タンパク質
| DKC1 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | DKC1、CBF5、DKC、DKCX、NAP57、NOLA4、XAP101、ジスケリン、ジスケリン擬似ウリジン合成酵素1 |
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| 外部ID | オミム:300126; MGI : 1861727;ホモロジーン: 1045;ジーンカード:DKC1; OMA :DKC1 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | X染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | X|X A7.3 | 始める | 74,139,460 bp [2] |
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| 終わり | 74,153,383 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 二次卵母細胞
- 腓骨神経
- 歯肉上皮
- 毛包
- 脛骨
- 上腕二頭筋の腱
- 膵管細胞
- アキレス腱
- 鼻咽頭上皮
- 軟骨組織
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| | トップの表現 | - 手
- 胎児の尾
- 原始的な線
- 耳小胞
- 胚葉上層
- 受精卵
- 性器結節
- 二次卵母細胞
- 胚
- 腹壁
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- テロメラーゼ活性
- シュードウリジン合成酵素活性
- イソメラーゼ活性
- ボックス H/ACA snoRNA 結合
- タンパク質結合
- テロメラーゼRNA結合
- RNA結合
| | 細胞成分 |
- 細胞質
- カハールボディ
- ボックス H/ACA テロメラーゼ RNP 複合体
- ボックス H/ACA scaRNP 複合体
- テロメラーゼホロ酵素複合体
- ボックス H/ACA snoRNP 複合体
- 核
- 原線維中心
- 核質
- 核小体
| | 生物学的プロセス |
- シュードウリジン合成
- RNA処理
- リボソームの生合成
- テロメアへのタンパク質局在の確立の正の調節
- テロメラーゼRNAの安定化
- ボックス H/ACA RNA 代謝プロセス
- テロメラーゼを介したテロメア維持の正の制御
- snRNA擬似ウリジン合成
- テロメラーゼ活性の正の調節
- テロメラーゼRNAのカハール小体への局在の正の制御
- rRNA処理
- RNA修飾
- 細胞集団の増殖
- mRNAシュードウリジン合成
- ボックス H/ACA RNA 3'末端処理
- rRNAシュードウリジン合成
- テロメラーゼによるテロメア維持
- テロメラーゼRNAのカハール小体への局在の制御
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_001142463 NM_001288747 NM_001363 |
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NM_001030307 NM_001359411 NM_001359412 NM_001359413 |
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| RefSeq (タンパク質) | |
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NP_001135935 NP_001275676 NP_001354 |
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NP_001025478 NP_001346340 NP_001346341 NP_001346342 |
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| 場所 (UCSC) | 染色体X: 154.76 – 154.78 Mb | 染色体X: 74.14 – 74.15 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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H/ACAリボ核タンパク質複合体サブユニット4は、ヒトではDKC1遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6] [7]
ジスケリンは、TruBファミリー酵素の一部である擬似ウリジン 合成酵素です。 [8]ジスケリンは、514残基のL字型タンパク質で、分子量は約58 キロダルトンです。[8]ジスケリンは、テロメラーゼRNA成分(TERC)を蓄積することにより、テロメラーゼの活性に不可欠です。 [8]
この遺伝子は、 H/ACA snoRNPs (小型核小体リボ核タンパク質) 遺伝子ファミリーのメンバーです。snoRNPs は、rRNA の処理と変更のさまざまな側面に関与しており、C/D と H/ACA の 2 つのファミリーに分類されています。H/ACA snoRNPs には、NOLA1、2、および 3 タンパク質も含まれます。この遺伝子によってコードされるタンパク質と 3 つの NOLA タンパク質は、核小体の高密度線維成分と核内のコイル(カハール) 体に局在します。4 つのタンパク質のいずれかが枯渇すると、18S rRNA の生成と rRNA の擬似ウリジル化の両方が損なわれます。この遺伝子によってコードされるタンパク質は、 Saccharomyces cerevisiae Cbf5p およびDrosophila melanogaster Nop60B タンパク質に関連しています。この遺伝子はパルミトイル化赤血球膜タンパク質(MPP1)遺伝子と尾から尾までの方向に位置し、テロメアからセントロメアの方向に転写される。この遺伝子では、ヌクレオチド置換と単一トリヌクレオチド反復多型の両方が見つかっている。この遺伝子の変異は、X連鎖性先天性角化異常症を引き起こす。[7]
臨床的意義
DKC1の変異はホイエラアル・ヘイダルソン症候群と関連している。[9]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000130826 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000031403 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Heiss NS、Knight SW、Vulliamy TJ、Klauck SM、Wiemann S、Mason PJ、Poustka A、Dokal I (1998 年 5 月)。「X 連鎖性先天性角化異常症は、核小体機能を持つ高度に保存された遺伝子の変異によって引き起こされる」Nat Genet . 19 (1): 32–8. doi :10.1038/ng0598-32. PMID 9590285. S2CID 205342127.
- ^ Hassock S、Vetrie D、Giannelli F (1999年3月)。「X連鎖性先天性角化異常症 (DKC) 遺伝子のマッピングと特徴付け」。ゲノミクス。55 ( 1 ): 21–7。doi : 10.1006 /geno.1998.5600。PMID 9888995 。
- ^ ab "Entrez Gene: DKC1 先天性角化異常症 1、ジスケリン".
- ^ abc Garus A 、Autexier C (2021)。「ジスケリン:リボソーム生合成、スプライシング、テロメア維持において多面的な役割を果たす必須の擬似ウリジン合成酵素」 。RNA。27 ( 12 ): 1441–1458。doi :10.1261 / rna.078953.121。PMC 8594475。PMID 34556550。
- ^ Lim BC, Yoo SK, Lee S, Shin JY, Hwang H, Chae JH, Hwang YS, Seo JS, Kim JI, Kim KJ (2014). 「全エクソームシーケンシングにより同定された DKC1 変異を伴う Hoyeraal-Hreidarsson 症候群」. Gene . 546 (2): 425–9. doi :10.1016/j.gene.2014.06.011. PMID 24914498.
さらに読む
- Marrone A, Dokal I (2004). 「先天性角化異常症:テロメラーゼ機能、老化、癌に関する分子的洞察」。分子医学における専門家レビュー。6 (26): 1–23。doi : 10.1017 /S1462399404008671。PMID 15613268。S2CID 38163343 。
- 山口 浩 (2007). 「テロメラーゼ複合体遺伝子の変異は骨髄不全につながる」日本医科大学雑誌. 74 (3): 202–9. doi : 10.1272/jnms.74.202 . PMID 17625368.
- Aalfs CM、van den Berg H、Barth PG、Hennekam RC (1995)。「Hoyeraal-Hreidarsson 症候群: 出生前発育遅延、進行性汎血球減少症、小脳低形成を伴う独立した疾患の 4 番目の症例」。Eur . J. Pediatr . 154 (4): 304–8. doi :10.1007/BF01957367. PMID 7607282. S2CID 441225。
- Maruyama K, Sugano S (1994). 「オリゴキャッピング:真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置き換える簡単な方法」. Gene . 138 (1–2): 171–4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Devriendt K、Matthijs G、Legius E、et al . (1997)。「 先天性角化異常症の女性キャリアにおける偏ったX染色体不活性化」。Am . J. Hum. Genet . 60 (3): 581–7。PMC 1712491。PMID 9042917。
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, et al. (1997). 「全長濃縮および5'末端濃縮cDNAライブラリーの構築と特性評価」. Gene . 200 (1–2): 149–56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
- McGrath JA (1999). 「先天性角化異常症:リボソーム機能に関する新たな臨床的および分子的知見」Lancet . 353 (9160): 1204–5. doi :10.1016/S0140-6736(99)00011-2. PMID 10217077. S2CID 490860.
- Knight SW、Heiss NS、Vulliamy TJ、他 (1999)。「X 連鎖性先天性角化異常症は主に DKC1 遺伝子のミスセンス変異によって引き起こされる」。Am . J. Hum. Genet . 65 (1): 50–8. doi :10.1086/302446. PMC 1378074. PMID 10364516 。
- Vulliamy TJ、Knight SW、Heiss NS、他 (1999)。「3' 欠失による先天性角化異常症:女性保因者における生殖細胞系列および体細胞モザイク」。Blood . 94 ( 4): 1254–60. doi :10.1182/blood.V94.4.1254. PMID 10438713。
- Heiss NS、Girod A、Salowsky R、et al. (2000)。「ジスケリンは核小体に局在し、その誤った局在が先天性角化異常症の発症に関与する可能性は低い」。Hum . Mol. Genet . 8 (13): 2515–24. doi :10.1093/hmg/8.13.2515. PMID 10556300。
- Knight SW、Heiss NS、Vulliamy TJ、他 (2000)。「先天性角化異常遺伝子 DKC1 の変異による原因不明の再生不良性貧血、免疫不全、小脳低形成 (Hoyeraal-Hreidarsson 症候群)」。Br. J. Haematol . 107 (2): 335–9. doi :10.1046/j.1365-2141.1999.01690.x. PMID 10583221. S2CID 23750791。
- Mitchell JR、Wood E 、Collins K (1999)。「ヒトの先天性角化異常症ではテロメラーゼ成分に欠陥がある」。Nature . 402 (6761): 551–5。Bibcode :1999Natur.402..551M。doi : 10.1038/990141。PMID 10591218。S2CID 4430482。
- Yaghmai R、Kimyai-Asadi A、Rostamiani K、他。 (2000年)。 「先天性角化異常症とホイエラル・フライダルソン症候群の重複」。J. Pediatr。136 (3): 390-3.土井: 10.1067/mpd.2000.104295。PMID 10700698。
- Heiss NS、 Bächner D、Salowsky R、他 (2000)。「マウス先天性角化異常症遺伝子 dkc1 の遺伝子構造と発現」。ゲノミクス67 ( 2): 153–63。doi :10.1006/geno.2000.6227。PMID 10903840 。
- Pogacić V、Dragon F、Filipowicz W (2000)。「ヒト H/ACA 小型核小体 RNP とテロメラーゼは進化的に保存されたタンパク質 NHP2 と NOP10 を共有している」。Mol . Cell. Biol . 20 (23): 9028–40. doi :10.1128/MCB.20.23.9028-9040.2000. PMC 86556. PMID 11074001 。
- Hartley JL、Temple GF、Brasch MA (2001)。「In Vitro 部位特異的組換えを用いた DNA クローニング」。Genome Res . 10 (11): 1788–95. doi :10.1101/gr.143000. PMC 310948 . PMID 11076863。
- Simpson JC、Wellenreuther R、Poustka A、et al. (2001)。「大規模cDNAシーケンシングによって同定された新規タンパク質の系統的細胞内局在」。EMBO Rep . 1 (3): 287–92. doi :10.1093/embo-reports/kvd058. PMC 1083732. PMID 11256614 。
- Knight SW、Vulliamy TJ、Morgan B、他 (2001)。「先天性角化異常症患者における新規 DKC1 変異の同定: 病態生理学および診断への影響」。Hum . Genet . 108 (4): 299–303. doi :10.1007/s004390100494. PMID 11379875. S2CID 23829134.
外部リンク
- 先天性角化異常症に関する GeneReviews/NCBI/NIH/UW のエントリ