| AP2S1 |
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| 利用可能な構造物 |
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| PDB | オルソログ検索: PDBe RCSB |
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| PDB IDコード一覧 |
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2JKR、2JKT、2VGL、2XA7、4UQI、4NEE |
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| 識別子 |
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| 別名 | AP2S1、AP17、CLAPS2、FBH3、FBHOk、HHC3、アダプター関連タンパク質複合体2シグマ1サブユニット、アダプター関連タンパク質複合体2サブユニットシグマ1 |
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| 外部ID | オミム: 602242 ; MGI : 2141861 ;ホモロジーン: 3001 ;ジーンカード: AP2S1 ; OMA : AP2S1 - オルソログ |
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| RNA発現パターン |
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| Bgee | | 人間 | マウス(相同体) |
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| トップは | - 子宮内膜の間質細胞
- 右副腎
- 右前頭葉
- 横行結腸の粘膜
- 人間のペニス
- 右副腎皮質
- 左副腎
- 左副腎皮質
- 前頭前皮質
- 帯状回
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| | トップは | - 海馬歯状回顆粒細胞
- 一次視覚野
- 上前頭回
- 顆粒球
- 顔面運動核
- 神経管
- 心室帯
- 卵黄嚢
- リップ
- 骨髄の間質
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| | より多くの参照発現データ |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 | | | 細胞成分 | - エンドサイトーシス小胞膜
- 細胞質
- クラスリン被覆エンドサイトーシス小胞膜
- 膜
- 細胞膜
- エンドリソソーム膜
- 膜コーティング
- クラスリン被覆ピット
- AP-2アダプター複合体
- クラスリン被覆エンドサイトーシス小胞
- 細胞内膜で囲まれたオルガネラ
| | 生物学的プロセス | - エンドサイトーシスの調節
- エンドサイトーシス
- 抗原処理およびMHCクラスIIを介した外来ペプチド抗原の提示
- エフリン受容体シグナル伝達経路
- ウイルスによる宿主防御の緩和
- クラスリン依存性エンドサイトーシス
- クラスリンコートアセンブリ
- タンパク質輸送
- 細胞内タンパク質輸送
- 小胞を介した輸送
- 微小管に基づく運動
- Wntシグナル伝達経路、平面細胞極性経路
- 膜構造
- 低密度リポタンパク質粒子受容体の異化プロセス
- 低密度リポタンパク質粒子クリアランス
- 輸送
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| アントレ | | |
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| アンサンブル | | |
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| UniProt | | |
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| RefSeq(mRNA) | |
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NM_001301076 NM_001301078 NM_001301081 NM_004069 NM_021575 |
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| RefSeq(タンパク質) | |
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NP_001288005 NP_001288007 NP_001288010 NP_004060 NP_067586 |
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| 所在地(UCSC) | Chr 19: 46.84 – 46.85 MB | Chr 7: 16.47 – 16.48 MB |
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| PubMed検索 | [ 3 ] | [ 4 ] |
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| ウィキデータ |
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AP-2複合体サブユニットシグマは、ヒトではAP2S1遺伝子によってコードされるタンパク質である。[ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]
2つの主要なクラスリン関連アダプター複合体のうちの1つであるAP-2は、細胞膜に結合したヘテロ四量体である。この複合体は、2つの大きな鎖、中程度の鎖、および小さな鎖から構成されている。この遺伝子は、この複合体の小さな鎖をコードしている。この遺伝子では選択的スプライシングが観察されており、2つの既知の転写産物が生じる。[ 7 ]
参考文献
- 1 2 3 GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000042753 – Ensembl、2017年5月
- 1 2 3 GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000008036 – Ensembl、2017年5月
- ↑ 「ヒトPubMed参照:」。米国国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ↑ 「マウス PubMed 参照:」。米国国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ↑ Winterpacht A、Endele S、Enklaar T、Fuhry M、Zabel B (1997年3月)。「ヒトCLAPS2は、クラスリン関連タンパク質複合体の小鎖であるAP17をコードしている:cDNAクローニングと19q13.2→q13.3への染色体割り当て」。Cytogenet Cell Genet . 75 ( 2–3 ): 132–5 . doi : 10.1159/000134463 . PMID 9040778 .
- ↑ Holzmann K、Poltl A、Sauermann G (1998年11月)。「クラトリンアダプタータンパク質AP17の代替タンパク質をコードするヒトCLAPS2の新規スプライス転写産物」。Gene。220 ( 1–2 ) : 39–44。doi : 10.1016 / S0378-1119 ( 98)00406-5。PMID 9767099。
- 1 2 "Entrez Gene: AP2S1アダプター関連タンパク質複合体2、シグマ1サブユニット"。
さらに読む
- Pearse BM、Smith CJ、Owen DJ (2000)「エンドサイトーシスにおけるクラトリンコートの構築」Curr. Opin. Struct. Biol . 10 (2): 220–8 . doi : 10.1016/S0959-440X(00)00071-3 . PMID 10753805 .
- Ewing RM、Chu P、Elisma F、et al. (2007) 「質量分析法によるヒトタンパク質間相互作用の大規模マッピング」 . Mol. Syst. Biol . 3 (1) 89. doi : 10.1038/msb4100134 . PMC 1847948 . PMID 17353931 .
- Byland R、Vance PJ、Hoxie JA、Marsh M (2007) 「保存されたジロイシンモチーフがHIV-1エンベロープタンパク質のクラスリンおよびAP-2依存性エンドサイトーシスを媒介する」 . Mol. Biol. Cell . 18 (2): 414–25 . doi : 10.1091/ mbc.E06-06-0535 . PMC 1783771. PMID 17108326 .
- Rual JF、Venkatesan K、Hao Tら(2005)。「ヒトタンパク質間相互作用 ネットワークのプロテオーム規模のマップに向けて」。Nature。437 ( 7062 ):1173–8。Bibcode:2005Natur.437.1173R。doi:10.1038 / nature04209。PMID 16189514。S2CID 4427026。
- Batonick M、Favre M、Boge M、et al . (2006) 「HIV-1 Gagとクラスリン関連アダプターAP-2の相互作用」Virology.342 ( 2 ) : 190–200.doi : 10.1016 / j.virol.2005.08.001.PMID 16139856 .
- Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、et al. (2004) 「NIH 全長 cDNA プロジェクト: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC) の現状、品質、および拡張」Genome Res . 14 ( 10B): 2121–7 . doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928. PMID 15489334 .
- Vendeville A、Rayne F、Bonhoure A、et al. (2005) 「HIV-1 Tatは酸性エンドソームから転座して生物学的応答を引き起こす前に、被覆ピットを使用してT細胞に侵入する」 . Mol . Biol. Cell . 15 (5): 2347–60 . doi : 10.1091/mbc.E03-12-0921 . PMC 404028. PMID 15020715 .
- Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、et al. (2003) 「15,000を超える全長ヒトおよびマウスcDNA配列の生成と初期解析」 . Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
- Collins BM、McCoy AJ、Kent HM、et al. (2002) 「エンドサイトーシスAP2複合体の分子構造と機能モデル」 Cell . 109 ( 4): 523–35 . doi : 10.1016/S0092-8674( 02 )00735-3 . PMID 12086608. S2CID 483953 .
- Berlioz-Torrent C、Shacklett BL、Erdtmann L、et al. (1999) 「ヒトおよびサルレトロウイルス膜貫通タンパク質の細胞質ドメインとクラトリンアダプター複合体の構成要素との相互作用は、エンベロープ糖タンパク質の細胞内および細胞表面発現を調節する」 . J. Virol . 73 (2): 1350–61 . doi : 10.1128/JVI.73.2.1350-1361.1999 . PMC 103959. PMID 9882340 .
- Kirchhausen T、Nathanson KL、Matsui W、et al. (1989) 「クラスリン関連タンパク質複合体AP-2の大きな(100~115 kDa)鎖の2つのドメインへの構造的および機能的分割」 . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 86 ( 8): 2612–6 . Bibcode : 1989PNAS...86.2612K . doi : 10.1073/pnas.86.8.2612 . PMC 286967. PMID 2495531 .
- Kirchhausen T、Davis AC、Frucht S、et al. (1991) 「AP17およびAP19、クラトリン関連タンパク質複合体の哺乳類小鎖は、酵母における推定相同体であるYap17pと相同性を示す」。J . Biol. Chem . 266 (17): 11153–7 . doi : 10.1016/S0021-9258(18)99141-6 . PMID 2040623 .