ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| ABCA2 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | ABCA2、ATP結合カセット、サブファミリーA(ABC1)、メンバー2、AI413825、Abc2、D2H0S1474E、mKIAA1062、ATP結合カセットサブファミリーAメンバー2、IDPOGSA |
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| 外部ID | OMIM : 600047; MGI : 99606;ホモロジーン: 55590;ジーンカード:ABCA2; OMA :ABCA2 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 染色体2(マウス)[2] |
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| | バンド | 2 A3|2 17.25 cM | 始める | 25,318,715 bp [2] |
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| 終わり | 25,338,552 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - C1セグメント
- 小脳の右半球
- 右前頭葉
- 脛骨神経
- 中前頭回
- 扁桃体
- 迷走神経下神経節
- 前頭前皮質
- 視床下部
- 腓骨神経
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| | トップの表現 | - 上前頭回
- 一次視覚野
- 海馬歯状回顆粒細胞
- 小脳皮質
- 第四脳室脈絡叢
- 嗅周囲皮質
- 中脳の中心灰白質
- 嗅内皮質
- CA3フィールド
- 脊髄の腰椎部分
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | 
 | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- ATPase結合膜輸送体の活性
- ヌクレオチド結合
- トランスポーター活性
- ATPase活性
- ATP結合
- 脂質トランスポーター活性
| | 細胞成分 |
- 膜の不可欠な構成要素
- エンドソーム
- 膜
- ATP結合カセット(ABC)トランスポーター複合体
- 微小管形成中心
- リソソーム膜
- リソソーム
- エンドソーム膜
- 細胞質小胞
- 細胞内膜小器官
| | 生物学的プロセス |
- 細胞内コレステロール輸送の調節
- 脂質代謝
- RNAポリメラーゼIIによる転写の調節
- ステロイドホルモンへの反応
- コレステロール恒常性
- 膜輸送
- 輸送
- 脂質輸送
- コレステロールに対する反応
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| ウィキデータ |
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ATP結合カセットサブファミリーAメンバー2は、ヒトではABCA2遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
この遺伝子によってコードされる膜関連タンパク質は、ATP結合カセット(ABC)トランスポーターのスーパーファミリーのメンバーです。ABCタンパク質は、細胞外膜と細胞内膜を介してさまざまな分子を輸送します。ABC遺伝子は、7つの異なるサブファミリー(ABC1、MDR / TAP、MRP、ALD、OABP、GCN20、White)に分けられます。このタンパク質はABC1サブファミリーのメンバーです。ABC1サブファミリーのメンバーは、多細胞真核生物にのみ見られる唯一の主要なABCサブファミリーを構成します。このタンパク質は脳組織で高度に発現しており、マクロファージの脂質代謝と神経発達に役割を果たしている可能性があります。この遺伝子には、異なるアイソフォームをコードする2つの転写バリアントが見つかっています。[6]
参照
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000107331 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000026944 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Luciani MF、Denizot F、Savary S、Mattei MG、 Chimini G (1994年10月) 。「ヒト9番染色体上にマッピングされた2つの新規ABCトランスポーターのクローニング」。ゲノミクス。21 (1): 150– 9。doi :10.1006/geno.1994.1237。PMID 8088782 。
- ^ ab "Entrez Gene: ABCA2 ATP結合カセット、サブファミリーA (ABC1)、メンバー2"。
さらに読む
- Schmitz G, Kaminski WE (2002). 「ABCA2: 神経膜脂質輸送の候補調節因子」. Cell. Mol. Life Sci . 59 (8): 1285– 95. doi :10.1007 / s00018-002-8508-5. PMC 11337434. PMID 12363033. S2CID 2419514.
- Adams MD 、 Dubnick M、 Kerlavage AR、他 (1992)。「2,375 個のヒト脳遺伝子の配列同定」。Nature . 355 ( 6361): 632– 4。Bibcode :1992Natur.355..632A。doi :10.1038/355632a0。PMID 1538749。S2CID 4234345。
- Allikmets R、Gerrard B、Glavac D、et al. (1995)。「EST データベースからの 3 つの新しい哺乳類 ATP 結合トランスポーター遺伝子の特性評価とマッピング」。Mamm . Genome . 6 (2): 114– 7. doi :10.1007/BF00303254. PMID 7766993. S2CID 10157132。
- Kikuno R, Nagase T, Ishikawa K, et al. (1999). 「未確認ヒト遺伝子のコード配列の予測。XIV. 試験管内で巨大タンパク質をコードする脳由来の100個の新しいcDNAクローンの完全配列」。DNA Res . 6 (3): 197– 205. doi : 10.1093/dnares/6.3.197 . PMID 10470851。
- Klucken J, Büchler C, Orsó E, et al. (2000). 「ショウジョウバエの白色遺伝子のヒト相同遺伝子である ABCG1 (ABC8) は、マクロファージのコレステロールとリン脂質の輸送の調節因子である」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 97 (2): 817– 22. Bibcode :2000PNAS...97..817K. doi : 10.1073 /pnas.97.2.817 . PMC 15414. PMID 10639163.
- Zhao LX、Zhou CJ、Tanaka A、et al. (2001)。「ラットATP結合カセット(ABC)トランスポーターABC2/ABCA2のクローニング、特性評価および組織分布」。Biochem . J. 350 ( 3): 865– 72. doi :10.1042/0264-6021:3500865. PMC 1221321. PMID 10970803 。
- Kaminski WE、Piehler A、Püllmann K、et al. (2001)。「ヒト ABCA2 遺伝子の完全なコード配列、プロモーター領域、ゲノム構造、およびマクロファージにおけるステロール依存性調節の証拠」。Biochem . Biophys. Res. Commun . 281 (1): 249– 58. doi :10.1006/bbrc.2001.4305. PMID 11178988。
- Vulevic B、Chen Z、Boyd JT、et al. (2001)。「ヒトアデノシン5'-三リン酸結合カセット、サブファミリーA、トランスポーター2(ABCA2)のクローニングと特性評価」。Cancer Res . 61 (8): 3339– 47。PMID 11309290 。
- Wistow G、Bernstein SL、Wyatt MK、他 (2002)。「NEIBank プロジェクトのための成人ヒト水晶体の発現配列タグ解析: 2000 を超える非冗長転写産物、新規遺伝子、スプライスバリアント」。Mol . Vis . 8 : 171–84。PMID 12107413 。
- Nakayama M, Kikuno R, Ohara O (2003). 「巨大タンパク質間のタンパク質間相互作用:長鎖cDNAからなる機能的に分類されたライブラリーを用いた2ハイブリッドスクリーニング」Genome Res . 12 (11): 1773– 84. doi :10.1101/gr.406902. PMC 187542. PMID 12421765 .
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932.
- Davis W、Chen ZJ、Ile KE、Tew KD (2003)。「ヒトアデノシン5'-三リン酸結合カセット、サブファミリーA、トランスポーター2(ABCA2)プロモーターの発現の、早期成長応答-1(EGR-1)およびSpファミリー転写因子による相互制御」。Nucleic Acids Res。31 (3 ): 1097–107。doi :10.1093 /nar/gkg192。PMC 149212。PMID 12560508。
- Ile KE、Davis W、Boyd JT、et al. (2005)。「ユニークな N 末端をコードするヒト ABCA2 トランスポーター遺伝子の新規第 1 エクソンの同定」。Biochim . Biophys. Acta . 1678 (1): 22– 32. doi :10.1016/j.bbaexp.2004.01.007. PMID 15093135。
- Chen ZJ、Vulevic B、Ile KE、et al. (2005)。「ABCA2 発現とアルツハイマー病の決定因子との関連」。FASEB J. 18 (10): 1129–31 . doi : 10.1096 /fj.03-1490fje . PMID 15155565. S2CID 12495522.
- Davis W、Boyd JT、Ile KE、Tew KD (2004)。「ヒト ATP 結合カセットトランスポーター 2 (ABCA2) はチャイニーズハムスター卵巣細胞において低密度リポタンパク質受容体の発現を正に制御し、コレステロールのエステル化を負に制御する」。Biochim . Biophys. Acta . 1683 ( 1–3 ): 89–100 . doi :10.1016/j.bbalip.2004.04.009. PMID 15238223。
- Homma K, Kikuno RF, Nagase T, et al. (2004). 「不安定なタンパク質ドメインをコードする選択的スプライスバリアントがヒトの脳に存在する」J. Mol. Biol . 343 (5): 1207– 20. doi :10.1016/j.jmb.2004.09.028. PMID 15491607.
- Macé S, Cousin E, Ricard S, et al. (2005). 「ABCA2 は早期発症型アルツハイマー病の強力な遺伝的危険因子である」Neurobiol. Dis . 18 (1): 119– 25. doi :10.1016/j.nbd.2004.09.011. PMID 15649702. S2CID 10497567.
- Wang Y, Yamada K, Tanaka Y, et al. (2005). 「ヒト前庭神経鞘腫および末梢神経における ABCA2 タンパク質の発現」J. Neurol. Sci . 232 ( 1– 2): 59– 63. doi :10.1016/j.jns.2005.01.016. PMID 15850583. S2CID 36309768.
外部リンク
この記事には、パブリックドメインである米国国立医学図書館のテキストが組み込まれています。