アルカリハロバチルス

アルカリハロバチルス
科学的分類
ドメイン：	細菌
門:	バシロタ
クラス：	バチルス
注文：	ナデシコ目
家族：	バチルス科
属:	アルカリハロバチルス パテルとグプタ 2020
種[1]
テキストを参照

アルカリハロバチルス（Alkalihalobacillus）は、バチルス目バチルス科に属するグラム陽性またはグラム可変性の桿菌の属である。 ^{[2] [3]}この属のタイプ種はアルカリハロバチルス・アルカロフィルスである。^[4]

この属は、かつてBacillus属に属していた種から構成され、この属は、これまでこの系統群に種を割り当てるために使用されていた曖昧な基準^[5] (酸素存在下で胞子を形成する能力など) ^{[6]により、広範な多}系統性と系統発生的異質性を示すことが認識されている。Bacillus種間の進化的関係を明らかにするために、比較系統解析を用いた複数の研究が発表されており、その結果、 Alkalihalobacillus、Brevibacillus、Solibacillus、Alicyclobacillus、Virgibacillusなどの多数の新しい属が確立された。^{[2] [7] [8] [9] [10]} Bacillus属は現在、 Bacillus subtilisおよびBacillus cereusに近縁の種に限定されている。^{[2] [11]}

アルカリハロバチルスという名前は、接頭辞「alkali-」（アラビア語の冠詞および名詞al galiyから、塩草の灰を意味する）、「halo-」（ギリシャ語の名詞hals/halosから、塩を意味する）、「-bacillus」（ラテン語の名詞bacillusから、小さな杖または棒を意味する）という接尾辞と、細菌属であるBacillusから構成されている。これらを合わせると、この名前は塩分またはアルカリ性の条件、または塩分とアルカリ性の条件で生息するバチルスを指す。^[2]

この属には、2021年5月現在、合計44種が含まれており、そのうち39種が有効に公表され、命名が確立されています。^{[4]この属は、}バチルス属内の分類学的関係を調査する研究において、単系統群であり、他のバチルス属種とは系統学的に無関係であると特定されました。^{[2]この分岐パターンは}、ゲノム分類データベース（GTDB）でも観察されています。^[12]

さらに2つのバチルス属（バチルス・アルカリフィラムとバチルス・アルカリソリ）が、系統樹上でアルカリハロバチルス属の他の種とグループ化され、保存されたシグネチャーインデル（CSI）の形で同じ分子マーカーを共有していることが判明しています。^[11]しかし、培養株の情報が不足しているため、これらの移動は正式に提案されていません。追加のゲノムと新しい種が発見され、割り当てられるにつれて、この属のさらなる改訂が必要です。

この属のほとんどのメンバーは好気性または通性嫌気性であり、高塩湖、沿岸地域、土壌などのさまざまな場所で見つかります。 Alkalihalobacillus okhensis [ ^13]を除くすべての種は胞子を形成できます。運動性はさまざまで、一部の種は周毛鞭毛を持っています。この属の種の大部分は好アルカリ性および好塩性/耐性であるため、アルカリ性条件で成長することができ、最適な成長速度は1〜5％のNaClでpH範囲9〜10です。^[2]一部の種は絶対的にアルカリ性であり、生存するために非常にアルカリ性の条件を必要とします。広い範囲の温度（4〜45℃）で成長できますが、最適な成長は25〜37℃の範囲で起こります。いくつかの種は、洗濯用洗剤の製造に使用されるセルラーゼやプロテアーゼ、パルプ紙部門で使用されるキシラナーゼ^{[さらなる説明が必要]}、デンプン処理に使用されるシクロデキストリングルカノトランスフェラーゼなどの酵素を生産することができます。^[2]さらに、A. clausiiはジアゾ栄養性であり、大気中の窒素をアンモニアに変換することができます^[14]また、プロバイオティクスの製造のための抗菌化合物を生産することもできます。^{[15] [検証に失敗]}

ゲノム解析により、この属には以下のタンパク質の10個のCSIが同定されています：RNaseアダプターRapZ、鞭毛基底小体Mリングタンパク質FliF、7-カルボキシ-7-デアザグアニン合成酵素QueE、ペプチド鎖放出因子3、I型グルタミン酸アンモニアリガーゼ、tRNAスレオニルカルバモイルアデノシン脱水酵素、転写修復共役因子、tRNAウリジン-5-カルボキシメチルアミノメチル（34）合成酵素MnmG、50Sリボソームタンパク質L11メチルトランスフェラーゼ、およびホモセリンキナーゼ。^{[2]これらのCSIは}アルカリハロバチルスに特異的であり、この属を他のバチルス科の属および細菌と分子的に区別する新しい方法を提供します。