ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
RBM8A について 利用可能な構造 ＰＤＢ オルソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 1P27、2HYI、2J0Q、2J0S、2XB2、3EX7
識別子 エイリアス RBM8A 、BOV-1A、BOV-1B、BOV-1C、C1DELq21.1、DEL1q21.1、MDS014、RBM8、RBM8B、TAR、Y14、ZNRP、ZRNP1、RNA結合モチーフタンパク質8A 外部ID オミム ：605313; MGI : 1913129; ホモロジーン : 3744; ジーンカード ：RBM8A; OMA :RBM8A - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 染色体3（マウス） [2] バンド 3|3 F2.1 始める 96,537,249 bp [2] 終わり 96,541,107 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 神経節隆起 心室帯 アキレス腱 鼻粘膜の嗅覚領域 腓腹筋 ランゲルハンス島 腹部の皮膚 単球 右精巣 左精巣
トップの表現 胚 胚 心室中隔 心室帯 胚盤胞 卵黄嚢 桑実胚 海馬歯状回顆粒細胞 胚葉上層 網膜の神経層
参照表現データの詳細
バイオGPS
遺伝子オントロジー 分子機能
タンパク質結合 核酸結合 RNA結合 mRNA結合 細胞成分
細胞質 触媒ステップ 2 スプライソソーム エクソン-エクソン接合複合体 ソーマ 樹状突起 スプライソソーム複合体 核 細胞質 核質 核の粒 U2型触媒ステップ1スプライソソーム 生物学的プロセス
スプライソソームを介したmRNAスプライシング RNAポリメラーゼII転写の終結 mRNA輸送 RNA処理 mRNA処理 スプライソソームを介した選択的mRNAスプライシングの制御 核からのmRNAの輸出 mRNA 3'末端処理 翻訳の規制 核からのRNAの輸出 核転写されたmRNAの分解過程、ナンセンス変異による分解 RNAスプライシング 輸送 出典:Amigo / QuickGO
ウィキデータ
RNA結合タンパク質8A は、ヒトでは RBM8A 遺伝子によってコードされる タンパク質 である 。 [5] [6]
この遺伝子は、保存された RNA 結合モチーフを持つタンパク質をコードします。このタンパク質は主に核に存在しますが、細胞質にも存在します。このタンパク質は、核 mRNA と新しく輸送された細胞質 mRNA の両方を含む、スプライシングによって生成された mRNA と優先的に関連しています。このタンパク質は、イントロンが存在していた場所を示すタグとして、スプライシングされた mRNA と関連したままであり、mRNA スプライシング前後のイベントを連結していると考えられています。以前は、このタンパク質をコードしている遺伝子は RBM8A と RBM8B の 2 つであると考えられていましたが、現在では RBM8B 遺伝子座は擬似遺伝子であると考えられています。2 つの代替開始コドンによって 2 つの形式のタンパク質が生成され、この遺伝子は複数のポリアデニル化部位も使用します。 [7]
インタラクション RBM8AはIPO13 [8] 、 MAGOH [9]、 [10] 、 UPF3A [11] と 相互作用する ことが示されている 。
参考文献
^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000265241 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000038374 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ 「Human PubMed Reference:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ Conklin DC、Rixon MW、Kuestner RE、Maurer MF、Whitmore TE、Millar RP (2000 年 10 月)。「新規ヒトリボ核タンパク質のクローニングと遺伝子発現」。Biochim Biophys Acta . 1492 (2–3): 465–9. doi :10.1016/s0167-4781(00)00090-7. PMID 11004516。 ^ Salicioni AM、Xi M、Vanderveer LA、Balsara B、Testa JR、Dunbrack RL Jr、Godwin AK (2000 年 10 月)。「ヒト RBM8A および RBM8B の同定と構造解析: 腫瘍抑制因子候補 OVCA1 と相互作用する 2 つの高度に保存された RNA 結合モチーフタンパク質」。Genomics . 69 ( 1): 54–62. doi :10.1006/geno.2000.6315. PMID 11013075。 ^ 「Entrez Gene: RBM8A RNA結合モチーフタンパク質8A」。 ^ Mingot, JM; Kostka S; Kraft R; Hartmann E; Görlich D (2001 年 7 月). 「Importin 13: 核の輸入と輸出の新しい仲介者」. EMBO J. 20 ( 14). イギリス: 3685–94. doi :10.1093/emboj/20.14.3685. ISSN 0261-4189. PMC 125545. PMID 11447110 . ^ Zhao, XF; Nowak NJ; Shows TB; Aplan PD (2000 年 1 月)。「MAGOH は 新規 RNA 結合タンパク質と相互作用する」。Genomics . 63 ( 1)。米国: 145–8。doi : 10.1006 /geno.1999.6064。ISSN 0888-7543。PMID 10662555 。 ^ Kataoka, N; Diem MD; Kim VN; Yong J; Dreyfuss G (2001 年 11 月). 「ショウジョウバエ mago nashi タンパク質のヒト相同体である Magoh は、スプライシング依存性のエクソン-エクソン接合複合体の構成要素である」. EMBO J. 20 ( 22). イギリス: 6424–33. doi :10.1093/emboj/20.22.6424. ISSN 0261-4189. PMC 125744. PMID 11707413 . ^ Kim, VN; Kataoka N; Dreyfuss G (2001 年 9 月). 「スプライシング依存性エクソン-エクソン接合複合体におけるナンセンス変異誘発性崩壊因子 hUpf3 の役割」. Science . 293 (5536). 米国: 1832–6. Bibcode :2001Sci...293.1832K. doi :10.1126/science.1062829. ISSN 0036-8075. PMID 11546873. S2CID 12018200. ^ Klopocki E、Schulze H、Strauss G、他 (2007 年 2 月)。「血小板減少症 - 橈骨欠損症候群における微小欠失を伴う常染色体劣性遺伝に類似した複雑な遺伝パターン」 Am. J. Hum. Genet . 80 (2): 232–40. doi :10.1086/510919. PMC 1785342 . PMID 17236129.
さらに読む
Wilson KF、Fortes P、Singh US、et al. (1999)。「核キャップ結合複合体は、成長因子受容体結合シグナル伝達の新たな標的である」。J . Biol. Chem . 274 (7): 4166–73. doi : 10.1074/jbc.274.7.4166 . PMID 9933612。 Zhao XF、Nowak NJ、Shows TB、Aplan PD (2000)。「MAGOH は新規 RNA 結合タンパク質と相互作用する」。Genomics . 63 ( 1): 145–8. doi :10.1006/geno.1999.6064. PMID 10662555。 Kataoka N, Yong J, Kim VN, et al. (2000). 「Pre-mRNAスプライシングは、細胞質に残る新しいRNA結合タンパク質を核内のmRNAに刻印する」。Mol . Cell . 6 (3): 673–82. doi : 10.1016/S1097-2765(00)00065-4 . PMID 11030346。 Zhang QH、Ye M、Wu XY、他 (2001)。「CD34+ 造血幹細胞/前駆細胞で発現する 300 個の未定義遺伝子のオープンリーディングフレームを持つ cDNA のクローニングと機能解析」。Genome Res . 10 (10): 1546–60. doi :10.1101/gr.140200. PMC 310934 . PMID 11042152。 Le Hir H、Izaurralde E、Maquat LE、Moore MJ (2001)。「スプライソソームは、mRNA エクソン-エクソン接合部の 20～24 ヌクレオチド上流に複数のタンパク質を沈着させる」。EMBO J. 19 ( 24): 6860～9. doi :10.1093/emboj/19.24.6860. PMC 305905. PMID 11118221 。 Mingot JM、Kostka S、Kraft R、et al. (2001)。「インポーチン13：核の 輸入と輸出の新たなメディエーター」。EMBO J. 20 (14): 3685–94. doi :10.1093/emboj/20.14.3685. PMC 125545. PMID 11447110 。 Kim VN、Kataoka N、 Dreyfuss G (2001)。「スプライシング依存性エクソン-エクソン接合複合体におけるナンセンス変異介在性崩壊因子hUpf3の役割」。Science。293 ( 5536 ) : 1832–6。Bibcode : 2001Sci ... 293.1832K。doi :10.1126/science.1062829。PMID 11546873。S2CID 12018200 。 Lykke-Andersen J、Shu MD、Steitz JA (2001)。「タンパク質RNPS1によるmRNA監視機構へのエクソン-エクソン接合部の位置の伝達」。Science。293 ( 5536 ) : 1836–9。Bibcode : 2001Sci ... 293.1836L。doi :10.1126/science.1062786。PMID 11546874。S2CID 389385 。 Hachet O, Ephrussi A (2002). 「ショウジョウバエY14は卵母細胞後部まで往復し、oskar mRNA輸送に必要である」。Curr . Biol . 11 (21): 1666–74. doi : 10.1016/S0960-9822(01)00508-5 . PMID 11696323. S2CID 2373806. Faurholm B、Millar RP、Katz AA (2002)。「ヒトのII型ゴナドトロピン放出ホルモン受容体とリボ核タンパク質RBM8Aをコードする遺伝子は、2つのゲノム遺伝子座で重複している」。Genomics . 78 ( 1–2): 15–8. doi :10.1006/geno.2001.6650. PMID 11707068。 Kataoka N, Diem MD, Kim VN , et al. (2002). 「ショウジョウバエ mago nashi タンパク質のヒト相同体である Magoh は、スプライシング依存性のエクソン-エクソン接合複合体の構成要素である」。EMBO J. 20 (22): 6424–33. doi :10.1093/emboj/20.22.6424. PMC 125744. PMID 11707413 。 Jurica MS、Licklider LJ、Gygi SR 、 et al. (2002)。「3次元構造解析に適したネイティブスプライソソームの精製と特性評価」 。RNA。8 ( 4 ) : 426–39。doi : 10.1017 /S1355838202021088。PMC 1370266。PMID 11991638 。 Okubo K, Mitani H, Naruse K, et al. (2002). 「メダカとヒトゲノムにおける GnRH-R と RBM8 の保存された物理的結合」 Biochem. Biophys. Res. Commun . 293 (1): 327–31. doi :10.1016/S0006-291X(02)00161-4. PMID 12054603. Lejeune F、Ishigaki Y、Li X、Maquat LE (2002)。「哺乳類細胞ではエクソンジャンクション複合体はCBP80結合mRNAで検出されるが、eIF4E結合mRNAでは検出されない：mRNPリモデリングのダイナミクス」。EMBO J. 21 ( 13): 3536–45. doi :10.1093/emboj/cdf345. PMC 126094. PMID 12093754 。 Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932 。 Gehring NH、Neu-Yilik G、Schell T、et al. (2003)。「Y14 と hUpf3b は NMD 活性化複合体を形成する」。Mol . Cell . 11 (4): 939–49. doi : 10.1016/S1097-2765(03)00142-4 . PMID 12718880。 フリブール S、ガットフィールド D、イザウラルデ E、コンティ E (2003)。 「Y14-Mago複合体におけるRBDタンパク質認識の新規モード」。 ナット。構造体。バイオル 。 10 (6): 433–9。 土井 ：10.1038/nsb926。 PMID 12730685。S2CID 40116577 。 Lau CK、Diem MD、Dreyfuss G、Van Duyne GD (2004)。「エクソンジャンクション複合体のY14-Magohコアの構造」。Curr . Biol . 13 (11): 933–41. doi : 10.1016/S0960-9822(03)00328-2 . PMID 12781131. S2CID 14752714.
