ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| FKBP8 |
|---|
 |
| 利用可能な構造 |
|---|
| 電子データ | オルソログ検索: PDBe RCSB |
|---|
| PDB IDコードのリスト |
|---|
2AWG、2D9F、2F2D、2MF9、3EY6 |
|
|
| 識別子 |
|---|
| エイリアス | FKBP8、FKBP38、FKBPr38、FK506 結合タンパク質 8、FKBP プロリルイソメラーゼ 8 |
|---|
| 外部ID | オミム:604840; MGI : 1341070;ホモロジーン:7720;ジーンカード:FKBP8; OMA :FKBP8 - オルソログ |
|---|
|
| 遺伝子の位置(マウス) |
|---|
 | | クロ。 | 染色体8(マウス)[2] |
|---|
| | バンド | 8|8 B3.3 | 始める | 70,980,374 bp [2] |
|---|
| 終わり | 70,987,978 bp [2] |
|---|
|
| RNA発現パターン |
|---|
| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
|---|
| トップの表現 | - 右前頭葉
- 右精巣
- 左精巣
- 小脳の右半球
- 下垂体前葉
- C1セグメント
- 帯状回
- 前帯状皮質
- S状結腸の筋層
- 右子宮管
|
| | トップの表現 | - 上前頭回
- 海馬歯状回顆粒細胞
- 一次視覚野
- 精母細胞
- 網膜の神経層
- 顆粒球
- リップ
- 嗅周囲皮質
- 嗅内皮質
- 心室帯
|
| | 参照表現データの詳細 |
|
|---|
| バイオGPS | 
 | | 参照表現データの詳細 |
|
|---|
|
| 遺伝子オントロジー |
|---|
| 分子機能 |
- FK506バインディング
- イソメラーゼ活性
- ペプチジルプロリルシス-トランスイソメラーゼ活性
- 金属イオン結合
- タンパク質結合
- 同一のタンパク質結合
- 無秩序なドメイン特異的結合
| | 細胞成分 |
- 膜の不可欠な構成要素
- 膜
- ミトコンドリア膜
- 小胞体膜の不可欠な構成要素
- ミトコンドリアエンベロープ
- ミトコンドリア
- 小胞体
- 細胞質
- 細胞質
- タンパク質含有複合体
| | 生物学的プロセス |
- アポトーシスの過程
- 細胞内シグナル伝達
- 多細胞生物の成長
- 細胞運命の指定
- アポトーシス過程の負の調節
- BMPシグナル伝達経路の調節
- 神経管の発達
- BMPシグナル伝達経路の正の調節
- 遺伝子発現の調節
- スムーズなシグナル伝達経路
- カメラ型眼の開発
- 背側/腹側神経管のパターン形成
- ウイルスプロセス
- 背腹パターン形成
- シャペロンを介したタンパク質の折り畳み
- タンパク質ペプチジルプロリル異性化
- タンパク質リン酸化の負の調節
| | 出典:Amigo / QuickGO |
|
| オルソログ |
|---|
| 種 | 人間 | ねずみ |
|---|
| エントレズ | | |
|---|
| アンサンブル | | |
|---|
| ユニプロット | | |
|---|
| RefSeq (mRNA) | | |
|---|
NM_001111066 NM_001199631 NM_010223 |
|
|---|
| RefSeq (タンパク質) | |
|---|
NP_001295302 NP_036313 NP_001295302.1 |
| |
|---|
NP_001104536 NP_001186560 NP_034353 |
|
|---|
| 場所 (UCSC) | 19章: 18.53 – 18.54 Mb | 8 章: 70.98 – 70.99 Mb |
|---|
| PubMed検索 | [3] | [4] |
|---|
|
| ウィキデータ |
|
FK506結合タンパク質8は、ヒトではFKBP8遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
この遺伝子によってコードされるタンパク質は、免疫調節やタンパク質の折り畳みと輸送に関わる基本的な細胞プロセスに関与するイムノフィリンタンパク質ファミリーのメンバーです。ファミリーの他のメンバーとは異なり、このコードされたタンパク質はPPIase /ロタマーゼ活性を持たないようです。記憶機能に関連するニューロンで役割を果たしている可能性があります。[6]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000105701 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000019428 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Lam E、Martin M、 Wiederrecht G (1995年9月)。「ロイシンジッパーとテトラトリコペプチドリピートモチーフを含む新規ヒトFK506結合タンパク質ホモログをコードするcDNAの単離」。Gene . 160 (2): 297–302. doi :10.1016/0378-1119(95)00216-S. PMID 7543869。
- ^ ab "Entrez Gene: FKBP8 FK506 結合タンパク質 8、38kDa"。
さらに読む
- Bonaldo MF、Lennon G、Soares MB (1997)。「正規化と減算: 遺伝子発見を容易にする 2 つのアプローチ」。Genome Res . 6 (9): 791–806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548。
- Pedersen KM、Finsen B、 Celis JE、Jensen NA (1999)。「muFKBP38: 生体内でシュワン細胞腫細胞と中枢神経系ニューロンで差次的に発現する新規マウス免疫フィリンホモログ」。電気泳動。20 (2): 249–55。doi :10.1002/( SICI )1522-2683(19990201)20:2<249::AID-ELPS249>3.0.CO;2- F。PMID 10197430。S2CID 23007045 。
- Hartley JL、Temple GF、Brasch MA (2001)。「in vitro 部位特異的組み換えを用いた DNA クローニング」。Genome Res . 10 (11): 1788–95. doi :10.1101/gr.143000. PMC 310948. PMID 11076863 。
- Wiemann S、Weil B、Wellenreuther R、他 (2001)。「ヒト遺伝子およびタンパク質のカタログに向けて:ヒトcDNAをコードする500個の新規完全タンパク質の配列決定および分析」。Genome Res . 11 (3): 422–35. doi :10.1101/gr.GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166 。
- Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
- Shirane M, Nakayama KI (2003). 「内因性カルシニューリン阻害剤 FKBP38 は Bcl-2 をミトコンドリアに標的化し、アポトーシスを阻害する」Nat. Cell Biol . 5 (1): 28–37. doi :10.1038/ncb894. PMID 12510191. S2CID 11653096.
- Rosner M、Hofer K、Kubista M、 Hengstschläger M (2003)。「ヒトTSC腫瘍抑制タンパク質による細胞サイズの調節はPI3KとFKBP38に依存する」。Oncogene . 22 (31): 4786–98. doi : 10.1038/sj.onc.1206776 . PMID 12894220。
- Grimwood J 、 Gordon LA、Olsen A、他 (2004)。「ヒト染色体19のDNA配列と生物学」。Nature 428 ( 6982): 529–35。Bibcode :2004Natur.428..529G。doi : 10.1038/ nature02399。PMID 15057824 。
- Bulgakov OV、Eggenschwiler JT、Hong DH、他 (2004)。「FKBP8 は、神経組織におけるマウスのソニックヘッジホッグシグナル伝達の負の調節因子である」。開発。131 ( 9): 2149–59。doi :10.1242/dev.01122。PMID 15105374。S2CID 8203913 。
- Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの現状、品質、拡大: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。
- Wiemann S, Arlt D, Huber W, et al. (2004). 「ORFeome から生物学へ: 機能ゲノミクスパイプライン」Genome Res . 14 (10B): 2136–44. doi :10.1101/gr.2576704. PMC 528930. PMID 15489336 .
- Rush J、Moritz A、Lee KA、他 (2005)。「がん細胞におけるチロシンリン酸化の免疫親和性プロファイリング」。Nat . Biotechnol . 23 (1): 94–101. doi :10.1038/nbt1046. PMID 15592455. S2CID 7200157.
- Kang CB、Tai J、Chia J、Yoon HS (2005)。「Bcl-2 のフレキシブルループは免疫抑制剤 FK-506 結合タンパク質 38 (FKBP38) との分子相互作用に必要である」。FEBS Lett . 579 (6): 1469–76. doi : 10.1016/j.febslet.2005.01.053 . hdl : 10356/95126 . PMID 15733859. S2CID 19114701.
- Weiwad M、Edlich F、Erdmann F、et al. (2005)。「カルシニューリンに対するヒト FKBP38 の阻害能力の再評価」。FEBS Lett . 579 (7): 1591–6. doi : 10.1016/j.febslet.2004.12.098 . PMID 15757646. S2CID 12995306。
- Edlich F, Weiwad M, Erdmann F, et al. (2005). 「Bcl-2 調節因子 FKBP38 は Ca2+/カルモジュリンによって活性化される」. EMBO J. 24 ( 14): 2688–99. doi :10.1038/sj.emboj.7600739. PMC 1176465. PMID 15990872 .
- Kang CB、Feng L、Chia J、Yoon HS (2005)。「FK-506 結合タンパク質 38 の分子特性と抗アポトーシスタンパク質 Bcl-2 に対するその潜在的な調節役割」。Biochem . Biophys. Res. Commun . 337 (1): 30–8. doi :10.1016/j.bbrc.2005.09.023. hdl : 10356/94816 . PMID 16176796。
- Rual JF、Venkatesan K、Hao T、他 (2005)。「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。Nature . 437 ( 7062 ) : 1173–8。Bibcode :2005Natur.437.1173R。doi : 10.1038 /nature04209。PMID 16189514。S2CID 4427026。
- Oh JH、Yang JO、Hahn Y、et al. (2006)。「ヒト胃癌のトランスクリプトーム解析」。Mamm . Genome . 16 (12): 942–54. doi :10.1007/s00335-005-0075-2. PMID 16341674. S2CID 69278.
- Mehrle A、Rosenfelder H、 Schupp I 、他 (2006)。「2006 年の LIFEdb データベース」。Nucleic Acids Res . 34 (データベース号): D415–8。doi : 10.1093/nar/gkj139。PMC 1347501。PMID 16381901。