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化学において、CPK カラーリング( Corey – Pauling – Koltun の略) は、分子モデル内で異なる化学元素の原子を区別するための一般的な色分け規則です。
歴史
アウグスト・ヴィルヘルム・フォン・ホフマンは、 1858年にアウグスト・ケクレが化学構造理論を導入し、 1861年にアレクサンダー・クラム・ブラウンが印刷された構造式を導入した後、有機化学に初めて分子モデルを導入した人物であると思われる。1865年4月7日、ロンドンの王立研究所で行われた金曜夜の講演で、彼はメタン、エタン、塩化メチルなどの単純な有機物質の分子モデルを披露した。これは、異なる色のテーブルクロッケーボールを細い真鍮の管でつないで作ったものだった。[1] ホフマンのオリジナルの配色（炭素＝黒、水素＝白、窒素＝青、酸素＝赤、塩素＝緑、硫黄＝黄）は、後の配色に発展した。[2]
1952年、コーリーとポーリングは、カリフォルニア工科大学で構築していたタンパク質やその他の生体分子の空間充填モデルの説明を発表しました。[3]彼らのモデルは、原子をファセット加工された硬材のボールで表し、それぞれの化学元素を示すために異なる明るい色で塗装しました。その色彩スキームには、
彼らはまた、同じ配色のプラスチックボールを使用して、より小さなモデルも作りました。
1965年、コルトゥンはコーリーとポーリングのモデリング技術の改良版の特許を取得しました。[4]彼の特許では以下の色について言及されています。
典型的な課題
典型的なCPKの色の割り当ては次のとおりです。[5]
CPK の色のいくつかは、純粋な元素や注目すべき化合物の色を記憶の助けとして表しています。たとえば、水素は無色の気体、木炭、グラファイト、コークスなどの炭素は黒、硫黄粉末は黄色、塩素は緑がかった気体、臭素は暗赤色の液体、エーテル中のヨウ素は紫、非晶質リンは赤、さびは暗いオレンジがかった赤などです。酸素や窒素などの一部の色については、その着想は明確ではありません。おそらく、酸素の赤は、酸素が通常燃焼に必要であること、または血液中の酸素含有化学物質であるヘモグロビンが明るい赤色であることから着想を得ており、窒素の青は、窒素が地球の大気の主成分であり、人間の目には空色に見えるという事実から着想を得ているのでしょう。[6] [より良い情報源が必要]
CPK の色彩は 19 世紀の模型からヒントを得たものと思われます。1865 年、ロンドンの王立研究所で行われた講演で、アウグスト・ヴィルヘルム・フォン・ホフマンはクロッケーボールで作った模型を使って原子価を説明していました。そこで彼は、手元にある色付きのボールを使いました (当時、クロッケーはイギリスで最も人気のあるスポーツだったので、ボールは豊富にありました)。「原子の結合力について」、Chemical News、12 (1865、176-9、189) には、「ホフマンは 1865 年 4 月に王立研究所で行った講演で、さまざまな種類の原子を表すためにさまざまな色のクロッケーボールを使用しました (たとえば、カーボン ブラック、水素の白、塩素の緑、燃えるような酸素の赤、窒素の青)」と書かれています。[7] [8]
現代の変種
次の表は、いくつかの一般的なソフトウェア製品によって各要素に割り当てられた色を示しています。
- 列Cはコーリーとポーリングによるオリジナルの割り当てです。[3]
- K列はコルトゥンの特許の列である。[4]
- 列Jは分子可視化ツールJmolで使用される配色である。[9]
- 列RはRasmolで使用されるスキームです。2色が表示されている場合、2番目の色はバージョン2.7.3以降で有効です。[9] [10]
- 列P は、米国国立衛生研究所が管理するPubChemデータベース内の色で構成されています。
すべての色は概算であり、ディスプレイのハードウェアや表示条件によって異なる場合があります。
参照
参考文献
- ^ “Models”. 2016年4月4日時点のオリジナルよりアーカイブ。2018年9月8日閲覧。
- ^ Ollis, WD (1972). 「モデルと分子」.英国王立研究所紀要. 45 : 1–31.
- ^ ab Robert B. Corey および Linus Pauling ( 1953): アミノ酸、ペプチド、タンパク質の分子モデル。Review of Scientific Instruments、第 24 巻、第 8 号、pp. 621-627。doi :10.1063/1.1770803
- ^ ab 「CPK」は Corey-Pauling-Koltun の略です。Walter L. Koltun (1965)、「分子モデルのための空間充填原子単位およびコネクタ」。米国特許 3170246。
- ^ Helmenstine, Todd (2019-08-28). 「分子原子の色 - CPKの色」.サイエンスノートとプロジェクト. 2024-09-18閲覧。
- ^ https://www.miramodus.com/special/blog/molecular-model-colours.shtml%23 [裸のURL ]
- ^ 化学ニュースと産業科学ジャーナル、第12巻。1865年。
- ^ モーリス・P・クロスランド（1962年）。化学言語の歴史的研究。336ページ、および336ページの脚注220。ISBN 9780486438023。
- ^ ab Jmol カラーテーブル (sourceforge.net)。2010 年 1 月 28 日にアクセス。
- ^ Rasmol カラー テーブルは 2001-05-13 にarchive.today at bio.cmu.edu にアーカイブされました。2010-01-28 にアクセスされました。
外部リンク
- 物理分子モデル