CTDP1

CTDP1
利用可能な構造
電子データ	オルソログ検索: PDBe RCSB
PDB IDコードのリスト
	1J2X、1ONV、2K7L
識別子
エイリアス	CTDP1、CCFDN、FCP1、CTDホスファターゼサブユニット1
外部ID	OMIM : 604927; MGI : 1926953; HomoloGene : 31254; GeneCards : CTDP1; OMA :CTDP1 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
クロ。	18番染色体（ヒト）
終わり	79,754,503 bp
遺伝子の位置（マウス）
クロ。	18番染色体（マウス）
終わり	80,512,910 bp
RNA発現パターン
	トップの表現
	左精巣; ; 右精巣; ; 脚の皮膚; ; 卵母細胞; ; 顆粒球; ; 血; ; 横行結腸粘膜; ; 腹部の皮膚; ; 二次卵母細胞; ; 単球;
	トップの表現
	精子細胞; ; 耳小胞; ; 胚葉上層; ; 胎児肝臓造血前駆細胞; ; 毛包; ; 精細管; ; 生殖腺隆起; ; 原始的な線; ; 体節; ; パネートセル;
	参照表現データの詳細
	参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー
分子機能	RNAポリメラーゼII CTDヘプタペプチドリピートホスファターゼ活性; タンパク質結合; 加水分解酵素活性; リン酸化タンパク質ホスファターゼ活性; TFIIFクラス転写因子複合体結合; Tatタンパク質結合;
細胞成分	細胞質; 中心体; スピンドルポール; RNAポリメラーゼII、ホロ酵素; スピンドル; 微小管形成中心; 胴体; スピンドルミッドゾーン; 細胞骨格; 核; 核質; 細胞内膜小器官; タンパク質含有複合体; アクチン細胞骨格; 核の粒;
生物学的プロセス	RNAポリメラーゼIIプロモーターからの転写伸長; タンパク質の脱リン酸化; 有糸分裂からの脱出; RNAポリメラーゼIIによる転写; 細胞分裂; 心筋細胞の発達に関与する細胞成長の負の調節; RNAポリメラーゼII C末端ドメインの脱リン酸化; 細胞周期; ウイルス転写の宿主による正の調節; ウイルス転写の正の制御;
	出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
	9150
	67655
	ENSG00000282752 ; ENSG00000060069
	ENSMUSG00000033323
	翻訳
	翻訳:
	NM_001202504 ; NM_004715 ; NM_048368 ; NM_001318511
	NM_026295
	NP_001189433 ; NP_001305440 ; NP_004706 ; NP_430255
	NP_080571
	ウィキデータ
人間の表示/編集	マウスの表示/編集

RNAポリメラーゼIIサブユニットC末端ドメインホスファターゼは、ヒトではCTDP1遺伝子によってコードされる酵素である。^[5]^[6]^[7]

この遺伝子は、RNAポリメラーゼIIによる伸長と開始を制御する転写因子である転写開始因子TFIIFのカルボキシ末端と相互作用するタンパク質をコードしています。このタンパク質は、RNAポリメラーゼIIホロ酵素複合体の構成要素である可能性もあります。この遺伝子の選択的スプライシングにより、2つの異なるアイソフォームをコードする2つの転写バリアントが生成されます。^[7]

インタラクション

CTDP1はWDリピート含有タンパク質77、^[8]、GTF2F1 ^[6]、POLR2A ^[9]と相互作用することが示されている。

参考文献

^ abc ENSG00000060069 GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000282752、ENSG00000060069 – Ensembl、2017 年 5 月
^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000033323 – Ensembl、2017 年 5 月
^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ Archambault J、Chambers RS、Kobor MS、Ho Y、Cartier M、Bolotin D、Andrews B、Kane CM、Greenblatt J (1998 年 2 月)。「Saccharomyces cerevisiae の転写因子 IIF と相互作用する C 末端ドメインホスファターゼの必須成分」。Proc Natl Acad Sci USA。94 ( 26): 14300–5。Bibcode : 1997PNAS ... 9414300A。doi : 10.1073/ pnas.94.26.14300。PMC 24951。PMID 9405607。
^ ab Archambault J、Pan G、Dahmus GK、Cartier M、Marshall N、Zhang S、Dahmus ME、Greenblatt J (1998 年 11 月)。「RNA ポリメラーゼ IIO のカルボキシル末端ドメインを脱リン酸化するヒトタンパク質ホスファターゼの RAP74 相互作用サブユニットである FCP1」。J Biol Chem . 273 (42): 27593–601。doi : 10.1074 / jbc.273.42.27593。PMID 9765293。
^ ab "Entrez 遺伝子: CTDP1 CTD (カルボキシ末端ドメイン、RNA ポリメラーゼ II、ポリペプチド A) ホスファターゼ、サブユニット 1"。
^ Licciardo, Paolo; Amente Stefano; Ruggiero Luca; Monti Maria; Pucci Piero; Lania Luigi; Majello Barbara (2003 年 2 月)。「FCP1 ホスファターゼは RNA ポリメラーゼ II および snRNP の組み立てに関与するメチロソーム複合体の構成要素である MEP50 と相互作用する」。Nucleic Acids Res . 31 (3)。イギリス: 999–1005。doi : 10.1093 / nar/gkg197。PMC 149217。PMID 12560496。
^ Scully, R; Anderson SF; Chao DM; Wei W; Ye L; Young RA; Livingston DM; Parvin JD (1997 年 5 月). 「BRCA1 は RNA ポリメラーゼ II ホロ酵素の構成要素である」. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 94 (11). アメリカ合衆国: 5605–10. Bibcode :1997PNAS...94.5605S. doi : 10.1073/pnas.94.11.5605 . ISSN 0027-8424. PMC 20825 . PMID 9159119.

外部リンク

UCSC ゲノムブラウザのヒト CTDP1 ゲノムの位置と CTDP1 遺伝子の詳細ページ。

さらに読む

Scully R、Anderson SF、Chao DM、et al. (1997)。「BRCA1 は RNA ポリメラーゼ II ホロ酵素の構成要素である」。Proc . Natl . Acad. Sci. USA . 94 ( 11): 5605–10。Bibcode : 1997PNAS ...94.5605S。doi : 10.1073/ pnas.94.11.5605。PMC 20825。PMID 9159119。
Marshall NF、Dahmus GK、Dahmus ME (1998)。「HIV-1 tatタンパク質によるカルボキシル末端ドメインホスファターゼの調節」。J . Biol. Chem . 273 (48): 31726–30. doi : 10.1074/jbc.273.48.31726 . PMID 9822634。
Cho H、Kim TK、Mancebo H、et al. (1999)。「タンパク質ホスファターゼはRNAポリメラーゼIIをリサイクルする機能を果たす」。Genes Dev . 13 (12): 1540–52. doi :10.1101/gad.13.12.1540. PMC 316795. PMID 10385623 。
Angelicheva D、Turnev I、Dye D、他 (1999)。「先天性白内障顔面異形症神経障害 (CCFDN) 症候群: ジプシーにおける新しい発達障害は 18qter にマッピングされる」。Eur . J. Hum. Genet . 7 (5): 560–6. doi : 10.1038/sj.ejhg.5200319 . PMID 10439962。
Marshall NF、Dahmus ME (2000)。「HIV-1 およびアデノウイルス 2 の主要な後期テンプレートにおける初期伸長複合体の RNA ポリメラーゼ II の C 末端ドメインホスファターゼ感受性」。J . Biol. Chem . 275 (42): 32430–7. doi : 10.1074/jbc.M005898200 . PMID 10938286。
Licciardo P、Napolitano G、Majello B、Lania L (2001)。「RNAポリメラーゼII CTDホスファターゼFCP1によるTatトランス活性化の阻害」。AIDS。15 ( 3 ) : 301–7。doi : 10.1097 / 00002030-200102160-00002。PMID 11273209。S2CID 33054695 。
Bharucha DC、Zhou M 、 Nekhai S、他 (2002)。「ヒトT細胞由来のタンパク質ホスファターゼはヒト免疫不全ウイルス1型長末端反復配列のtatトランス活性化を増強する」。ウイルス学。296 (1): 6–16。doi : 10.1006 /viro.2002.1438。PMID 12036313。
Washington K、Ammosova T、Beullens M、他 (2002)。「タンパク質ホスファターゼ-1 は RNA ポリメラーゼ-II の C 末端ドメインを脱リン酸化する」。J . Biol. Chem . 277 (43): 40442–8. doi : 10.1074/jbc.M205687200 . PMID 12185079。
Mandal SS、Cho H、Kim S、他 (2002)。「RNAポリメラーゼIIの最大サブユニットのヘプタペプチドリピートに特異的なホスファターゼであるFCP1は、転写伸長を刺激する」。Mol . Cell. Biol . 22 (21): 7543–52. doi :10.1128/MCB.22.21.7543-7552.2002. PMC 135672. PMID 12370301 。
Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
Licciardo P、Amente S、Ruggiero L、他 (2003)。「FCP1 ホスファターゼは RNA ポリメラーゼ II および snRNP の組み立てに関与するメチロソーム複合体の構成要素である MEP50 と相互作用する」。Nucleic Acids Res . 31 (3): 999–1005. doi :10.1093/nar/gkg197. PMC 149217. PMID 12560496 。
Nguyen BD、Chen HT、Kobor MS 、 et al. (2003)。「RAP74 のカルボキシル末端ドメインの溶液構造と、RAP74 およびヒト TFIIB の FCP1 結合部位の NMR 特性」。生化学。42 ( 6): 1460–9。doi :10.1021/bi0265473。PMID 12578358 。
Friedl EM、Lane WS、Erdjument-Bromage H、et al. (2003)。「FCP1 の C 末端ドメインホスファターゼと転写伸長活性はリン酸化によって制御される」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 100 (5): 2328–33。Bibcode :2003PNAS..100.2328F。doi : 10.1073 /pnas.2628049100 . PMC 151340 . PMID 12591939。
Kamada K, Roeder RG, Burley SK (2003). 「転写因子IIFによるTFIIF関連RNAポリメラーゼC末端ドメインホスファターゼ（FCP1）のリクルートメントの分子メカニズム」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 100 (5): 2296–9. Bibcode :2003PNAS..100.2296K. doi : 10.1073/pnas.262798199 . PMC 151334 . PMID 12591941.
Nguyen BD、Abbott KL、Potempa K、他 (2003)。「TFIIF サブユニット RAP74 と RNA ポリメラーゼ II カルボキシル末端ドメインホスファターゼ FCP1 を含む複合体の NMR 構造」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 100 (10): 5688–93。Bibcode :2003PNAS..100.5688N。doi : 10.1073 / pnas.1031524100 . PMC 156262 . PMID 12732728。
Varon R、Gooding R、Steglich C、他 (2003)。「RNAポリメラーゼIIのC末端ドメインホスファターゼの部分的欠損は先天性白内障顔面異形症神経障害症候群と関連している」Nat. Genet . 35 (2): 185–9. doi :10.1038/ng1243. PMID 14517542. S2CID 22461437.
Yu X、Chini CC、He M、et al. (2003)。「BRCT ドメインはリン酸化タンパク質結合ドメインである」。Science . 302 ( 5645 ) : 639–42。Bibcode : 2003Sci ... 302..639Y。doi :10.1126/science.1088753。PMID 14576433。S2CID 29407635 。
Beausoleil SA、Jedrychowski M、 Schwartz D、他 (2004)。「HeLa 細胞核リン酸化タンパク質の大規模特性評価」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 101 ( 33 ) : 12130–5。Bibcode :2004PNAS..10112130B。doi : 10.1073/ pnas.0404720101。PMC 514446。PMID 15302935。

[refGRCh38Ensembl-1] ENSG00000060069 GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000282752、ENSG00000060069 – Ensembl、2017 年 5 月

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000033323 – Ensembl、2017 年 5 月

[3] 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[4] 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[pmid9405607-5] Archambault J、Chambers RS、Kobor MS、Ho Y、Cartier M、Bolotin D、Andrews B、Kane CM、Greenblatt J (1998 年 2 月)。「Saccharomyces cerevisiae の転写因子 IIF と相互作用する C 末端ドメインホスファターゼの必須成分」。Proc Natl Acad Sci USA。94 ( 26): 14300–5。Bibcode : 1997PNAS ... 9414300A。doi : 10.1073/ pnas.94.26.14300。PMC 24951。PMID 9405607。

[pmid9765293-6] Archambault J、Pan G、Dahmus GK、Cartier M、Marshall N、Zhang S、Dahmus ME、Greenblatt J (1998 年 11 月)。「RNA ポリメラーゼ IIO のカルボキシル末端ドメインを脱リン酸化するヒトタンパク質ホスファターゼの RAP74 相互作用サブユニットである FCP1」。J Biol Chem . 273 (42): 27593–601。doi : 10.1074 / jbc.273.42.27593。PMID 9765293。

[entrez-7] "Entrez 遺伝子: CTDP1 CTD (カルボキシ末端ドメイン、RNA ポリメラーゼ II、ポリペプチド A) ホスファターゼ、サブユニット 1"。

[pmid12560496-8] Licciardo, Paolo; Amente Stefano; Ruggiero Luca; Monti Maria; Pucci Piero; Lania Luigi; Majello Barbara (2003 年 2 月)。「FCP1 ホスファターゼは RNA ポリメラーゼ II および snRNP の組み立てに関与するメチロソーム複合体の構成要素である MEP50 と相互作用する」。Nucleic Acids Res . 31 (3)。イギリス: 999–1005。doi : 10.1093 / nar/gkg197。PMC 149217。PMID 12560496。

[pmid9159119-9] Scully, R; Anderson SF; Chao DM; Wei W; Ye L; Young RA; Livingston DM; Parvin JD (1997 年 5 月). 「BRCA1 は RNA ポリメラーゼ II ホロ酵素の構成要素である」. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 94 (11). アメリカ合衆国: 5605–10. Bibcode :1997PNAS...94.5605S. doi : 10.1073/pnas.94.11.5605 . ISSN 0027-8424. PMC 20825 . PMID 9159119.