マッピング
混合マッピングは、異なる祖先集団間で見られる疾患やその他の表現型の違いに寄与する遺伝子座を見つけるために、混合祖先集団(混合集団)を使用する遺伝子マッピング法です。この方法は、以前は遺伝的に隔離されていた2つの集団からの最近の混合がある集団に最もよく適用されます。この方法は、遺伝子座付近の祖先の程度と、関心のある表現型または疾患との相関関係を調べます。ゲノム全体にわたって、祖先集団間で頻度が異なる遺伝子マーカーが必要です。[ 9 ]
混合マッピングは、疾患発生率や表現型の違いは、集団間の疾患原因または表現型原因となる遺伝子変異の頻度の違いに起因するという仮定に基づいています。混合集団では、これらの原因となる変異は、いずれかの祖先集団から受け継いだ染色体セグメント上でより頻繁に発生します。最初の混合スキャンは2005年に発表され、それ以来、さまざまな疾患や形質の違いに対する遺伝的寄与因子がマッピングされてきました。[ 10 ]
参考文献
- ↑ Korunes, Katharine L.; Goldberg, Amy (2021-03-11). "Human genetic admixture" . PLOS Genetics . 17 (3) e1009374. Public Library of Science (PLoS). doi : 10.1371/journal.pgen.1009374 . ISSN 1553-7404 . PMC 7951803 . PMID 33705374 .
- ↑ Rius, M.; Darling, JA (2014). "植民地化集団の成功にとって種内遺伝的混合はどれほど重要か?". Trends in Ecology & Evolution . 29 (4): 233−242. Bibcode : 2014TEcoE..29..233R . doi : 10.1016/j.tree.2014.02.003 . PMID 24636862 .
- ↑ Yang, Melinda A.; Fu, Qiaomei (2018年3月). 「古代ゲノムを用いた現代人類の先史時代に関する洞察」Trends in Genetics . 34 (3): 184–196 6y. doi : 10.1016/j.tig.2017.11.008 . PMID 29395378 .
- ↑ Hedrick, PW (2013). "動物における適応的遺伝子浸透:適応的変異の源としての新突然変異および既存変異との例との比較". Molecular Ecology . 22 : 4606– 4618. doi : 10.1111/mec.12415 .
- ↑ Lv X, Cheng J, Meng Y, Chang Y, Xia L, Wen Z, Ge D, Liu S, Yang Q (2018). "中国南部におけるキイロショウジョウバエの隔離分布と種内多様性の違い" . BMC Evolutionary Biology . 18 (1): 50. Bibcode : 2018BMCEE..18...50L . doi : 10.1186/s12862-018-1168-3 . PMC 5894153 . PMID 29636000 .
- ↑ Jaisuk, C.; Senanan, W. (2018). "タイ北部ナン川上流域における熱帯渓流魚、ストーンラッピングミノー(Garra cambodgiensis )の集団遺伝的変異に対する景観特性の影響" . PeerJ . 6 e4487. doi : 10.7717/peerj.4487 . PMC 5845392. PMID 29568710 .
- ↑ Kolbe JJ、 Larson A、Losos JB、de Queiroz K (2008)。「混合がトカゲ種の生物侵入における遺伝的多様性と集団分化を決定する」。Biology Letters。4 ( 4 ) : 434−437。doi : 10.1098 / rsbl.2008.0205。PMC 2610154。PMID 18492644。
- ↑ホルニコバ、M.;ラニアー、HC。マルコバ、S.マサチューセッツ州エスカランテ。サール、JB; Kotlík、P. (2024)。 「遺伝的混合がバンクハタネズミの気候適応を促進する」。コミュニケーション生物学。7 : 1–9 .土井: 10.1038/s42003-024-06425-9。
- ↑ Shriver, MD; et al. (2003 年 4 月). "皮膚の色素沈着、生物地理学的祖先、および混血マッピング". Human Genetics . 112 (4): 387–99 . doi : 10.1007/s00439-002-0896-y . PMID 12579416. S2CID 7877572 .
- ↑ Winkler, CA; Nelson, GW; Smith, MW (2010). "混合マッピングが成熟期を迎える" . Annu Rev Genom Hum Genet . 11 : 65– 89. doi : 10.1146/annurev-genom-082509-141523 . PMC 7454031 . PMID 20594047 .
さらに読む
- Balding (2007). 「遺伝学用語集」 .統計遺伝学ハンドブック、第1巻. John Wiley & Sons. ISBN 978-0-470-05830-5。
- ファウルクス(2009年4月28日)「用語集」『Rを用いた応用統計遺伝学:集団ベースの関連研究 』Springer、 250ページ、ISBN 978-0-387-89553-6。
- ストーン他 (2007)。「用語集」。遺伝子、文化、そして人類の進化:総合的考察。ワイリー。ISBN 978-1-4051-5089-7。
- Kolbe JJ、Glor RE、Schettino LR、Lara AC、Losos AL、Losos JB (2004)キューバ産トカゲの生物侵入中に遺伝的変異が増加する。Nature 431: 171-181
- ルノルマン T (2002).遺伝子流動と自然選択の限界. 生態学と進化の動向. 17:183-189
- Shriner 2013、「混合マッピングの概要」