ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| ABCA5 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | ABCA5、ABC13、EST90625、ATP結合カセットサブファミリーAメンバー5、HTC3 |
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| 外部ID | オミム:612503; MGI : 2386607;ホモロジーン: 10263;ジーンカード:ABCA5; OMA :ABCA5 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 11番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 11|11 E1 | 始める | 110,160,195 bp [2] |
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| 終わり | 110,228,542 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 膵臓の体
- アキレス腱
- 腓腹筋
- 小脳半球
- 気管支上皮細胞
- 小脳の右半球
- 太ももの皮
- 肝臓の右葉
- 小腸粘膜
- 腹部の皮膚
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| | トップの表現 | - 耳石器官
- 卵形嚢
- 顔面運動核
- 嗅上皮
- 黒質
- 精嚢
- 橋核
- 精母細胞
- 内側前庭核
- 脈絡叢上皮
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- ヌクレオチド結合
- ATPase活性
- ATP結合
- 脂質トランスポーター活性
- ATPase結合膜輸送体の活性
| | 細胞成分 |
- 膜の不可欠な構成要素
- エンドソーム
- 後期エンドソーム
- ゴルジ体
- 細胞内膜小器官
- 後期エンドソーム膜
- 膜
- ゴルジ膜
- リソソーム
- リソソーム膜
| | 生物学的プロセス |
- 脂質輸送
- 高密度リポタンパク質粒子のリモデリング
- コレステロールの流出
- マクロファージ由来泡状細胞分化の負の制御
- コレステロール逆輸送
- コレステロール輸送
- 膜輸送
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| ウィキデータ |
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コレステロールトランスポーターABCA5は、ヒトではABCA5遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5]
関数
この遺伝子によってコードされる膜関連タンパク質は、 ATP結合カセット(ABC)トランスポーターのスーパーファミリーのメンバーです。ABCタンパク質は、細胞外膜と細胞内膜を介してさまざまな分子を輸送します。このコードされるタンパク質は、ABCAサブファミリーのメンバーです。ABCAサブファミリーのメンバーは、多細胞真核生物にのみ見られる唯一の主要なABCサブファミリーを構成します。この遺伝子は、17q24上の他の4つのABCAファミリーメンバーとともにクラスター化されています。この遺伝子の選択的スプライシングにより、いくつかの転写バリアントが生じますが、すべてのバリアントが完全に説明されているわけではありません。[RefSeq提供、2008年7月]。
臨床的意義
ABCA5の変異は過剰な毛髪の成長を引き起こす。[6]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000154265 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000018800 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「ABCA5 ATP結合カセットサブファミリーAメンバー5 [ Homo sapiens (ヒト) ]」。2024年9月29日閲覧。
- ^ デステファノ GM、クルバン M、アニャネ=エボア K、ダルアルミ C、ディ パオロ G、フェーンストラ H、シルヴァーバーグ N、ロヘナ L、ロペス=セペダ LD、ジョバンプトラ V、ファンタウッツォ KA、キウル M、タディン=ストラップス M、ソブリノA、ヴィテブスキー A、ウォーバートン D、レヴィ B、サラス=アラニス JC、クリスティアーノ AM (2014年)。 「コレステロールトランスポーター遺伝子ABCA5の変異は、過剰な毛髪の成長と関連している」。PLOS ジェネティクス。10 (5): e1004333。土井:10.1371/journal.pgen.1004333。PMC 4022463。PMID 24831815。
外部リンク
さらに読む
- Hu Y、Wang M、Veverka K、Garcia FU 、Stearns ME (2007)。「ABCA5タンパク質:前立腺上皮内腫瘍形成の尿診断マーカー」。 臨床癌研究。13 (3): 929– 38。doi : 10.1158/1078-0432.CCR- 06-1718。PMID 17289887。S2CID 11849206 。
- Dean M、 Rzhetsky A、Allikmets R (2001)。「ヒトATP結合カセット(ABC)トランスポータースーパーファミリー」。 ゲノム研究。11(7):1156–66。doi:10.1101/gr.184901。PMID 11435397。S2CID 9528197 。
- Kubo Y, Sekiya S, Ohigashi M, Takenaka C, Tamura K, Nada S, Nishi T, Yamamoto A, Yamaguchi A (2005). 「ABCA5 はリソソームに存在し、ABCA5 ノックアウトマウスはリソソーム疾患のような症状を発症する」.分子細胞生物学. 25 (10): 4138– 49. doi :10.1128/MCB.25.10.4138-4149.2005. PMC 1087723. PMID 15870284.
- Saini V、Hose CD、Monks A、Nagashima K、Han B、Newton DL、Millione A、Shah J、Hollingshead MG、Hite KM、Burkett MW、Delosh RM、Silvers TE、Scudiero DA、Shoemaker RH (2012)。「骨肉腫における腫瘍幹細胞の推定バイオマーカーとしての CBX3 および ABCA5 の同定」。PLOS ONE。7 ( 8 ) : e41401。Bibcode : 2012PLoSO ...741401S。doi : 10.1371 / journal.pone.0041401。PMC 3411700。PMID 22870217。
- Ohtsuki S, Kamoi M, Watanabe Y, Suzuki H, Hori S, Terasaki T (2007). 「ATP結合カセットトランスポーターA5(ABCA5)およびABCB1 mRNAの誘導とヒト大腸腫瘍の分化状態の相関」。Biological & Pharmaceutical Bulletin . 30 (6): 1144–6 . doi : 10.1248/bpb.30.1144 . PMID 17541169。
- 永瀬 剛、菊野 亮、小原 修 (2001)。「未確認ヒト遺伝子のコード配列の予測。XXI。大きなタンパク質をコードする脳由来の60個の新しいcDNAクローンの完全な配列」。DNA研究。8 ( 4): 179– 87。doi : 10.1093/dnares/ 8.4.179。PMID 11572484。
- バスケス=モクテズマ I、メラズ=リオス MA、ビジャヌエバ=ロペス CG、マガーニャ M、マルティネス=マシアス R、サンチェス=ゴンサレス DJ、ガルシア=シエラ F、エレーラ=ゴンサレス NE (2010)。 「悪性黒色腫ではATP結合カセットトランスポーターABCB5遺伝子の発現にばらつきがある」。Actas Dermo-sifiliograficas。101 (4): 341– 8.土井: 10.1016/s1578-2190(10)70645-4。PMID 20487690。
- Petry F、Kotthaus A、Hirsch-Ernst KI (2003)。「ヒトおよびラットのABCA5/Abca5のクローニングとヒトスプライスバリアントの検出」。生化学および生物物理学的研究通信。300 (2): 343– 50。doi :10.1016/s0006-291x(02)02827-9。PMID 12504089 。
- Allikmets R、Gerrard B、 Hutchinson A、Dean M (1996)。「ヒトABCスーパーファミリーの特徴:発現配列タグデータベースを使用した21個の新しい遺伝子の分離とマッピング」。ヒト分子 遺伝学。5 (10): 1649–55。doi : 10.1093/hmg/5.10.1649。PMID 8894702。
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