EDC3 利用可能な構造物 PDB オルソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコード一覧 2VC8、2WAX、2WAY、3D3J、3D3K
識別子 別名 EDC3 、LSM16、YJDC、YJEFN2、MRT50、mRNA脱キャップエンハンサー3、hYjeF_N2-15q23外部ID オミム : 609842 ; MGI : 2142951 ;ホモロジーン : 11827 ;ジーンカード : EDC3 ; OMA : EDC3 - オルソログRNA発現 パターンBgee 人間 マウス （相同体）トップは 左精巣 右睾丸 子宮内膜の間質細胞 神経節隆起 心室帯 睾丸 ランゲルハンス島 生殖腺 顆粒球 甲状腺の右葉
トップは 原始的な筋 手 耳石器 卵黄嚢 吻側回遊河川 卵形嚢 耳胞 外頸動脈 三叉神経節 内頸動脈
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バイオGPS より多くの参照発現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 タンパク質結合 ホスホジエステラーゼ脱キャップエンドヌクレアーゼ活性 同一のタンパク質結合 RNA結合 mRNA結合 細胞成分 生物学的プロセス Pボディアセンブリ 脱アデニル化mRNAのエキソヌクレアーゼ分解による異化 RNAホスホジエステル結合の加水分解、エンドヌクレアーゼによる分解 核転写mRNAの脱アデニル化非依存性脱キャップ 出典：Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ アントレ アンサンブル UniProt RefSeq（mRNA） NM_001142443 NM_001142444 NM_025083 NM_001351378 NM_001351379
RefSeq（タンパク質） NP_001135915 NP_001135916 NP_079359 NP_001338307 NP_001338308
所在地（UCSC） Chr 15: 74.63 – 74.7 MB Chr 9: 57.62 – 57.66 MB PubMed 検索[ 3 ] [ 4 ]
ウィキデータ
mRNA脱キャップタンパク質3エンハンサーは、 ヒトではEDC3 遺伝子によってコードされる タンパク質 である。[ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]
EDC3は、 mRNA の5'末端からの分解に先立って5'キャップ を除去するために必要なmRNA脱キャップ複合体 と関連している（Fenger-Gronら、2005）。[OMIM提供] [ 7 ]
参考文献 1 2 3 GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000179151 – Ensembl 、2017年5月 1 2 3 GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000038957 – Ensembl 、2017年5月 ↑ 「ヒトPubMed参照:」。米国国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ↑ 「マウス PubMed 参照:」 。 米国国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ↑ Albrecht M 、Lengauer T ( 2004年6 月 )。 「長いC末端テールを持つ新規Sm様タンパク質と関連するメチルトランスフェラーゼ」 。FEBS Lett。569 ( 1–3 ) : 18–26。Bibcode : 2004FEBSL.569 ... 18A。doi : 10.1016 /j.febslet.2004.03.126。PMID 15225602 。 ↑ Rudolph C、Sigruener A、Hartmann A、Orso E、Bals-Pratsch M、Gronwald W、Seifert B、Kalbitzer HR、Verdorfer I、Luetjens CM、Ortmann O、Bornstein SR、Schmitz G (2007 年 5 月)。「ApoA-I 結合タンパク質 (AI-BP) およびその相同体 hYjeF_N2 および hYjeF_N3 は、ヒトの YjeF_N ドメインタンパク質ファミリーを構成し、精子形成および卵形成に関与する」。Horm Metab Res . 39 (5): 322– 35. doi : 10.1055/s-2007-977699 . PMID 17533573 . S2CID 10679128 . 1 2 "Entrez Gene: EDC3 enhancer of mRNA decapping 3 homolog (S. cerevisiae)" .
さらに読む 丸山K、菅野S（1994）。「オリゴキャッピング：真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置換する簡便な方法」Gene.138 （1–2 ） ：171–4.doi ：10.1016 / 0378-1119 ( 94) 90802-8.PMID 8125298 . 鈴木 裕、中川 義友 健、丸山 健、須山 昭、菅野 誠 (1997)「全長濃縮および5'末端濃縮cDNAライブラリーの構築と特性評価」Gene.200 ( 1–2 ) : 149–56.doi : 10.1016 / S0378-1119 ( 97) 00411-3.PMID 9373149 . Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、Derge JG、Klausner RD、Collins FS、Wagner L、Shenmen CM、Schuler GD (2003) 「15,000を超える全長ヒトおよびマウスcDNA配列の生成と初期解析」 . Proc. Natl . Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 . Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, Otsuki T, Sugiyama T, Irie R, Wakamatsu A, Hayashi K, Sato H (2004). "Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs" . Nat. Genet . 36 (1): 40–5 . doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039 . Jin J、Smith FD、Stark C、Wells CD、Fawcett JP、Kulkarni S、Metalnikov P、O'Donnell P、Taylor P (2004)。 「細胞骨格制御と細胞組織化に関与する生体内14-3-3結合タンパク質のプロテオミクス、機能、およびドメインベースの解析」。Curr . Biol . 14 ( 16): 1436–50。Bibcode : 2004CBio ... 14.1436J。doi : 10.1016 / j.cub.2004.07.051。PMID 15324660。S2CID 2371325 。 Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、Shenmen CM、Grouse LH、Schuler G、Klein SL、Old S、Rasooly R (2004) 「NIH 全長 cDNA プロジェクトの現状、品質、および拡張: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」 . Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi : 10.1101 / gr.2596504 . PMC 528928. PMID 15489334 . Wan D, Gong Y, Qin W, Zhang P, Li J, Wei L, Zhou X, Li H, Qiu X (2004). "がん発生および進行に関連する遺伝子の大規模cDNAトランスフェクションスクリーニング" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 101 (44): 15724–9 . Bibcode : 2004PNAS..10115724W . doi : 10.1073/ pnas.0404089101 . PMC 524842. PMID 15498874 . フェンガー＝グロン M、フィルマン C、ノリルド B、リュッケ＝アンデルセン J (2006)。「複数のプロセシング身体因子と ARE 結合タンパク質 TTP が mRNA の脱キャッピングを活性化します。 」モル。セル 。20 (6): 905–15 .土井 : 10.1016/j.molcel.2005.10.031 。PMID 16364915。 Beausoleil SA、Villén J、Gerber SA、Rush J、Gygi SP (2006)「ハイスループットタンパク質リン酸化解析および部位局在化のための確率ベースのアプローチ」Nat. Biotechnol . 24 (10): 1285–92 . doi : 10.1038/nbt1240 . PMID 16964243. S2CID 14294292 . Ewing RM、Chu P、Elisma F、Li H、Taylor P、Climie S、McBroom-Cerajewski L、Robinson MD、O'Connor L (2007) 「質量分析法によるヒトタンパク質間相互作用の大規模マッピング」 . Mol. Syst. Biol . 3 (1): 89. doi : 10.1038/msb4100134 . PMC 1847948 . PMID 17353931 . Tritschler F、Eulalio A、Truffault V、Hartmann MD、Helms S、Schmidt S、Coles M、Izaurralde E、Weichenrieder O (2007)。「EDC3タンパク質の異なるSmフォールドがDCP1結合とPボディ標的化を媒介する」。Mol . Cell. Biol . 27 (24): 8600–11 . doi : 10.1128/MCB.01506-07 . PMC 2169425. PMID 17923697 .
