ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| CLDN1 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | CLDN1、CLD1、ILVASC、SEMP1、クローディン1 |
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| 外部ID | オミム:603718; MGI : 1276109;ホモロジーン:9620;ジーンカード:CLDN1; OMA :CLDN1 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 16番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 16|16 B2 | 始める | 26,175,392 bp [2] |
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| 終わり | 26,190,591 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 太ももの皮
- 胚上皮
- ヒップの皮膚
- 腹部の皮膚
- 鼻粘膜の嗅覚領域
- 鼻咽頭上皮
- 左子宮管
- 肝臓の右葉
- 乳首
- 歯肉上皮
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| | トップの表現 | - 網膜色素上皮
- 脱落膜
- 臼歯
- 外耳の皮膚
- リップ
- 脈絡叢上皮
- 表皮
- 毛包
- 腹部の皮膚
- 腰椎神経節
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS |  | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- タンパク質結合
- 構造分子活性
- 同一のタンパク質結合
- ウイルス受容体活性
| | 細胞成分 |
- 膜
- 膜の不可欠な構成要素
- 細胞接合
- 細胞膜
- 細胞膜の不可欠な構成要素
- 頂端細胞膜
- 側方細胞膜
- 二細胞タイトジャンクション
- 細胞質
- 基底外側細胞膜
| | 生物学的プロセス |
- ウイルスが宿主細胞に侵入する
- 細胞間結合の組織
- 細胞膜細胞接着分子を介したカルシウム非依存性細胞間接着
- ウイルスプロセス
- タンパク質ホモオリゴマー化
- タンパク質ヘテロオリゴマー化
- 皮膚バリアの確立
- 二細胞タイトジャンクションアセンブリ
- エージング
- 血液神経関門の確立
- 毒性物質に対する反応
- リポ多糖類に対する反応
- 高浸透圧塩分反応
- エタノールに対する反応
- 血液神経関門を介した異物輸送
- インターロイキン18に対する反応
- 鉛イオンに対する細胞反応
- インターフェロン-γに対する細胞反応
- 腫瘍壊死因子に対する細胞反応
- デキサメタゾンに対する反応
- トランスフォーミング成長因子ベータ刺激に対する細胞反応
- 腸管内皮バリアの確立
- 肝臓再生
- 二細胞タイトジャンクションの組み立ての正の調節
- 酪酸に対する細胞反応
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| ウィキデータ |
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クローディン1は、ヒトではCLDN1遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]これはクローディンのグループに属する。
関数
タイトジャンクションは、上皮細胞または内皮細胞シートにおける細胞間接着の 1 つのモードを表し、細胞の周囲に連続シールを形成し、溶質と水が細胞間空間を自由に通過するのを防ぐ物理的な障壁として機能します。これらのジャンクションは、外側を向いた細胞質リーフレットの連続ネットワーク ストランドのセットと、内側を向いた細胞質外リーフレットの補完的な溝で構成されています。この遺伝子によってコードされるタンパク質は、クローディン ファミリーのメンバーであり、不可欠な膜タンパク質であり、タイトジャンクション ストランドの成分です。機能喪失変異は、新生児魚鱗癬-硬化性胆管炎症候群を引き起こします。[7]
インタラクション
CLDN1はCLDN5 [8]およびCLDN3 [8]と相互作用することが示されている。
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000163347 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000022512 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Halford S、Spencer P、Greenwood J、Winton H、Hunt DM、Adamson P (2000 年 6 月)。「体細胞ハイブリッドによるヒト染色体 3q28-->q29 への claudin-1 (CLDN1) の割り当て」。Cytogenet。Cell Genet。88 ( 3–4 ) : 217。doi : 10.1159/000015553。PMID 10828592。S2CID 8896678。
- ^ Morita K, Furuse M, Fujimoto K, Tsukita S (1999年3月). 「タイトジャンクション鎖の4つの膜貫通ドメインタンパク質成分をコードするClaudin多重遺伝子ファミリー」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 96 (2): 511–6. Bibcode :1999PNAS...96..511M. doi : 10.1073/pnas.96.2.511 . PMC 15167 . PMID 9892664.
- ^ 「Entrez Gene: CLDN1 claudin 1」.
- ^ ab Coyne CB、Gambling TM、Boucher RC、Carson JL、Johnson LG (2003 年 11 月)。「気道タイトジャンクション透過性におけるクローディン相互作用の役割」。Am . J. Physiol. Lung Cell Mol. Physiol . 285 (5): L1166-78. doi :10.1152/ajplung.00182.2003. PMID 12909588。
外部リンク
さらに読む
- Kniesel U, Wolburg H (2000). 「血液脳関門のタイトジャンクション」. Cell. Mol. Neurobiol . 20 (1): 57–76. doi :10.1023/A:1006995910836. PMID 10690502. S2CID 26473781.
- Heiskala M、Peterson PA、Yang Y (2001)。「細胞間輸送におけるクローディンスーパーファミリータンパク質の役割」。Traffic . 2 ( 2): 93–8. doi :10.1034/j.1600-0854.2001.020203.x. PMID 11247307. S2CID 12132159。
- Tsukita S, Furuse M, Itoh M (2001). 「タイトジャンクションにおける多機能鎖」Nat. Rev. Mol. Cell Biol . 2 (4): 285–93. doi :10.1038/35067088. PMID 11283726. S2CID 36524601.
- Tsukita S, Furuse M (2002). 「単純細胞シートと層状細胞シートにおけるクローディンベースのバリア」Curr. Opin. Cell Biol . 14 (5): 531–6. doi :10.1016/S0955-0674(02)00362-9. PMID 12231346.
- ゴンサレス・マリスカル L、ベタンソス A、ナバ P、ハラミージョ BE (2003)。 「タイトジャンクションタンパク質」。プログレ。生物物理学。モル。バイオル。81 (1): 1-44。土井:10.1016/S0079-6107(02)00037-8。PMID 12475568。
- Swisshelm K、Macek R、Kubbies M (2005)。「腫瘍形成におけるクローディンの役割」。Adv . Drug Deliv. Rev. 57 ( 6): 919–28. doi :10.1016/j.addr.2005.01.006. PMID 15820559。
- King JE、Eugenin EA、Buckner CM、Berman JW (2006)。「HIV tat と神経毒性」。Microbes Infect . 8 (5): 1347–57. doi : 10.1016/j.micinf.2005.11.014 . PMID 16697675。
- Ye J (2007). 「C型肝炎ウイルスのライフサイクルにおける宿主コレステロール代謝経路の依存性」PLOS Pathog . 3 (8): e108. doi : 10.1371/journal.ppat.0030108 . PMC 1959368 . PMID 17784784.
- 古瀬 正之、藤田 健、柊 剛、藤本 健、月田 聡 (1998)。「クローディン-1 および -2: オクルディンと配列類似性のないタイトジャンクションに局在する新規膜貫通タンパク質」。J . Cell Biol . 141 (7): 1539–50. doi :10.1083/jcb.141.7.1539. PMC 2132999. PMID 9647647 。
- Swisshelm K、Machl A、Planitzer S、Robertson R、Kubbies M、Hosier S (1999)。「ヒト乳腺上皮細胞から単離された老化関連cDNAであるSEMP1は、上皮膜タンパク質スーパーファミリーのメンバーである」。Gene . 226 (2 ) : 285–95. doi :10.1016/S0378-1119(98)00553-8. PMID 9931503。
- 古瀬 正之、佐々木 秀次、月田 聡 (1999)。「タイトジャンクション鎖内およびタイトジャンクション鎖間における異種クローディン種の相互作用様式」。J . Cell Biol . 147 (4): 891–903. doi :10.1083/jcb.147.4.891. PMC 2156154. PMID 10562289 。
- 伊藤正人、古瀬正人、森田和人、久保田和也、斉藤正人、築田真司 (1999) 「タイトジャンクションに関連する 3 つの MAGUK、ZO-1、ZO-2、および ZO-3 とクローディンの COOH 末端との直接結合」。J.セルバイオル.147 (6): 1351–63。土井:10.1083/jcb.147.6.1351。PMC 2168087。PMID 10601346。
- Krämer F, White K, Kubbies M, Swisshelm K, Weber BH (2000). 「クローディン-1 のゲノム構成と遺伝性および散発性乳がんにおけるその評価」Hum. Genet . 107 (3): 249–56. doi :10.1007/s004390000375. PMID 11071387. S2CID 24898101.
- Miyamori H, Takino T, Kobayashi Y, Tokai H, Itoh Y, Seiki M, Sato H (2001). 「クローディンは膜型マトリックスメタロプロテアーゼを介してプロマトリックスメタロプロテアーゼ-2の活性化を促進する」J. Biol. Chem . 276 (30): 28204–11. doi : 10.1074/jbc.M103083200 . hdl : 2297/15688 . PMID 11382769.
- Hamazaki Y, Itoh M, Sasaki H, Furuse M, Tsukita S (2002). 「マルチPDZドメインタンパク質1(MUPP1)は、クローディン-1およびジャンクション接着分子との相互作用を介してタイトジャンクションに集中している」J. Biol. Chem . 277 (1): 455–61. doi : 10.1074/jbc.M109005200 . hdl : 2433/148697 . PMID 11689568.
- Liu F、Koval M、Ranganathan S、Fanayan S、Hancock WS、Lundberg EK、Beavis RC、Lane L、Duek P、McQuade L、Kelleher NL、Baker MS (2015)。「内因性ヒトクローディンタンパク質ファミリーのシステムプロテオミクス的視点」。J Proteome Res . 15 (2): 339–359. doi :10.1021/acs.jproteome.5b00769. PMC 4777318. PMID 26680015 .