ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
DNAJC6 識別子 エイリアス DNAJC6 、DJC6、PARK19、Auxilin、DnaJ熱ショックタンパク質ファミリー(Hsp40)メンバーC6 外部ID オミム :608375; MGI : 1919935; ホモロジーン : 8865; ジーンカード :DNAJC6; OMA :DNAJC6 - オルソログ 遺伝子の位置( マウス ) クロ。 染色体4(マウス) [2] バンド 4|4 C6 始める 101,353,828 bp [2] 終わり 101,499,996 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス (相同遺伝子) トップの表現 内皮細胞 ブロードマン領域23 緻密部 網状部 眼窩前頭皮質 中側頭回 視床の外側核群 ポンス 下オリーブ核 ブロードマン領域46
トップの表現 内側背核 視床下部背内側核 腹側被蓋野 橋核 内側膝状体 視床下部室傍核 外側膝状体 梨状皮質 一次運動野 中脳の中心灰白質
参照表現データの詳細
バイオGPS
遺伝子オントロジー 分子機能
タンパク質チロシンホスファターゼ活性
SH3ドメイン結合
リン酸化タンパク質ホスファターゼ活性
加水分解酵素活性
クラスリン結合
細胞成分
細胞質
シナプス
小胞
シナプス後密度
細胞質
細胞内膜で囲まれた細胞小器官
シナプス前
生物学的プロセス
ペプチジルチロシン脱リン酸化
クラスリン依存性エンドサイトーシスの調節
タンパク質の脱リン酸化
クラスリンコートの分解
受容体を介したエンドサイトーシス
膜組織
シナプス小胞の脱殻
クラスリン依存性エンドサイトーシス
出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_001256864 NM_001256865 NM_014787
NM_001164583 NM_001164584 NM_001164585 NM_198412 NM_001355179 NM_001355180
RefSeq (タンパク質) NP_001243793 NP_001243794 NP_055602
NP_001158055 NP_001158056 NP_001158057 NP_940804 NP_001342108 NP_001342109
場所 (UCSC) 1 章: 65.25 – 65.42 Mb 4 番: 101.35 – 101.5 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
推定チロシンタンパク質ホスファターゼであるオーキシリンは 、ヒトでは DNAJC6 遺伝子によってコードされる 酵素 である 。 [5] [6] [7]
関数
DNAJC6は進化的に保存されたDNAJ/HSP40ファミリーのタンパク質に属し、ATPase活性を刺激することで分子シャペロン活性を制御します。DNAJタンパク質は、最大3つの異なるドメインを持つことがあります。通常N末端にある保存された70アミノ酸のJドメイン、グリシン/フェニルアラニン(G / F)に富む領域、およびジンクフィンガードメインに似た4つのモチーフを含むシステインに富むドメインです(Ohtsuka and Hata、2000)。 [7]
構造
ポリペプチドのN末端付近に位置するオーキシリンのタンパク質 チロシンホスファターゼ ドメイン と C2ドメインペアは、スーパードメインを構成し、2つ以上の名目上は無関係なドメインが直列に配置され、単一の遺伝単位を形成します。 [8] ホスファターゼドメインは脂質ホスファターゼのオーキシリンサブファミリーに属し、触媒的に不活性であると予測されています。 [9] [10]
参考文献
^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000116675 – Ensembl 、2017 年 5 月
^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000028528 – Ensembl 、2017 年 5 月
^ 「Human PubMed Reference:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。
^ 「マウス PubMed リファレンス:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。
^ 関 暢、大平 正之、永瀬 孝、石川 健、宮島 暢、中島 大輔、野村 暢、小原 修 (1997 年 10 月)。「ヒト脳からサイズ分画した cDNA ライブラリーにおける cDNA クローンの特性評価」。DNA 研究 。4 ( 5 ) : 345–9。doi : 10.1093/ dnares /4.5.345。PMID 9455484 。
^ 大塚 K、秦 M (2000 年 4 月). 「哺乳類の HSP40/DNAJ ホモログ: 新規 cDNA のクローニングとその分類と命名法の提案」。 細胞ストレスとシャペロン 。 5 (2): 98–112 . doi :10.1379/1466-1268(2000)005<0098:mhdhco>2.0.co;2 (2024 年 11 月 2 日に非アクティブ)。 PMC 312896 。 PMID 11147971。 {{cite journal}}: CS1 メンテナンス: DOI は 2024 年 11 月時点で非アクティブです ( リンク )
^ ab "Entrez Gene: DNAJC6 DnaJ (Hsp40) ホモログ、サブファミリー C、メンバー 6"。
^ Haynie DT 、Xue B (2015 年5月)。「タンパク質 構造 階層におけるスーパードメイン : PTP - C2の場合」。 タンパク質科学 。24 (5): 874–82。doi :10.1002/pro.2664。PMC 4420535。PMID 25694109 。
^ 「ホスファターゼサブファミリーオーキシリン - PhosphataseWiki」. phosphatome.net .
^ Chen MJ、 Dixon JE、Manning G (2017年4 月)。「 タンパク質 ホスファターゼのゲノミクスと進化」。Science Signaling。10 ( 474): eaag1796。doi : 10.1126 /scisignal.aag1796。PMID 28400531。S2CID 41041971。
外部リンク
さらに読む
Suzuki Y, Yamashita R, Shirota M, Sakakibara Y, Chiba J, Mizushima-Sugano J, Nakai K, Sugano S (2004 年 9 月). 「ヒト遺伝子とマウス遺伝子の配列比較によりプロモーター領域に相同ブロック構造が発見される」. Genome Research . 14 (9): 1711–8 . doi :10.1101/gr.2435604. PMC 515316. PMID 15342556 .
Scheele U、Alves J、Frank R、Duwel M、Kalthoff C、Ungewickell E (2003 年 7 月)。「オーキシリンの不規則ドメイン内のクラスリンおよび AP-2 結合決定因子の分子的および機能的特性」。The Journal of Biological Chemistry。278 ( 28): 25357– 68。doi : 10.1074/ jbc.M303738200。PMID 12732633 。
Scheele U、 Kalthoff C、Ungewickell E (2001 年 9 月)。「オーキシリン 1 とクラスリンおよび AP-2 アダプター複合体との多重相互作用」。The Journal of Biological Chemistry。276 ( 39 ): 36131–8。doi : 10.1074/ jbc.M106511200。PMID 11470803 。
石川 健、永瀬 剛、中島 大介、関 直、大平 正治、宮島 直、田中 明、小谷 秀、野村 直、小原 修 (1997 年 10 月)。「未確認ヒト遺伝子のコード配列の予測。VIII. 試験管内で巨大タンパク質をコードする脳由来の 78 個の新しい cDNA クローン」 。DNA 研究 。4 ( 5 ) : 307–13。doi : 10.1093/dnares/4.5.307。PMID 9455477 。