写因子活性 タンパク質ヘテロ二量体形成活性 タンパク質結合 細胞成分 生物学的プロセス
転写の調節、DNAテンプレート ミトコンドリア組織 RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御 RNAポリメラーゼIIによる転写の調節 転写、DNAテンプレート 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_002041 NM_005254 NM_016654 NM_016655 NM_181427 NM_001320910 NM_001320915
NM_001271467 NM_001271468 NM_001271469 NM_001271470 NM_001271492 NM_010249 NM_207669 NM_001355108 NM_001355109
RefSeq (タンパク質) NP_001307839 NP_001307844 NP_002032 NP_005245 NP_057738 NP_057739 NP_852092 NP_057738.1
NP_001258396 NP_001258397 NP_001258398 NP_001258399 NP_001258421 NP_034379 NP_997552 NP_001342037 NP_001342038 NP_001393121 NP_001393122 NP_001393123 NP_001393124 NP_001393125 NP_001393126 NP_001393127 NP_001393128 NP_001393129 NP_001393130 NP_001393131 NP_001393132 NP_001393133 NP_001393134 NP_001393135 NP_001393136 NP_001393137 NP_001393138 NP_001393139 NP_001393140 NP_001393141 NP_001393142 NP_001393143 NP_001393144 NP_001393145 NP_001393146 NP_001393147 NP_001393148 NP_001393149 NP_001393150 NP_001393151 NP_001393152 NP_001393153 NP_001393154 NP_001393155 NP_001393156
場所 (UCSC) 15章: 50.28 – 50.36 Mb 2 章: 126.47 – 126.52 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
GA結合タンパク質サブユニットβ-1 は、ヒトでは GABPB1 遺伝子によってコードされる タンパク質 である 。 [5] [6]
この遺伝子は、GA結合タンパク質転写因子、βサブユニットをコードしています。このタンパク質はαサブユニットと四量体複合体を形成し、標的遺伝子の転写を刺激します。コードされているタンパク質は、シトクロム酸化酵素発現の活性化とミトコンドリア機能の核制御に関与している可能性があります。マウスの類似タンパク質の結晶構造は、三量体タンパク質複合体として解明されています。この遺伝子には、異なるアイソフォームをコードする複数の転写バリアントが特定されています。 [6]
参考文献
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さらに読む
Sawada J, Goto M, Watanabe H, et al. (1995). 「転写因子E4TF1の2つのサブユニットのヒト染色体への領域マッピング」 Jpn. J. Cancer Res . 86 (1): 10–2. doi :10.1111/j.1349-7006.1995.tb02981.x. PMC 5920589 . PMID 7737900. Gugneja S、Virbasius JV、Scarpulla RC (1995)。「ヒト核呼吸因子2の4つの構造的に異なる非DNA結合サブユニットは、保存された転写活性化ドメインを共有している」。Mol . Cell. Biol . 15 (1): 102–11. doi :10.1128/MCB.15.1.102. PMC 231915. PMID 7799916 。 Virbasius JV、Virbasius CA、Scarpulla RC (1993)。「GABP とシトクロム酸化酵素発現のマルチサブユニット活性化因子 NRF-2 の同一性は、ウイルスプロモーターの ETS ドメイン活性化因子の細胞内役割を明らかにする」。Genes Dev . 7 (3): 380–92. doi : 10.1101/gad.7.3.380 . PMID 8383622。 Watanabe H, Sawada J, Yano K, et al. (1993). 「Ets および notch モチーフを持つ転写因子 E4TF1 サブユニットの cDNA クローニング」 Mol. Cell. Biol . 13 (3): 1385–91. doi :10.1128/MCB.13.3.1385. PMC 359448. PMID 8441384 . Gugneja S、Virbasius CM、Scarpulla RC (1996)。「核呼吸因子 1 および 2 は、類似したグルタミン含有疎水性残基クラスターを利用して転写を活性化する」。Mol . Cell. Biol . 16 (10): 5708–16. doi :10.1128/mcb.16.10.5708. PMC 231571. PMID 8816484 。 Sawa C, Goto M, Suzuki F, et al. (1997). 「核局在と転写活性化に必要な転写因子hGABP beta1/E4TF1-53の機能ドメイン」。 Nucleic Acids Res . 24 (24): 4954–61. doi :10.1093/nar/24.24.4954. PMC 146336 . PMID 9016666. Sowa Y, Shiio Y, Fujita T, et al. (1997). 「ヒトRB遺伝子のコアプロモーター領域にある網膜芽細胞腫結合因子1部位はhGABP/E4TF1によって活性化される」。Cancer Res . 57 (15): 3145–8. PMID 9242441。 Batchelor AH、Piper DE、de la Brousse FC、他 (1998)。「GABPalpha/beta の構造: DNA に結合した ETS ドメイン-アンキリンリピートヘテロダイマー」。Science . 279 ( 5353): 1037–41。Bibcode : 1998Sci ...279.1037B。doi :10.1126 / science.279.5353.1037。PMID 9461436 。 Suzuki F, Goto M, Sawa C, et al. (1998). 「転写因子ヒトGA結合タンパク質サブユニットの機能的相互作用」 J. Biol. Chem . 273 (45): 29302–8. doi : 10.1074/jbc.273.45.29302 . PMID 9792629. Sawada J, Simizu N, Suzuki F, et al. (2000). 「hGABP と活性化転写因子/cAMP 応答エレメント結合タンパク質ファミリーの選択メンバーによる相乗的転写活性化」 J. Biol. Chem . 274 (50): 35475–82. doi : 10.1074/jbc.274.50.35475 . PMID 10585419. Vogel JL、Kristie TM (2000)。「新規コアクチベーター C1 (HCF) は多タンパク質エンハンサー形成を調整し、GABP による転写活性化を媒介する」。EMBO J. 19 ( 4): 683–90. doi :10.1093/emboj/19.4.683. PMC 305606. PMID 10675337 。 Sawa C, Yoshikawa T, Matsuda-Suzuki F, et al. (2002). 「YEAF1/RYBP と YAF-2 は、YY1 および E4TF1/hGABP 転写因子の補因子ファミリーの機能的に異なるメンバーです」。J . Biol. Chem . 277 (25): 22484–90. doi : 10.1074/jbc.M203060200 . PMID 11953439。 Marie S、Race V、Nassogne MC、他 (2002)。「アデニロコハク酸リアーゼ欠損症患者 3 名における ADSL 遺伝子の 5' 非翻訳領域における核呼吸因子 2 結合部位の変異」。Am . J. Hum. Genet . 71 (1): 14–21. doi :10.1086/341036. PMC 384970. PMID 12016589 。 Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932 。 Rual JF、Venkatesan K、Hao T、他 (2005)。「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。Nature . 437 ( 7062 ) : 1173–8。Bibcode :2005Natur.437.1173R。doi : 10.1038 /nature04209。PMID 16189514。S2CID 4427026。 Jeong BC 、Kim MY、Lee JH、他 (2006)。「脳特異的血管新生抑制因子 2 は転写抑制因子として機能する GABP を介して VEGF を制御する」。FEBS Lett . 580 (2 ) : 669–76。Bibcode : 2006FEBSL.580..669J。doi : 10.1016 /j.febslet.2005.12.086。PMID 16412436。S2CID 35468847。 Lim J 、Hao T、Shaw C、他 (2006)。「ヒト遺伝性運動失調症およびプルキンエ細胞変性症のタンパク質間相互作用ネットワーク」。Cell . 125 (4): 801–14. doi : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . PMID 16713569. S2CID 13709685。
外部リンク
この記事には、 パブリックドメイン である 米国国立医学図書館 のテキストが組み込まれています。
