第二次世界大戦のバルカン戦線は、 1940年10月28日のイタリアによるギリシャ侵攻で始まった。1941年初頭、イタリアの攻勢は行き詰まり、ギリシャの反攻はアルバニアへと進んだ。ドイツはルーマニアとブルガリアに部隊を派遣し、東からギリシャを攻撃することでイタリアを支援しようとした。一方、イギリスはギリシャの防衛を強化するために部隊と航空機を上陸させた。3月27日にユーゴスラビアでクーデターが発生し、アドルフ・ヒトラーは同国の征服を命じた。
ドイツとイタリアによるユーゴスラビア侵攻は、ギリシャ侵攻再開と同時に1941年4月6日に開始された。4月11日にはハンガリーもユーゴスラビア侵攻に加わった。4月17日までにユーゴスラビアは休戦協定に署名し、4月30日までにギリシャ本土全域がドイツまたはイタリアの支配下に置かれた。5月20日、ドイツはクレタ島に空爆を行い、6月1日までに島に残っていたギリシャ軍とイギリス軍はすべて降伏した。ブルガリアは4月の攻撃には参加していなかったものの、その後まもなくユーゴスラビアとギリシャの一部を占領し、バルカン半島での戦争が終わるまでその状態が続いた。
第一次世界大戦後、オスマン帝国とオーストリア=ハンガリー帝国が完全に崩壊すると、アルバニア人は伝統的な敵から身を守るためにイタリア王国に頼るようになった。1919年、アメリカ合衆国大統領ウッドロー・ウィルソンがアルバニアを近隣諸国に分割するというヨーロッパ列強の計画に反対したことで、パリ講和会議でアルバニアの領土保全が確認された。しかし、1925年以降、イタリアの独裁者ベニート・ムッソリーニはアルバニアを支配しようとした。1928年、アルバニアは氏族長で元首相のゾグ1世の下で王国となった。ゾグはアルバニアの内政におけるイタリアの台頭を阻止できなかった。1939年4月7日、イタリア軍はアルバニアに侵攻し、ゾグを打倒し、アルバニアをイタリア帝国に併合した。
イタリアによるギリシャ侵攻は1940年10月28日から1941年4月30日まで続いた。イタリア軍はギリシャに侵攻し、限定的な戦果を挙げた。しかし、すぐにギリシャ軍が反撃し、イタリア軍はアルバニア国境まで押し戻された。この間、イギリスはイギリス空軍でギリシャを支援していたが、北アフリカでの作戦のため、イギリスと英連邦の地上部隊のギリシャへの到着は遅れた。イタリア軍は冬の大半を戦線の安定化に費やし、アルバニアの約3分の2しか支配できていなかった。1941年3月に待望されていたイタリア軍の攻勢は、領土の獲得はほとんどなかった。アドルフ・ヒトラー率いるドイツは4月に介入し、ユーゴスラビア侵攻の成功後、ギリシャに侵攻した。一方、イタリア第9軍と第11軍は、撤退するギリシャ軍部隊を本土まで追撃し始めた。ギリシャ軍部隊は後衛としてイタリア軍と戦い、進軍を可能な限り遅らせたものの、4月23日、ギリシャはイタリアとドイツの両国に正式に降伏した。

ユーゴスラビア侵攻(「25作戦」とも呼ばれる)は1941年4月6日に始まり、4月17日にユーゴスラビア王国軍が無条件降伏して終了した。侵攻した枢軸国(ナチス・ドイツ、ファシスト・イタリア、ハンガリー)はユーゴスラビア王国を占領し、分割した。ドイツとイタリアは、ボスニア・ヘルツェゴビナ、クロアチアの一部、シルミアを寄せ集めて「クロアチア独立国」(Nezavisna Država Hrvatska、NDH)を創設した。旧セルビア王国とバナトの一部、セルビア軍司令官のドイツ占領地域では、ドイツはミラン・ネディッチ率いる国民救済政府という傀儡政権を任命した。モンテネグロはイタリアの占領下に留まり、ブルガリアはユーゴスラビア東部地域、すなわち現在の北マケドニアの大部分を併合することを許可された。

ヒトラーは、イギリスがクレタ島とレムノス島を占領した後、1940年11月にギリシャ侵攻の計画を始めた。彼は1940年12月13日にギリシャ侵攻(作戦名:マリタ作戦)を命じ、1941年3月に実行した。作戦の目的は、イギリスがルーマニアの油田を攻撃できる範囲内に空軍基地を持つのを阻止することであった。[ 1 ] 1941年4月6日、ドイツ軍はギリシャ北部に侵攻し、他の部隊はユーゴスラビアへの攻撃を開始した。ユーゴスラビア南部でユーゴスラビア軍の戦線を突破したことで、ドイツはギリシャ北部の戦場に増援を送ることができた。ドイツ軍はギリシャのメタクサス線の要塞を迂回し、イギリス遠征軍の支援にもかかわらず、ギリシャ南部の都市を占領し始めた。ギリシャの戦いは、ドイツ軍のアテネ入城とペロポネソス半島の占領で終結したが、約4万人の連合軍兵士がクレタ島に避難し、これが戦争史上最大規模の空挺作戦の一つであるメルクール作戦、あるいはクレタ島の戦いへとつながった。
1941年5月20日、ドイツ空挺部隊がクレタ島北部の飛行場に降下し、島を占領した。連合軍と地元住民は激しく抵抗したが、最終的にドイツ軍は防衛部隊を圧倒した。イギリス政府は5月27日に撤退を命じ、残存部隊は6月1日に降伏した。しかし、空挺部隊の甚大な損害は、ドイツ国防軍最高司令部が終戦まで大規模な空挺作戦を断念するに至った。

1941年6月1日までに、アルバニア、ユーゴスラビア、ギリシャのすべてが枢軸国の支配下に入った。ギリシャは三重占領下に置かれ、ユーゴスラビアは解体され占領された。ドイツは地中海への直接アクセスという、重要な戦略的優位性を獲得した。
1941年4月6日、ブルガリア政府は正式に枢軸国に加わったにもかかわらず、ユーゴスラビア侵攻とギリシャの戦いには参加しなかった。4月20日、ブルガリア軍は西トラキアの大部分と、すでにドイツに占領されていたギリシャの東マケドニア地方を占領し、第一次世界大戦前のエーゲ海への出口を回復することを目指した。ブルガリア軍はまた、東セルビアの大部分も占領し、ヴァルダル・バノヴィナ地方はブルガリアとイタリアによって分割された。
戦争終結までの間、ユーゴスラビア、ギリシャ、アルバニアの活発な抵抗運動により、ドイツとその同盟国は3カ国に数十万もの兵士を常駐させざるを得なくなり、他の戦線への兵力配分が制限された。特に1943年以降のユーゴスラビアでは、連合軍の侵攻の脅威とパルチザンの活動により、複数の師団を投入する大規模な対反乱作戦が必要となった。