ARID4B

ARID4B
識別子
エイリアス	ARID4B、BCAA、BRCAA1、RBBP1L1、RBP1L1、SAP180、ATリッチ相互作用ドメイン4B
外部ID	オミム：609696; MGI : 2137512;ホモロジーン: 12847;ジーンカード：ARID4B; OMA :ARID4B - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
クロ。	染色体1（ヒト）
終わり	235,328,219 bp
遺伝子の位置（マウス）
クロ。	13番染色体（マウス）
終わり	14,374,188 bp
RNA発現パターン
	トップの表現
	脈絡叢上皮; ; 精子; ; 壁側胸膜; ; 臓側胸膜; ; 鼻咽頭上皮; ; 脛骨; ; アキレス腱; ; 胚上皮; ; 腓骨神経; ; 頬粘膜細胞;
	トップの表現
	胎児の尾; ; 上行大動脈; ; 大動脈弁; ; 髄質集合管; ; 視索上核; ; 性器結節; ; 積雲細胞; ; 三叉神経節; ; 神経節隆起; ; 血;
	参照表現データの詳細
	参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー
分子機能	DNA結合; タンパク質結合; ヒストン脱アセチル化酵素活性; 分子機能; DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的;
細胞成分	細胞質; 核質; 核; 細胞成分;
生物学的プロセス	遺伝子刷り込みによる遺伝子発現の調節; 転写の調節、DNAテンプレート; セルトリ細胞バリアの確立; RNAポリメラーゼIIによる転写の調節; ヒストンH4-K20トリメチル化; 転写、DNAテンプレート; ヒストンH3-K9トリメチル化; 精子形成; RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御; ヒストン脱アセチル化; 生物学的プロセス; クロマチン組織;
	出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
	51742
	94246
	ENSG00000054267
	ENSMUSG00000039219
	Q4LE39
	A2CG63
	NM_001206794 ; NM_016374 ; NM_031371
	NM_194262 ; NM_198122
	NP_001193723 ; NP_057458 ; NP_112739
	NP_919238 ; NP_937755
	ウィキデータ
人間の表示/編集	マウスの表示/編集

ATリッチ相互作用ドメイン含有タンパク質4Bは、ヒトではARID4B遺伝子によってコードされるタンパク質である。^[5]^[6]

関数

この遺伝子は、網膜芽細胞腫結合タンパク質1と配列類似性を持つタンパク質をコードしている。コードされているタンパク質は、ヒストン脱アセチル化酵素依存性SIN3A転写コリプレッサー複合体のサブユニットであり、増殖、分化、アポトーシス、腫瘍形成、細胞運命決定など、さまざまな細胞プロセスで機能する。遺伝子産物は、乳がん患者から分離されたIgG 抗体によって認識され、広範囲のヒト悪性腫瘍に関連する分子マーカーであると思われる。異なるアイソフォームをコードする代替転写スプライスバリアントが特徴付けられている。^[6]

参考文献

^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000054267 – Ensembl、2017 年 5 月
^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000039219 – Ensembl、2017 年 5 月
^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ Cao J、Gao T、Stanbridge EJ、Irie R (2001 年 8 月)。「RBP1L1 は、ヒト癌腫および正常精巣で豊富に発現する抗原エピトープをコードする網膜芽細胞腫結合タンパク質関連遺伝子です」。J Natl Cancer Inst . 93 (15): 1159– 65. doi : 10.1093/jnci/93.15.1159 . PMID 11481388。
^ ab "Entrez Gene: ARID4B AT リッチインタラクティブドメイン 4B (RBP1 類似)"。

外部リンク

UCSC ゲノムブラウザのヒト ARID4B ゲノムの位置と ARID4B 遺伝子の詳細ページ。

さらに読む

Andersen JS、Lyon CE、Fox AH、Leung AK、Lam YW、Steen H、Mann M、Lamond AI (2002)。「ヒト核小体の直接プロテオーム解析」。Curr . Biol . 12 (1): 1– 11. doi : 10.1016/S0960-9822(01)00650-9 . PMID 11790298. S2CID 14132033.
Bommel H, Xie G, Rossoll W, Wiese S, Jablonka S, Boehm T, Sendtner M (2003). 「マウス変異型進行性運動ニューロン症におけるチューブリン特異的シャペロン E (Tbce) 遺伝子のミスセンス変異、ヒト運動ニューロン疾患のモデル」J. Cell Biol . 159 (4): 563–9 . doi :10.1083/jcb.200208001. PMC 2173089. PMID 12446740 .
Fleischer TC、Yun UJ、Ayer DE (2003)。「mSin3Aコリプレッサー複合体の3つの新しい成分の同定と特徴付け」。Mol . Cell. Biol . 23 (10): 3456– 67. doi :10.1128/MCB.23.10.3456-3467.2003. PMC 164750. PMID 12724404 。
Cui D, Jin G, Gao T, Sun T, Tian F, Estrada GG, Gao H, Sarai A (2004). 「BRCAA1 の特性評価と新規抗原エピトープの同定」. Cancer Epidemiol. Biomarkers Prev . 13 (7): 1136– 45. doi : 10.1158/1055-9965.1136.13.7 . PMID 15247124. S2CID 28408982.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (2004). 「HeLa 細胞核リン酸化タンパク質の大規模特性評価」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 101 (33): 12130– 5. Bibcode :2004PNAS..10112130B. doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC 514446 . PMID 15302935.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (2006). 「シグナル伝達ネットワークにおける全体的、生体内、および部位特異的なリン酸化ダイナミクス」. Cell . 127 (3): 635–48 . doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983. S2CID 7827573.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000054267 – Ensembl、2017 年 5 月

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000039219 – Ensembl、2017 年 5 月

[3] 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[4] 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[pmid11481388-5] Cao J、Gao T、Stanbridge EJ、Irie R (2001 年 8 月)。「RBP1L1 は、ヒト癌腫および正常精巣で豊富に発現する抗原エピトープをコードする網膜芽細胞腫結合タンパク質関連遺伝子です」。J Natl Cancer Inst . 93 (15): 1159– 65. doi : 10.1093/jnci/93.15.1159 . PMID 11481388。

[entrez-6] "Entrez Gene: ARID4B AT リッチインタラクティブドメイン 4B (RBP1 類似)"。