ヒトのタンパク質コード遺伝子
| CSTF2T |
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| 識別子 |
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| エイリアス | CSTF2T、CstF-64T、切断刺激因子サブユニット 2、タウ変異体、切断刺激因子サブユニット 2 タウ変異体 |
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| 外部ID | オミム:611968; MGI : 1932622;ホモロジーン: 80230;ジーンカード:CSTF2T; OMA :CSTF2T - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 19番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 19|19 C1 | 始める | 31,060,237 bp [2] |
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| 終わり | 31,064,469 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 内皮細胞
- 胚上皮
- 脈絡叢上皮
- 壁側胸膜
- ポンス
- ランゲルハンス島
- 神経節隆起
- 脳梁
- 胸部大動脈下行
- 視床下核
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| | トップの表現 | - 松果体
- 内側神経節隆起
- 嗅結節
- ハベヌラ
- 外側中隔核
- 前扁桃体領域
- 鉤状部
- 小脳葉
- 小脳虫部
- 中央隆起
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | 
 | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- タンパク質結合
- mRNA結合
- 核酸結合
- RNA結合
| | 細胞成分 |
- mRNA切断およびポリアデニル化特異性因子複合体
- 細胞内解剖構造
- 核
- 核質
| | 生物学的プロセス |
- mRNA処理
- ポリアデニル化に必要なpre-mRNAの切断
- スプライソソームを介したmRNAスプライシング
- RNAポリメラーゼII転写の終結
- mRNA 3'末端処理
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| ウィキデータ |
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切断刺激因子64kDaサブユニット、タウ変異体は、ヒトではCSTF2T遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6] [7]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000177613 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000053536 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Dass B、McDaniel L、Schultz RA、Attaya E、MacDonald CC (2002 年 10 月)。「ヒト変異体 CstF-64 ポリアデニル化タンパク質 tauCstF-64 をコードする遺伝子 CSTF2T はイントロンを欠いており、男性不妊症と関連している可能性がある」。Genomics . 80 ( 5): 509–14. doi :10.1016/S0888-7543(02)96862-X. PMID 12408968。
- ^ Dass B、McMahon KW、Jenkins NA、Gilbert DJ、Copeland NG、MacDonald CC (2001 年 5 月)。「ポリアデニル化タンパク質 CstF-64 の変異体の遺伝子は 19 番染色体上にあり、マウスのパキテン期精母細胞で発現している」。J Biol Chem . 276 (11): 8044–50. doi : 10.1074/jbc.M009091200 . PMID 11113135。
- ^ 「Entrez Gene: CSTF2T 切断刺激因子、3' プレ RNA、サブユニット 2、64kDa、タウ変異体」。
外部リンク
さらに読む
- Maruyama K, Sugano S (1994). 「オリゴキャッピング:真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置き換える簡単な方法」Gene . 138 (1–2): 171–4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Bonaldo MF、Lennon G、Soares MB (1997)。「正規化と減算: 遺伝子発見を容易にする 2 つのアプローチ」。Genome Res . 6 (9): 791–806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548。
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, et al. (1997). 「全長濃縮および5'末端濃縮cDNAライブラリーの構築と特性評価」. Gene . 200 (1–2): 149–56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
- 石川 健、長瀬 剛、須山 正之、他 (1998)。「未確認ヒト遺伝子のコード配列の予測。X. 試験管内で巨大タンパク質をコードできる脳由来の 100 個の新しい cDNA クローンの完全配列」。DNA Res . 5 (3): 169–76. doi : 10.1093/dnares/5.3.169 . PMID 9734811。
- Wiemann S、Weil B、Wellenreuther R、他 (2001)。「ヒト遺伝子およびタンパク質のカタログに向けて:ヒトcDNAをコードする新規完全タンパク質500種の配列決定および分析」。Genome Res . 11 (3): 422–35. doi :10.1101/gr.GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166 。
- Simpson JC、Wellenreuther R、Poustka A、et al. (2001)。「大規模cDNAシーケンシングによって同定された新規タンパク質の系統的細胞内局在」。EMBO Rep . 1 (3): 287–92. doi :10.1093/embo-reports/kvd058. PMC 1083732. PMID 11256614 。
- Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
- Pérez Cañadillas JM、Varani G (2003)。「ヒトCstF-64タンパク質によるGUリッチポリアデニル化調節要素の認識」。EMBO J. 22 (11): 2821–30. doi :10.1093/emboj/cdg259. PMC 156756. PMID 12773396 。
- Beausoleil SA、Jedrychowski M、 Schwartz D、他 (2004)。「HeLa 細胞核リン酸化タンパク質の大規模特性評価」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 101 ( 33 ) : 12130–5。Bibcode :2004PNAS..10112130B。doi : 10.1073/ pnas.0404720101。PMC 514446。PMID 15302935。
- Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの状況、品質、および拡張: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。
- Zhao X、Oberg D、Rush M、他 (2005)。「ヒトパピローマウイルス 16 型の 57 ヌクレオチド上流初期ポリアデニル化要素は hFip1、CstF-64、hnRNP C1/C2、およびポリピリミジン トラクト結合タンパク質と相互作用する」。J . Virol . 79 (7): 4270–88. doi :10.1128/JVI.79.7.4270-4288.2005. PMC 1061554. PMID 15767428 。
- Rual JF、Venkatesan K、Hao T、他 (2005)。「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。Nature . 437 ( 7062 ) : 1173–8。Bibcode :2005Natur.437.1173R。doi : 10.1038 /nature04209。PMID 16189514。S2CID 4427026。
- Lim J、Hao T、Shaw C、他 (2006)。「ヒト遺伝性運動失調症およびプルキンエ細胞変性症のタンパク質間相互作用ネットワーク」。Cell . 125 (4): 801–14. doi : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . PMID 16713569. S2CID 13709685。