ヒトのタンパク質コード遺伝子
| BCOR |
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| 利用可能な構造 |
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| 電子データ | オルソログ検索: PDBe RCSB |
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| PDB IDコードのリスト |
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3BIM、4HPL、2N1L |
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| 識別子 |
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| エイリアス | BCOR、ANOP2、MAA2、MCOPS2、BCL6コリプレッサー |
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| 外部ID | OMIM : 300485; MGI : 1918708;ホモロジーン: 9809;ジーンカード:BCOR; OMA :BCOR - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | X染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | X|X A1.1 | 始める | 11,902,979 bp [2] |
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| 終わり | 12,026,594 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 頬粘膜細胞
- 神経節隆起
- 心室帯
- 生殖腺
- 脛骨動脈
- 腓腹筋
- 太ももの筋肉
- 左卵巣
- ランゲルハンス島
- 胸部大動脈下行
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| | トップの表現 | - 手
- 胎児の尾
- 耳石器官
- 上行大動脈
- 卵形嚢
- 顎下腺
- 大動脈弁
- 原腸胚
- リンパ節
- 上頸部神経節
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS |  | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- 熱ショックタンパク質結合
- 転写因子結合
- ヒストン脱アセチル化酵素結合
- ユビキチンタンパク質転移酵素活性
- タンパク質結合
- 転写コリプレッサー活性
- RNAポリメラーゼII転写調節領域配列特異的DNA結合
| | 細胞成分 |
- PcGタンパク質複合体
- 核
- BCOR コンプレックス
| | 生物学的プロセス |
- 口蓋の発達
- 骨の石灰化の抑制
- 転写の調節、DNAテンプレート
- ヒストンH3-K36メチル化の負の制御
- ヒストンH2Aモノユビキチン化
- 歯の石灰化の抑制
- 転写、DNAテンプレート
- 歯形成
- 軸極性の指定
- 心臓の発達
- ヒストンH3-K4メチル化の負の制御
- 転写の負の調節、DNAテンプレート
- RNAポリメラーゼIIによる転写の負の制御
- クロマチン組織
- 胚盤胞の孵化
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | NM_001123383 NM_001123384 NM_001123385 NM_001130139 NM_017745
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NM_020926 |
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NM_001168321 NM_029510 NM_175044 NM_175045 NM_175046 |
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| RefSeq (タンパク質) | |
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NP_001116855 NP_001116856 NP_001116857 NP_060215 |
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NP_001161793 NP_083786 NP_778209 NP_778210 NP_778211 |
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| 場所 (UCSC) | 染色体X: 40.05 – 40.18 Mb | 染色体X: 11.9 – 12.03 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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BCL-6コリプレッサーは、ヒトではBCOR遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
関数
この遺伝子によってコードされるタンパク質は、胚中心形成に必要であり、アポトーシスに影響を与える可能性のある POZ/ジンクフィンガー転写リプレッサーであるBCL6の相互作用コリプレッサーとして同定されました。このタンパク質は BCL6 の POZ ドメインと選択的に相互作用しますが、他の 8 つの POZ タンパク質とは相互作用しません。特定のクラス I および II ヒストン脱アセチル化酵素 (HDAC) がこのタンパク質と相互作用することが示されており、これは 2 つのクラスの HDAC の間に関連がある可能性を示唆しています。この遺伝子には、異なるアイソフォームをコードする少なくとも 4 つの選択的スプライシング転写バリアントが報告されています。[6]
臨床的意義
BCOR遺伝子の変異は、MCOPS2と呼ばれる症候群性小眼球症(小眼)の一種を引き起こします。この症候群には、小眼球症、先天性白内障、心臓欠陥、歯の欠陥、骨格異常が含まれます。この遺伝子の変異は、急性骨髄性白血病との関連も発見されています。[7]
インタラクション
BCORはMLLT3 [8]およびBCL6 [5]と相互作用することが示されている。
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000183337 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000040363 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ ab Huynh KD、Fischle W、 Verdin E、 Bardwell VJ (2000 年 7 月)。「BCL- 6抑制に関与する新規コリプレッサー BCoR」。遺伝子と発達。14 (14): 1810–23。doi : 10.1101 /gad.14.14.1810。PMC 316791。PMID 10898795。
- ^ ab 「Entrez Gene: BCOR BCL6コリプレッサー」。
- ^ グロスマン V、ティアッチ E、ホームズ AB、コールマン A、マルテッリ MP、カーン W、スパンホル=ロッセート A、クライン HU、デュガ M、シンデラ S、トリフォノフ V、シュニトガー S、ハーフェルラッハ C、バッサン R、ウェルズ VA、スピネッリ O 、チャン J、ロッシ R、バルドーニ S、デ・カロリス L、ゲッツェ K、サーブ H、ペチェニー R、クロイツァー KA、オルツィオ D、スペッキア G、ディ ライモンド F、ファッビアーノ F、スボルジア M、リソ A、ファリネッリ L、ランバルディ A、パスクアルッチ L、ラバダン R、ハーフェルラッハ T、ファリーニ B (2011 年 12 月)。 「全エクソーム配列決定により、正常な核型を持つ急性骨髄性白血病におけるBCORの体細胞変異が特定される。」血。118 (23): 6153–63. doi : 10.1182/blood-2011-07-365320 . PMID 22012066.
- ^ Srinivasan RS、de Erkenez AC、Hemenway CS (2003 年 5 月)。「混合系統白血病の融合パートナー AF9 は、BCL-6 コリプレッサーの特定のアイソフォームに結合する」。Oncogene . 22 ( 22): 3395–406. doi :10.1038/sj.onc.1206361. PMID 12776190. S2CID 34517481。
さらに読む
- Maruyama K, Sugano S (1994年1月). 「オリゴキャッピング:真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置き換える簡単な方法」. Gene . 138 (1–2): 171–4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997年10月). 「全長濃縮cDNAライブラリーおよび5'末端濃縮cDNAライブラリーの構築と特性評価」. Gene . 200 (1–2): 149–56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
- 永瀬 剛、菊野 亮、中山 正之、広沢 正、小原 修 (2000 年 8 月)。「未確認ヒト遺伝子のコード配列の予測。XVIII. 試験管内で大きなタンパク質をコードする脳由来の 100 個の新しい cDNA クローンの完全な配列」。DNA 研究。7 ( 4 ): 273–81。doi : 10.1093/dnares/7.4.271。PMID 10997877。
- Tang TT、Dowbenko D、Jackson A、Toney L、Lewin DA、Dent AL、Lasky LA (2002 年 4 月)。「フォークヘッド転写因子 AFX は、BCL-6 転写リプレッサーの誘導によってアポトーシスを活性化する」。The Journal of Biological Chemistry。277 ( 16): 14255–65。doi : 10.1074/ jbc.M110901200。PMID 11777915。
- Ng D、Hadley DW、Tifft CJ、Biesecker LG (2002 年 7 月)。「症候群性 X 連鎖劣性小眼球症-無眼球症の遺伝的異質性: レンツ小眼球症は単一の疾患か?」。アメリカ医学遺伝学ジャーナル。110 (4): 308–14。doi :10.1002/ ajmg.10484。PMID 12116202 。
- Tomsig JL、Snyder SL 、 Creutz CE (2003 年 3 月)。「コパイン ファミリー タンパク質を介したカルシウム シグナル伝達の ターゲットの特定。コイルドコイル コパイン結合モチーフの特性評価」。The Journal of Biological Chemistry。278 ( 12): 10048–54。doi : 10.1074/ jbc.M212632200。PMID 12522145。
- Srinivasan RS、de Erkenez AC、Hemenway CS (2003 年 5 月)。「混合系統白血病の融合パートナー AF9 は、BCL-6 コリプレッサーの特定のアイソフォームに結合する」。Oncogene . 22 (22): 3395–406. doi :10.1038/sj.onc.1206361. PMID 12776190. S2CID 34517481。
- Ng D、Thakker N、Corcoran CM、Donnai D、Perveen R、Schneider A、Hadley DW、Tifft C、Zhang L、Wilkie AO、van der Smagt JJ、Gorlin RJ、Burgess SM、Bardwell VJ、Black GC、Biesecker LG (2004 年 4 月)。「眼面心歯症候群とレンツ小眼球症症候群は、BCOR の異なるクラスの変異によって生じる」。Nature Genetics。36 ( 4 ) : 411–6。doi : 10.1038/ng1321。PMID 15004558 。
- Beausoleil SA、Jedrychowski M、Schwartz D、Elias JE、Villén J、Li J、Cohn MA、Cantley LC、Gygi SP (2004 年 8 月)。「HeLa 細胞核リン酸化タンパク質の大規模特性評価」。米国科学アカデミー紀要。101 (33): 12130–5。Bibcode : 2004PNAS..10112130B。doi : 10.1073 / pnas.0404720101。PMC 514446。PMID 15302935。
- Horn D、Chyrek M、Kleier S、Lüttgen S、Bolz H、Hinkel GK、Korenke GC、Riess A、Schell-Apacik C、Tinschert S、Wieczorek D、Gillessen-Kaesbach G、Kutsche K (2005 年 5 月)。「眼顔心歯症候群の患者 3 名で BCOR に新たな変異が認められたが、レンツ小眼球症候群では認められなかった」。European Journal of Human Genetics。13 (5): 563–9。doi : 10.1038/sj.ejhg.5201391。PMID 15770227。
- Lee JA、Suh DC、Kang JE、Kim MH、Park H、Lee MN、Kim JM、Jeon BN、Roh HE、Yu MY、Choi KY、Kim KY、Hur MW (2005 年 7 月)。「Sp1 の転写活性は、ジンクフィンガー DNA 結合ドメインとコリプレッサーによる阻害ドメイン間の分子相互作用によって制御され、この相互作用は MEK によって調整されます」。The Journal of Biological Chemistry . 280 (30): 28061–71. doi : 10.1074/jbc.M414134200 . PMID 15878880。
- Lim J、Hao T、Shaw C、Patel AJ、Szabó G、Rual JF、Fisk CJ、Li N、Smolyar A、Hill DE、Barabási AL、Vidal M、Zoghbi HY (2006 年 5 月)。「ヒトの遺伝性運動失調症およびプルキンエ細胞変性症のタンパク質間相互作用ネットワーク」。Cell . 125 ( 4): 801–14. doi : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . PMID 16713569. S2CID 13709685。
- Gearhart MD、Corcoran CM、Wamstad JA、Bardwell VJ (2006 年 9 月)。「ポリコーム グループと SCF ユビキチン リガーゼは、BCL6 ターゲットにリクルートされる新しい BCOR 複合体で発見されました」。分子細胞生物学。26 ( 18): 6880–9。doi :10.1128/MCB.00630-06。PMC 1592854。PMID 16943429 。
- Hilton EN、Manson FD、Urquhart JE、Johnston JJ、Slavotinek AM、Hedera P、Stattin EL、Nordgren A、Biesecker LG、Black GC (2007 年 7 月)。「BCL-6 コリプレッサー BCOR の左側胚発現は脊椎動物の左右差決定に必要」。ヒト分子遺伝学。16 (14): 1773–82。doi : 10.1093/hmg/ ddm125。PMID 17517692 。
外部リンク
- GeneReviews/NCBI/NIH/UW の無眼球症 / 小眼球症の概要に関するエントリ
- GeneReviews/NCBI/NIH/UW のレンツ小眼球症候群に関するエントリー
- UCSC ゲノム ブラウザのヒト BCOR ゲノムの位置と BCOR 遺伝子の詳細ページ。