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サブゲノムmRNAは、本質的には、元の転写されたテンプレート鎖のより小さなセクションです。
3'から5'のDNAまたはRNA
転写中、元のテンプレート鎖は通常、3'末端から5'末端に向かって最初から最後まで読み取られます。サブゲノム mRNA は、転写がテンプレート鎖の 3' 末端 (または新しく合成されるテンプレートの 5' 末端) で開始され、テンプレート鎖の 5' 末端に向かってコピーを開始してから、テンプレートの末端に「ジャンプ」してテンプレートの 5' 末端の最後のヌクレオチドをコピーし (新しく作成された鎖の 3' テールを終了) ると作成されます。
その結果、翻訳された鎖は、元のテンプレートと程度の差はあるものの5'末端が類似し（転写がテンプレートのどの部分を飛び越えたかによって異なる）、3'末端もテンプレートと類似することになる。[1]
5'から3'（プラスセンス）ウイルスRNA
目的のウイルスタンパク質に直接翻訳される可能性のあるプラスセンス (5' から 3') ウイルス RNA は、3' から 5' で説明したのと同様のプロセスを経ます。ウイルス RNA の一部は、翻訳中にスキップされる場合があります。
結果
その結果、同じ mRNA 鎖から、類似した 5' 末端 (程度の差はあるものの) と同じ 3' 末端を持つさまざまなタンパク質を作成できます。または、プラス鎖ウイルス RNA を使用して異なるタンパク質を作成することもできます。
新しく作成された鎖の5'セクションはテンプレート鎖の5'セクションと一致し、テンプレート鎖のこのセクションは「ネストされたセット」と呼ばれます。[2]
3フィート5フィート GCCGCCCGTATCGATCGTAGCGCACGTTATATATACGTTATTTCTGCCGCGGAAAAAAAAA - オリジナルテンプレートストランド 5フィート3フィート GCCGCCCGTATCGATCGTAGCGCACGTTATATATAC--------------AAAAAAAAA | GCCGCCCCGTATCGATCGTAGCGCAC--------------------------AAAAAAAAA | = サブゲノム mRNA。 GCCGCCCGTAT----------------------------------------AAAAAAAAA | GCCGCCCCGTAT = ネストされたセット - ジャンプを示します。
例
この複雑な転写方法は、一般的にウイルス、特に一本鎖プラス鎖RNAウイルスやボルチモア分類システムによるクラスIVウイルス（例えばニドウイルス目）に限定されています。
これは主に、より多くの遺伝情報をより短い量の遺伝物質に圧縮するために使用されます。 [3]
文学
- ^ Wu B、White KA（2007年12月） 。「ポリメラーゼによるRNAウイルスの複製と転写の分離：機能的および進化的洞察」。EMBOジャーナル。26（24）：5120–30。doi ：10.1038 / sj.emboj.7601931。PMC 2140117。PMID 18034156 。
- ^ Le, TM; Wong, HH; Tay, FP; Fang, S; Keng, CT; Tan, YJ; Liu, DX (2007年8月). 「重症急性呼吸器症候群コロナウイルスのサブゲノムmRNA8によってコードされるタンパク質の発現、翻訳後修飾および生化学的特徴付け」. FEBS J. 274 ( 16): 4211–22. doi : 10.1111 /j.1742-4658.2007.05947.x . PMC 7164070. PMID 17645546.
- ^ Xu W、White KA（2008年2月）。「黄色 ブドウ球菌ウイルスにおけるサブゲノムmRNA転写：転写のダウンレギュレーションと調節RNAエレメントの進化」。Virology.371 （2 ）：430 ～438。doi ：10.1016 /j.virol.2007.09.035。PMID 17988704。