ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| ABCF2 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | ABCF2、ABC28、EST133090、HUSSY18、HUSSY-18、ATP結合カセットサブファミリーFメンバー2 |
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| 外部ID | オミム:612510; MGI : 1351657;ホモロジーン: 21408;ジーンカード:ABCF2; OMA :ABCF2 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 5番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 5|5 A3 | 始める | 24,770,343 bp [2] |
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| 終わり | 24,782,465 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 腓骨神経
- 腓腹筋
- 前脛骨筋
- 内皮細胞
- 右前頭葉
- 二次卵母細胞
- 心の頂点
- 前頭前皮質
- 太ももの筋肉
- ブロードマン領域9
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| | トップの表現 | - 太ももの筋肉
- 精子細胞
- 精母細胞
- 桑実胚
- 胚葉上層
- 心室帯
- 精細管
- 受精卵
- 胚
- 体節
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- ヌクレオチド結合
- ATPase活性
- ATP結合
- トランスポーター活性
| | 細胞成分 |
- ATP結合カセット(ABC)トランスポーター複合体
- ミトコンドリアエンベロープ
- 膜
- ミトコンドリア
| | 生物学的プロセス | | | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | | |
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NM_001190443 NM_013853 NM_001359205 |
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| RefSeq (タンパク質) | | |
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NP_001177372 NP_038881 NP_001346134 |
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| 場所 (UCSC) | 7 章: 151.21 – 151.23 Mb | 5 章: 24.77 – 24.78 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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ATP結合カセットサブファミリーFメンバー2は、ヒトではABCF2遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
関数
この遺伝子によってコードされるタンパク質は、 ATP結合カセット(ABC)トランスポーターのスーパーファミリーのメンバーです。ABCタンパク質は、細胞外膜と細胞内膜を介してさまざまな分子を輸送します。ABC遺伝子は7つの異なるサブファミリー(ABC1、MDR / TAP、MRP、ALD、OABP、GCN20、およびWhite)に分けられます。このタンパク質はGCN20サブファミリーのメンバーです。この遺伝子の選択的スプライシングにより、複数の転写バリアントが生成されます。[6]
ABCF2は体積感受性外向き整流性Clチャネル(CLCN3)の抑制因子として作用する。[7]
参照
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000033050 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000028953 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Allikmets R、Gerrard B、Hutchinson A、Dean M (1996 年 10 月)。「ヒト ABC スーパーファミリーの特性評価: 発現配列タグ データベースを使用した 21 個の新しい遺伝子の分離とマッピング」。Human Molecular Genetics。5 ( 10 ) : 1649–55。doi : 10.1093 /hmg/5.10.1649。PMID 8894702。
- ^ ab "Entrez Gene: ABCF2 ATP結合カセット、サブファミリーF (GCN20)、メンバー2"。
- ^ Ando-Akatsuka Y, Shimizu T, Numata T, Okada Y (2012). 「ヒト上皮細胞における細胞容積と陰イオンチャネルの調節におけるABCタンパク質ABCF2とα-アクチニン-4の関与」Journal of Cellular Physiology . 227 (10): 3498– 510. doi :10.1002/jcp.24050. PMID 22252987. S2CID 22139132.
さらに読む
- クライン I、サルカディ B、ヴァラディ A (1999 年 12 月)。 「ヒトABCタンパク質の目録」。Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - 生体膜。1461 (2): 237–62 .土井: 10.1016/s0005-2736(99)00161-3。PMID 10581359。
- Dean M 、 Rzhetsky A、Allikmets R (2001 年 7 月)。「ヒト ATP 結合カセット (ABC) トランスポータースーパーファミリー」。 ゲノム研究。11 ( 7): 1156–66。doi : 10.1101/gr.184901。PMID 11435397。S2CID 9528197 。
- Hogue DL、Liu L、Ling V (1999 年 1 月)。「哺乳類ミトコンドリア ATP 結合カセット膜タンパク質の同定と特性」。Journal of Molecular Biology。285 ( 1): 379– 89。doi : 10.1006/jmbi.1998.2259。PMID 9878413 。
- Zhang F, Hogue DL, Liu L, Fisher CL, Hui D, Childs S, Ling V (2000 年 7 月). 「M-ABC2、新しいヒトミトコンドリア ATP 結合カセット膜タンパク質」. FEBS Letters . 478 ( 1– 2): 89– 94. doi : 10.1016/S0014-5793(00)01823-8 . PMID 10922475. S2CID 41556343.
- Ye Z、Connor JR (2000 年 8 月)。「環状化された第一鎖 cDNAの増幅による cDNA クローニングにより、IRE 非制御の鉄応答性 mRNA が明らかになる」。生化学および生物物理学的研究通信。275 (1): 223– 7。doi :10.1006/ bbrc.2000.3282。PMID 10944468 。
- スタンキ F、ベルトッコ E、トッポ S、ディオグアルディ R、シミオナティ B、カンナータ N、ジンベッロ R、ランフランキ G、ヴァッレ G (2001 年 1 月)。 「酵母配列との高い類似性を示す 16 の新規ヒト遺伝子の特性評価」。酵母。18 (1): 69–80 .土井: 10.1002/1097-0061(200101)18:1<69::AID-YEA647>3.0.CO;2-H。PMID 11124703。S2CID 21397515 。
- Tsuda H, Ito YM, Ohashi Y, Wong KK, Hashiguchi Y, Welch WR, Berkowitz RS, Birrer MJ, Mok SC (2005 年 10 月)。「cDNA マイクロアレイ解析による明細胞卵巣腺癌における ABCF2 の過剰発現および増幅の特定」。 臨床癌研究。11 (19 Pt 1): 6880–8。doi : 10.1158 / 1078-0432.CCR -05-0751。PMID 16203778。S2CID 27248404 。
- Nishimura S, Tsuda H, Ito K, Jobo T, Yaegashi N, Inoue T, Sudo T, Berkowitz RS, Mok SC (2007 年 1 月)。「上皮性卵巣癌の異なる組織型間および異なる臓器の明細胞腺癌における ABCF2 タンパク質の異なる発現」。Human Pathology。38 ( 1 ): 134– 9。doi : 10.1016 /j.humpath.2006.06.026。PMID 16996567 。
外部リンク
この記事には、パブリック ドメインである米国国立医学図書館のテキストが組み込まれています。