ヒトのタンパク質コード遺伝子
| COPS4 |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オルソログ検索: PDBe RCSB |
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| PDB IDコードのリスト |
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4D0P、4D10、4D18、4WSN |
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| 識別子 |
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| エイリアス | COPS4、CSN4、COP9 シグナロソームサブユニット 4、SGN4 |
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| 外部ID | オミム:616008; MGI : 1349414;ホモロジーン: 8067;ジーンカード:COPS4; OMA :COPS4 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 5番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 5 E4|5 48.49 cM | 始める | 100,666,175 bp [2] |
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| 終わり | 100,695,669 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 上腕二頭筋
- 外側広筋
- 三角筋
- 上腕二頭筋の骨格筋組織
- 臀筋
- 胸郭横隔膜
- 腹直筋の骨格筋組織
- 前脛骨筋
- 右心室
- 二次卵母細胞
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| | トップの表現 | - 精子細胞
- 精母細胞
- 上顎突出
- 下顎突出
- 胎児の尾
- 耳小胞
- 精細管
- 性器結節
- 耳板
- 視索上核
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS |  | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 | | | 細胞成分 |
- 細胞質
- COP9シグナロソーム
- 細胞接合
- シナプス
- 細胞外エクソソーム
- 細胞質小胞
- シナプス小胞
- 核
- 核質
- 細胞質
- 核の粒
| | 生物学的プロセス |
- 転写連動ヌクレオチド除去修復
- ヌクレオチド除去修復、DNA損傷認識
- タンパク質の脱エデジレーション
- 翻訳後タンパク質修飾
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_001258006 NM_016129 NM_001330727 |
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NM_012001 NM_001359203 NM_001359204 |
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| RefSeq (タンパク質) | |
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NP_001244935 NP_001317656 NP_057213 |
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NP_036131 NP_001346132 NP_001346133 |
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| 場所 (UCSC) | 4 章: 83.03 – 83.08 Mb | 5 番: 100.67 – 100.7 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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COP9シグナロソーム複合体サブユニット4は、ヒトではCOPS4遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
この遺伝子は、複数のシグナル伝達経路において重要な調節因子として機能する高度に保存されたタンパク質複合体であるCOP9シグナロソームを構成する8つのサブユニットのうちの1つをコードしています。COP9シグナロソームの構造と機能は、26Sプロテアソームの19S調節粒子の構造と機能に似ています。COP9シグナロソームは、SCF型E3ユビキチンリガーゼと相互作用し、E3ユビキチンリガーゼの正の調節因子として機能することが示されています。[6]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000138663 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000035297 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Wei N, Tsuge T, Serino G, Dohmae N, Takio K, Matsui M, et al. (1998年10月). 「COP9複合体は植物と哺乳類の間で保存されており、26Sプロテアソーム調節複合体に関連している」. Curr Biol . 8 (16): 919–924. Bibcode :1998CBio....8..919W. doi : 10.1016/S0960-9822(07)00372-7 . PMID 9707402. S2CID 13873982.
- ^ ab "Entrez Gene: COPS4 COP9 構成的光形態形成ホモログサブユニット 4 (Arabidopsis)"。
外部リンク
さらに読む
- Schwechheimer C, Deng XW (2001). 「COP9シグナロソームの再考:タンパク質分解の新たなメディエーター」Trends Cell Biol . 11 (10): 420–426. doi :10.1016/S0962-8924(01)02091-8. PMID 11567875.
- Wolf DA、Zhou C、Wee S (2004)。「COP9 シグナロソーム: Cullin ユビキチンリガーゼの組み立てと維持のプラットフォーム?」Nat. Cell Biol . 5 (12): 1029–1033. doi :10.1038/ncb1203-1029. PMID 14647295. S2CID 37458780.
- Maruyama K, Sugano S (1994). 「オリゴキャッピング:真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置き換える簡単な方法」Gene . 138 (1–2): 171–174. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). 「全長濃縮cDNAライブラリーおよび5'末端濃縮cDNAライブラリーの構築と特性評価」. Gene . 200 (1–2): 149–156. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
- Seeger M、Kraft R、Ferrell K、Bech-Otschir D、Dumdey R、Schade R、et al. (1998)。「26Sプロテアソームサブユニットとの類似性を持つシグナル伝達に関与する新規タンパク質複合体」。FASEB J. 12 ( 6): 469–78. doi : 10.1096/fasebj.12.6.469 . PMID 9535219. S2CID 25424324.
- サンガーセンターT、ワシントン大学ゲノムシークエンシングセンターT (1999)。「完全なヒトゲノム配列に向けて」。 ゲノム研究。8 (11): 1097–108。doi : 10.1101/gr.8.11.1097。PMID 9847074。
- Naumann M、Bech-Otschir D、Huang X、Ferrell K、Dubiel W (2000)。「COP9 シグナルソームによる c-Jun の活性化/安定化は JNK に依存しない」( PDF )。J . Biol. Chem . 274 (50): 35297–35300。doi : 10.1074/ jbc.274.50.35297。PMID 10585392。S2CID 27417298 。
- Cohen H、Azriel A、Cohen T、Meraro D、Hashmueli S、Bech-Otschir D、et al. (2001)。「インターフェロンコンセンサス配列結合タンパク質とCOP9/シグナロソームサブユニットCSN2(Trip15)間の相互作用。インターフェロン調節因子シグナル伝達とCOP9/シグナロソーム間の可能性のあるリンク」。J . Biol. Chem . 275 (50): 39081–39089. doi : 10.1074/jbc.M004900200 . PMID 10991940。
- Tsuge T, Matsui M, Wei N (2001). 「COP9シグナロソームのサブユニット1は、N末端ドメインを介して遺伝子発現を抑制し、PCIドメインを介して複合体に組み込まれます」。J. Mol. Biol . 305 (1): 1–9. doi :10.1006/jmbi.2000.4288. PMID 11114242。
- Bech-Otschir D, Kraft R, Huang X, Henklein P, Kapelari B, Pollmann C, et al. (2001). 「COP9 シグナルソーム特異的リン酸化は、ユビキチンシステムによる p53 の分解を標的とする」。EMBO J. 20 ( 7): 1630–1639. doi : 10.1093 /emboj/20.7.1630. PMC 145508. PMID 11285227.
- Lyapina S, Cope G, Shevchenko A, Serino G, Tsuge T, Zhou C, et al. (2001). 「COP9 シグナロソームによる NEDD-CUL1 結合体切断の促進」. Science . 292 (5520): 1382–1385. Bibcode :2001Sci...292.1382L. doi :10.1126/science.1059780. PMID 11337588. S2CID 14224920.
- Peyrl A、Weitzdoerfer R、Gulesserian T、Fountoulakis M、Lubec G (2003)。「胎児ダウン症候群脳(トリソミー21)におけるシグナル伝達関連タンパク質14-3-3ガンマおよびRACK1の異常発現」。電気泳動。23 ( 1 ):152–7。doi : 10.1002/1522-2683(200201)23:1<152::AID- ELPS152 >3.0.CO;2-T。PMID 11824616。S2CID 12931652 。
- Hoareau Alves K、Bochard V、Réty S、Jalinot P (2002)。「哺乳類のプロトオンコプロテイン Int-6 と 3 つのタンパク質複合体 eIF3、COP9 シグナロソーム、26S プロテアソームとの関連」。FEBS Lett . 527 (1–3): 15–21. doi : 10.1016/S0014-5793(02)03147-2 . PMID 12220626. S2CID 39308598.
- Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、Derge JG、Klausner RD、Collins FS、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–16903。Bibcode : 2002PNAS ...9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
- Serino G、Su H、Peng Z、Tsuge T、Wei N、Gu H、et al. (2003)。「シロイヌナズナ COP9 シグナロソームの最後のサブユニットの特性: 複合体の全体構造と起源への影響」。Plant Cell . 15 (3): 719–731. doi :10.1105/tpc.009092. PMC 150025. PMID 12615944 。
- Uhle S, Medalia O, Waldron R, Dumdey R, Henklein P, Bech-Otschir D, et al. (2003). 「タンパク質キナーゼ CK2 とタンパク質キナーゼ D は COP9 シグナロソームと関連している」. EMBO J. 22 ( 6): 1302–1312. doi :10.1093/emboj/cdg127. PMC 151059. PMID 12628923.
- Groisman R, Polanowska J, Kuraoka I, Sawada JI, Saijo M, Drapkin R, et al. (2003). 「DDB2 および CSA 複合体のユビキチンリガーゼ活性は、DNA 損傷に応答して COP9 シグナロソームによって異なる制御を受ける」. Cell . 113 (3): 357–367. doi : 10.1016/S0092-8674(03)00316-7 . PMID 12732143. S2CID 11639677.