BASP1

BASP1
識別子
エイリアス	BASP1、CAP-23、CAP23、NAP-22、NAP22、脳に豊富に存在する膜結合シグナルタンパク質1
外部ID	オミム：605940; MGI : 1917600;ホモロジーン: 38168;ジーンカード：BASP1; OMA :BASP1 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
クロ。	5番染色体（ヒト）
終わり	17,276,843 bp
遺伝子の位置（マウス）
クロ。	15番染色体（マウス）
終わり	25,413,850 bp
RNA発現パターン
	トップの表現
	眼窩前頭皮質; ; 中側頭回; ; 正面ポール; ; ブロードマン領域46; ; ブロードマン領域23; ; ブロードマン領域10; ; 上前頭回; ; 頭頂葉; ; 中心後回; ; 後頭葉;
	トップの表現
	嗅周囲皮質; ; CA3フィールド; ; 嗅内皮質; ; 網膜色素上皮; ; 扁桃体; ; 帯状回; ; 前頭前皮質; ; バレル皮質; ; 三叉神経節; ; 一次運動野;
	参照表現データの詳細
	参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー
分子機能	転写コリプレッサー活性; タンパク質ドメイン特異的結合; タンパク質結合;
細胞成分	細胞質; 小胞; 核の粒; 細胞投影; 膜; 成長円錐; 細胞膜; 細胞接合; COP9シグナロソーム; 細胞外エクソソーム; 細胞骨格; 核;
生物学的プロセス	黒質の発達; 横隔膜の発達; 後腎尿管芽の発達の正の調節; 心臓の成長の積極的な調節; 糸球体内臓上皮細胞の分化; 胸部および前腹部の測定; 転写の負の調節、DNAテンプレート; 生殖腺の発達; 後腎間葉の発達; 間葉系から上皮系への移行;
	出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
	10409
	70350
	ENSG00000176788
	ENSMUSG00000045763
	P80723
	Q91XV3
	NM_006317 ; NM_001271606
	NM_027395
	NP_001258535 ; NP_006308
	NP_081671
	ウィキデータ
人間の表示/編集	マウスの表示/編集

脳酸可溶性タンパク質1は、ヒトではBASP1遺伝子によってコードされるタンパク質である。^[5]^[6]^[7]

この遺伝子は、いくつかの一過性リン酸化部位とPESTモチーフを持つ膜結合タンパク質をコードしています。異なる種間でPEST配列を持つタンパク質が保存されていることは、その機能的重要性を裏付けています。PEST配列は、通常、回転率の高いタンパク質に存在します。このタンパク質の免疫学的特徴は種特異的です。このタンパク質はN末端ミリストイル化も受けます。^[7]

参考文献

^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000176788 – Ensembl、2017 年 5 月
^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000045763 – Ensembl、2017 年 5 月
^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ Mosevitsky MI、Capony JP、Skladchikova GYu、Novitskaya VA、Plekhanov AYu、Zakharov VV (1997 年 11 月)。「軸索末端に豊富に含まれるミリストイル化タンパク質の BASP1 ファミリー。一次構造解析と物理化学的特性」。Biochimie。79 ( 6 ) : 373–84。doi :10.1016/S0300-9084(97)80032-6。PMID 9310187 。
^ Park S, Kim YI, Kim B, Seong C, Oh Y, Baek K, Yoon J (1998年11月). 「NAP-22 (22 kDa 神経組織濃縮酸性タンパク質) ホモログをコードするウシおよびヒト cDNA の特性評価」Mol Cells . 8 (4): 471–7. doi : 10.1016/S1016-8478(23)13453-4 . PMID 9749536.
^ ab 「Entrez Gene: BASP1 脳に豊富、膜結合シグナルタンパク質 1」。

外部リンク

UCSC ゲノムブラウザのヒト BASP1 ゲノムの位置と BASP1 遺伝子の詳細ページ。

さらに読む

Olsen JV、Blagoev B、Gnad F、et al. (2006)。「シグナル伝達ネットワークにおける全体的、生体内、および部位特異的なリン酸化ダイナミクス」。Cell . 127 (3): 635–48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983. S2CID 7827573。
Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの現状、品質、拡大: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。
Carpenter B、Hill KJ、Charalambous M、他 (2004)。「BASP1 はウィルムス腫瘍抑制タンパク質 WT1 の転写コサプレッサーである」。Mol . Cell. Biol . 24 (2): 537–49. doi :10.1128/MCB.24.2.537-549.2004. PMC 343806. PMID 14701728 。
Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
Fitzgibbon J、Neat MJ、Foot N、他 (2000)。「脳酸可溶性タンパク質 1 (BASP1) のヒト染色体 5p15.1→p14 への割り当て、遺伝子量の変化の結果としてのヒト癌細胞株における差次的発現」。Cytogenet。Cell Genet。89 ( 3–4 ) : 147–9。doi :10.1159/000015597。PMID 10965107。S2CID 25329544 。

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000176788 – Ensembl、2017 年 5 月

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000045763 – Ensembl、2017 年 5 月

[3] 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[4] 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[pmid9310187-5] Mosevitsky MI、Capony JP、Skladchikova GYu、Novitskaya VA、Plekhanov AYu、Zakharov VV (1997 年 11 月)。「軸索末端に豊富に含まれるミリストイル化タンパク質の BASP1 ファミリー。一次構造解析と物理化学的特性」。Biochimie。79 ( 6 ) : 373–84。doi :10.1016/S0300-9084(97)80032-6。PMID 9310187 。

[pmid9749536-6] Park S, Kim YI, Kim B, Seong C, Oh Y, Baek K, Yoon J (1998年11月). 「NAP-22 (22 kDa 神経組織濃縮酸性タンパク質) ホモログをコードするウシおよびヒト cDNA の特性評価」Mol Cells . 8 (4): 471–7. doi : 10.1016/S1016-8478(23)13453-4 . PMID 9749536.

[entrez-7] 「Entrez Gene: BASP1 脳に豊富、膜結合シグナルタンパク質 1」。