ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
AMPD2 利用可能な構造 PDB オルソログ検索: PDBe RCSB
識別子 エイリアス AMPD2 、PCH9、SPG63、アデノシン一リン酸デアミナーゼ2 外部ID オミム : 102771; MGI : 88016; ホモロジーン : 2979; ジーンカード :AMPD2; OMA :AMPD2 - オルソログ 遺伝子の位置( マウス ) クロ。 染色体3(マウス) [2] バンド 3 F2.3|3 46.83 cM 始める 107,981,378 bp [2] 終わり 107,993,967 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス (相同遺伝子) トップの表現 下垂体前葉 顆粒球 側坐核 膵管細胞 子宮内膜間質細胞 右前頭葉 単球 被殻 尾状核 血
トップの表現 窩 弓状核 腹内側核 顆頭 乳頭体 運動ニューロン 内頸動脈 吻側回遊流 外頸動脈 外側視床下部
参照表現データの詳細
バイオGPS 参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー 分子機能
加水分解酵素活性
金属イオン結合
デアミナーゼ活性
タンパク質結合
AMPデアミナーゼ活性
細胞成分 生物学的プロセス
プリンリボヌクレオシド一リン酸の生合成過程
IMPサルベージ
環状プリンヌクレオチド代謝プロセス
ヌクレオチド代謝プロセス
プリン含有化合物の回収
IMP生合成プロセス
エネルギー恒常性
AMP代謝プロセス
出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_001257360 NM_001257361 NM_001308170 NM_004037 NM_139156 NM_203404 NM_001368809
NM_001289719 NM_001289720 NM_028779 NM_001346665
RefSeq (タンパク質) NP_001244289 NP_001244290 NP_001295099 NP_004028 NP_631895 NP_001355738
NP_001276648 NP_001276649 NP_001333594 NP_083055
場所 (UCSC) 1 章: 109.62 – 109.63 Mb 3 章: 107.98 – 107.99 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
AMPデアミナーゼ2は 、ヒト では AMPD2 遺伝子 によってコードされる 酵素 である 。 [5] [6]
AMPD2の発現レベルが高いと、患者の転帰不良や未分化多形肉腫(UPS)の増殖性腫瘍表現型と相関する。 [7]
参考文献
^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000116337 – Ensembl 、2017 年 5 月
^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000027889 – Ensembl 、2017 年 5 月
^ 「Human PubMed Reference:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。
^ 「マウス PubMed リファレンス:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。
^ Mahnke-Zizelman DK、Sabina RL (1992 年 11 月)。「ヒト AMP デアミナーゼアイソフォーム E cDNA のクローニング。選択的スプライシング 5'-エクソンを示す 3 番目の AMPD 遺伝子の証拠」。J Biol Chem . 267 (29): 20866–77。doi : 10.1016 / S0021-9258 (19)36768-7。PMID 1400401 。
^ 「Entrez Gene: AMPD2 アデノシン一リン酸デアミナーゼ 2 (アイソフォーム L)」.
^ Orth MF、Gerke JS、Knösel T、Altendorf-Hofmann A、Musa J、Alba-Rubio R、他 (2018年9月)。「機能ゲノミクスによりAMPD2が未分化多形肉腫の新たな予後マーカーとして特定される」。International Journal of Cancer。144 ( 4 ): 859–867。doi : 10.1002/ijc.31903。PMID 30267407 。
外部リンク
さらに読む
Bausch-Jurken MT、Mahnke-Zizelman DK、Morisaki T、Sabina RL (1992)。「AMPデアミナーゼアイソフォームLの分子クローニング。ヒトAMPD2 cDNAの配列と細菌発現」。J . Biol. Chem . 267 (31): 22407–13. doi : 10.1016/S0021-9258(18)41686-9 . PMID 1429593。
Van den Bergh F、Sabina RL (1996)。「ヒト AMP デアミナーゼ 2 (AMPD2) 遺伝子発現の特性評価により、アイソフォーム L の可変 N 末端拡張をコードする代替転写産物が明らかになった」。Biochem . J. 312 ( Pt 2): 401–10. doi :10.1042/bj3120401. PMC 1136276. PMID 8526848 。
Mahnke-Zizelman DK、van den Bergh F、Bausch-Jurken MT、et al. (1996)。「ヒトAMPD2遺伝子のクローニング、配列および特徴付け:2つの近接したプロモーターによる転写制御の証拠」。Biochim . Biophys. Acta . 1308 (2): 122–32. doi :10.1016/0167-4781(96)00089-9. PMID 8764830。
Haas AL、Sabina RL (2003)。「ヒトAMPD2ポリペプチドのN末端延長はアイソフォームLのATP調節に影響を与える」。Biochem . Biophys. Res. Commun . 305 (2): 421–7. doi :10.1016/S0006-291X(03)00787-3. PMID 12745092。
Beausoleil SA、Villén J、Gerber SA、他 (2006)。「高スループットタンパク質リン酸化解析および部位局在化のための確率ベースのアプローチ」 Nat. Biotechnol . 24 (10): 1285–92. doi :10.1038/nbt1240. PMID 16964243. S2CID 14294292.
Olsen JV 、Blagoev B、Gnad F、et al. (2006)。「シグナル伝達ネットワークにおける全体的、生体内、および部位特異的なリン酸化ダイナミクス」。Cell . 127 (3): 635–48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983. S2CID 7827573。