ヒトのタンパク質コード遺伝子
CNOT2 利用可能な構造 PDB オルソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 4C0D、4C0F、5FU6、5FU7
識別子 エイリアス CNOT2 、CDC36、NOT2、NOT2H、HSPC131、CCR4-NOT転写複合体サブユニット2、IDNADFS 外部ID オミム :604909; MGI : 1919318; ホモロジーン : 40953; ジーンカード :CNOT2; OMA :CNOT2 - オルソログ 遺伝子の位置( マウス ) クロ。 染色体10(マウス) [2] バンド 10|10 D2 始める 116,321,066 bp [2] 終わり 116,417,416 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス (相同遺伝子) トップの表現 卵母細胞 二次卵母細胞 アキレス腱 乳首 鼻咽頭上皮 人間のペニス 結腸上皮 神経節隆起 腹部の皮膚 小脳皮質
トップの表現 性器結節 毛様体 内頸動脈 外頸動脈 髄質集合管 虹彩 胎児の尾 原始的な線 網膜色素上皮 積雲細胞
参照表現データの詳細
バイオGPS 参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー 分子機能
ポリ(A)特異的リボヌクレアーゼ活性
転写共調節活性
タンパク質結合
細胞成分
細胞質
膜
CCR4-NOT複合体
Pボディ
CCR4-NOTコア複合体
核
細胞質
細胞膜
生物学的プロセス
核転写されたmRNAポリ(A)テールの短縮
翻訳の否定的規制
転写の調節、DNAテンプレート
RNAポリメラーゼIIによる転写の調節
幹細胞集団維持の調節
RNAポリメラーゼIIによる転写の負の制御
転写、DNAテンプレート
多細胞生物の発達
細胞質mRNA処理体の組み立ての正の調節
栄養外胚葉細胞の分化
遺伝子サイレンシング
細胞内エストロゲン受容体シグナル伝達経路の負の調節
翻訳の規制
核転写されたmRNAの分解過程、脱アデニル化依存性分解
DNA損傷応答、p53クラスメディエーターによるシグナル伝達により細胞周期停止を引き起こす
RNAホスホジエステル結合加水分解、エキソヌクレアーゼ
出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_001199302 NM_001199303 NM_014515
NM_001037846 NM_001037847 NM_001037848 NM_028082 NM_001359247 NM_001359248 NM_001359249 NM_001359250 NM_001359251 NM_001359252 NM_001359253 NM_001359563
RefSeq (タンパク質) NP_001186231 NP_001186232 NP_055330
NP_001032935 NP_001032936 NP_001032937 NP_082358 NP_001346176 NP_001346177 NP_001346178 NP_001346179 NP_001346180 NP_001346181 NP_001346182 NP_001346492
場所 (UCSC) 12 章: 70.24 – 70.35 Mb 10 章: 116.32 – 116.42 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
CCR4-NOT転写複合体サブユニット2は、ヒトでは CNOT2 遺伝子 によってコードされる タンパク質 である 。 [5] [6]これは CCR4-Not デアデニラーゼ 複合体のサブユニットである 。
参考文献
^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000111596 – Ensembl 、2017 年 5 月
^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000020166 – Ensembl 、2017 年 5 月
^ 「Human PubMed Reference:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。
^ 「マウス PubMed リファレンス:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。
^ Albert TK、Lemaire M、van Berkum NL、Gentz R、Collart MA、Timmers HT (2000 年 3 月)。「酵母 CCR4-NOT 複合体サブユニットのヒト相同遺伝子の単離と特性評価」。Nucleic Acids Res . 28 (3): 809–17. doi :10.1093/nar/28.3.809. PMC 102560 . PMID 10637334。
^ 「Entrez Gene: CNOT2 CCR4-NOT 転写複合体、サブユニット 2」。
外部リンク
さらに読む
Zhang QH、Ye M、Wu XY、他 (2001)。「CD34+ 造血幹細胞/前駆細胞で発現する、これまで未定義であった 300 個の遺伝子のオープンリーディングフレームを持つ cDNA のクローニングと機能解析」。Genome Res . 10 (10): 1546–60. doi :10.1101/gr.140200. PMC 310934 . PMID 11042152。
Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932 。
太田 孝文、鈴木 勇、西川 孝文、他 (2004)。「21,243 個の完全長ヒト cDNA の完全な配列決定と特性解析」。Nat . Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039。
Zwartjes CG、Jayne S、van den Berg DL、Timmers HT (2004)。「転写調節Ccr4-not複合体のサブユニットであるCNOT2によるプロモーター活性の抑制」。J . Biol. Chem . 279 (12): 10848–54. doi : 10.1074/jbc.M311747200 . PMID 14707134。
Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの現状、品質、拡大: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。 Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。
Shi J、Nelson MA (2005)。「サイクリン依存性キナーゼ11はNOT2と相互作用する」。Biochem . Biophys. Res. Commun . 334 (4): 1310–6. doi :10.1016/j.bbrc.2005.07.026. PMID 16039607。
Rual JF、Venkatesan K、Hao T、他 (2005)。「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。Nature . 437 ( 7062 ) : 1173–8。Bibcode :2005Natur.437.1173R。doi : 10.1038 /nature04209。PMID 16189514。S2CID 4427026。
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, et al. (2006). 「転写調節の多様化: ヒト遺伝子の推定代替プロモーターの大規模な同定と特性評価」 Genome Res . 16 (1): 55–65. doi :10.1101/gr.4039406. PMC 1356129. PMID 16344560 .
Jayne S、Zwartjes CG、van Schaik FM、Timmers HT (2006)。「ヒトCcr4-Not複合体のCNOT2サブユニットによる転写抑制におけるSMRT/NCoR-HDAC3複合体の関与」。Biochem . J. 398 ( 3): 461–7. doi :10.1042/BJ20060406. PMC 1559471. PMID 16712523 。