ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| ＢＨＬＥ４０ |
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| 識別子 |
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| エイリアス | BHLHE40、BHLHB2、DEC1、HLHB2、SHARP-2、STRA13、Stra14、基本ヘリックスループヘリックスファミリーメンバーe40、Clast5、SHARP2 |
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| 外部ID | オミム：604256; MGI : 1097714;ホモロジーン: 2722;ジーンカード：BHLHE40; OMA :BHLHE40 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置（マウス） |
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 | | クロ。 | 染色体6（マウス）[2] |
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| | バンド | 6|6 E2 | 始める | 108,637,590 bp [2] |
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| 終わり | 108,643,886 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス（相同遺伝子） |
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| トップの表現 | - 伏在静脈
- 大静脈
- ベータ細胞
- 咽頭粘膜
- 滑膜関節
- 心膜
- 精巣上体の尾
- 胃粘膜
- 副鼻腔粘膜
- 人間のペニス
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| | トップの表現 | - 足首
- 脱落膜
- 足底筋
- 長趾伸筋
- 頸部
- 虹彩
- 肝臓の左葉
- 前脛骨筋
- 毛様体
- 上腕三頭筋
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | 
 | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- DNA結合
- タンパク質二量体化活性
- タンパク質ホモ二量体化活性
- MRF バインディング
- 転写コリプレッサー活性
- タンパク質ドメイン特異的結合
- DNA結合転写因子活性
- DNA結合転写抑制活性、RNAポリメラーゼII特異的
- bHLH転写因子結合
- Eボックスバインディング
- タンパク質結合
- タンパク質ヘテロ二量体形成活性
- 転写因子活性、RNAポリメラーゼII遠位エンハンサー配列特異的結合
- DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的
- RNAポリメラーゼII転写調節領域配列特異的DNA結合
- RNAポリメラーゼIIシス調節領域配列特異的DNA結合
- 転写因子結合
- 配列特異的DNA結合
- 配列特異的二本鎖DNA結合
| | 細胞成分 | | | 生物学的プロセス |
- 転写の調節、DNAテンプレート
- 光刺激に対する反応
- リズミカルなプロセス
- RNAポリメラーゼIIによる転写の負の制御
- 遺伝子発現の概日リズム調節
- 転写、DNAテンプレート
- DNA結合転写因子活性の負の制御
- 転写の負の調節、DNAテンプレート
- 光周期による概日時計の同調
- 概日リズム
- 体節形成
- ノッチシグナル伝達経路
- 細胞分化
- 神経新生の調節
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| ウィキデータ |
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クラスE基本ヘリックスループヘリックスタンパク質40は、ヒトではBHLHE40遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6] [7] [8]
関数
DEC1は、様々な組織で発現する基本的なヘリックスループヘリックスタンパク質をコードしています。軟骨細胞での発現は、Bt2cAMPの添加に反応します。分化した胚軟骨細胞発現遺伝子1は、細胞分化の制御に関与していると考えられています。[8]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000134107 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000030103 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 沈 M、川本 哲、ヤン W、中増 K、玉上 M、小谷野 Y、能代 M、加藤 Y (1997 年 7 月)。 「分化したヒト胎児軟骨細胞で発現される新規の塩基性ヘリックス-ループ-ヘリックスタンパク質DEC1の分子特性評価」。生化学および生物物理学研究コミュニケーション。236 (2): 294–8。土井：10.1006/bbrc.1997.6960。PMID 9240428。
- ^ Antonevich T, Taneja R (1999年10月). 「in situハイブリダイゼーションによるヒトStra13遺伝子（STRA13）の染色体3p26への割り当て」.細胞遺伝学と細胞遺伝学. 85 (3–4): 254–5. doi :10.1159/000015305. PMID 10449910. S2CID 25761427.
- ^ Stevens JD、Roalson EH、Skinner MK (2008 年 11 月)。「基本ヘリックスループヘリックス転写因子遺伝子ファミリーの系統発生および発現解析: 細胞分化へのゲノムアプローチ」。分化;生物多様性研究。76 ( 9 ): 1006–22。doi :10.1111/ j.1432-0436.2008.00285.x。PMC 5728086。PMID 18557763。
- ^ ab "Entrez Gene: BHLHB2 基本ヘリックス-ループ-ヘリックスドメインを含む、クラス B、2"。
さらに読む
- 寺本正人、中増和人、能代正人、松田裕也、後藤央、沈正人、堤茂、川本哲也、岩本裕也、加藤裕也 (2001年3月)。 「ヒトbHLH転写因子DEC1×Stra13×SHARP-2/BHLHB2の遺伝子構造と染色体位置」。生化学ジャーナル。129 (3): 391-6。土井：10.1093/oxfordjournals.jbchem.a002869。PMID 11226878。
- Ivanova AV、Ivanov SV、Danilkovitch-Miagkova A、Lerman MI (2001 年 5 月)。「フォン ヒッペル リンドウ腫瘍抑制タンパク質、低酸素、UBC9/ユビキチン プロテアソーム分解経路による STRA13 の調節」。The Journal of Biological Chemistry。276 ( 18): 15306–15。doi : 10.1074/jbc.M010516200。PMID 11278694。
- Sun H、Lu B、Li RQ、Flavell RA 、Taneja R (2001 年 11 月)。「Stra13 欠損マウスにおける T 細胞活性化の欠陥と自己免疫疾患」。Nature Immunology。2 ( 11 ): 1040–7。doi :10.1038/ni721。PMID 11668339。S2CID 26633291 。
- Yoon DY、Buchler P、Saarikoski ST、Hines OJ、Reber HA、Hankinson O (2001 年 11 月)。「膵臓癌細胞における低酸素によって特異的に誘導される遺伝子の同定」。生化学および生物物理学的研究通信。288 (4): 882–6。doi :10.1006/bbrc.2001.5867。PMID 11688991 。
- Li Y、Zhang H、Xie M、Hu M、Ge S、Yang D、Wan Y、Yan B (2002 年 10 月)。「結腸癌における Dec1/stra13/sharp2 の豊富な発現: 血清欠乏誘導性アポトーシスおよびプロカスパーゼ活性化の選択的阻害における拮抗的役割」。The Biochemical Journal。367 ( Pt 2 ) : 413–22。doi :10.1042/BJ20020514。PMC 1222902。PMID 12119049。
- St-Pierre B、Flock G、 Zacksenhaus E、Egan SE (2002 年 11 月)。「Stra13 ホモダイマーはクラス B E ボックス要素を介して転写を抑制する」。The Journal of Biological Chemistry。277 ( 48): 46544–51。doi : 10.1074/ jbc.M111652200。PMID 12297495。
- 宮崎 K、川本 孝文、谷本 健、西山 正之、本田 秀、加藤 勇 (2002 年 12 月)。「DEC1 および DEC2 遺伝子のプロモーター領域における機能的低酸素応答要素の同定」。The Journal of Biological Chemistry。277 ( 49): 47014–21。doi : 10.1074/ jbc.M204938200。PMID 12354771。
- Shen M、Yoshida E、Yan W、Kawamoto T、Suardita K、Koyano Y、Fujimoto K、Noshiro M、Kato Y (2002 年 12 月)。「基本ヘリックスループヘリックスタンパク質 DEC1 は、初期および最終段階で軟骨細胞の分化を促進する」。The Journal of Biological Chemistry。277 ( 51): 50112–20。doi : 10.1074/jbc.M206771200。PMID 12384505。
- Honma S, Kawamoto T, Takagi Y, Fujimoto K, Sato F, Noshiro M, Kato Y, Honma K (2002 年 10 月). 「Dec1 と Dec2 は哺乳類の分子時計の調節因子である」. Nature . 419 (6909): 841–4. Bibcode :2002Natur.419..841H. doi :10.1038/nature01123. PMID 12397359. S2CID 4426418.
- Li Y、Xie M、Song X、Gragen S、Sachdeva K、Wan Y、Yan B (2003 年 5 月)。「DEC1 は近位プロモーターの E ボックスに結合することで DEC2 の発現を負に制御する」。The Journal of Biological Chemistry。278 ( 19): 16899–907。doi : 10.1074/ jbc.M300596200。PMID 12624110。
- Giatromanolaki A、Koukourakis MI、Sivridis E、Turley H、Wykoff CC、Gatter KC、Harris AL (2003 年 6 月)。「DEC1 (STRA13) タンパク質発現は、非小細胞肺癌における低酸素誘導因子 1-α および炭酸脱水酵素 9 の過剰発現に関連する」。The Journal of Pathology。200 ( 2) : 222–8。doi :10.1002/path.1330。PMID 12754744。S2CID 26744393 。
- Ivanova AV、Ivanov SV、Zhang X、Ivanov VN、Timofeeva OA、Lerman MI (2004 年 7 月)。「STRA13 は STAT3 と相互作用し、STAT3 依存性ターゲットの転写を調節する」。Journal of Molecular Biology。340 ( 4): 641–53。doi :10.1016/ j.jmb.2004.05.025。PMID 15223310 。
- Sato F, Kawamoto T, Fujimoto K, Noshiro M, Honda KK, Honma S, Honma K, Kato Y (2004 年 11 月)。「概日リズム調節における基本ヘリックスループヘリックス転写因子 DEC1 の機能解析。BMAL1 との相互作用」。European Journal of Biochemistry . 271 (22): 4409–19. doi : 10.1111/j.1432-1033.2004.04379.x . PMID 15560782。
- Ivanova AV、Ivanov SV、 Lerman ML (2005 年 2 月)。「STRA13 および MSP58 タンパク質の会合、相互安定化、および転写活性」。細胞および分子生命科学。62 (4): 471–84。doi :10.1007/s00018-004-4423-2。PMID 15719173。S2CID 6528873 。
- Ivanova A、Liao SY、Lerman MI、Ivanov S、Stanbridge EJ (2005 年 7 月)。「正常組織と腫瘍組織における STRA13 の発現と細胞内局在: 診断および分化マーカーとしての使用への影響」。Journal of Medical Genetics。42 ( 7): 565–76。doi : 10.1136 /jmg.2004.029835。PMC 1736099。PMID 15994878。
- シュテルツル U、ヴォルム U、ラロウスキー M、ヘニヒ C、ブレンベック FH、ゲーラー H、ストロイッケ M、ツェンクナー M、シェーンヘル A、ケッペン S、ティム J、ミンツラフ S、エイブラハム C、ボック N、キーツマン S、ゲーデ A、トクセシュ E 、ドローゲ A、クロビッチ S、コーン B、バーヒマイヤー W、 Lehrach H、Wanker EE (2005 年 9 月)。 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワーク: プロテオームに注釈を付けるためのリソース」。セル。122 (6): 957–68。土井：10.1016/j.cell.2005.08.029。hdl : 11858/00-001M-0000-0010-8592-0。PMID 16169070。S2CID 8235923 。
外部リンク
この記事には、パブリックドメインである米国国立医学図書館のテキストが組み込まれています。
