ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| VTA1 |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オルソログ検索: PDBe RCSB |
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| PDB IDコードのリスト |
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2LXL、2LXM、4TXP、4TXQ、4TXR、4U7E |
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| 識別子 |
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| エイリアス | VTA1、C6orf55、DRG-1、DRG1、LIP5、My012、SBP1、HSPC228、小胞輸送1、6orf55 |
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| 外部ID | オミム:610902; MGI : 1913451;ホモロジーン: 6473;ジーンカード:VTA1; OMA :VTA1 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 染色体10(マウス)[2] |
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| | バンド | 10|10 A2 | 始める | 14,530,499 bp [2] |
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| 終わり | 14,581,304 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 神経節隆起
- 膵臓上皮細胞
- 羊水
- 三角筋
- 心室帯
- 前脛骨筋
- ランゲルハンス島
- 外側広筋
- 腕の皮膚
- 回腸粘膜
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| | トップの表現 | - 受精卵
- 内側神経節隆起
- 二次卵母細胞
- 性器結節
- 網膜の神経層
- 胎児の尾
- 顆粒球
- 一次卵母細胞
- 海馬歯状回顆粒細胞
- 右腎臓
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 | | | 細胞成分 |
- 細胞質
- 細胞質
- エンドソーム
- エンドソーム膜
- 細胞外エクソソーム
- 膜
- 核質
- 細胞内膜で囲まれた細胞小器官
| | 生物学的プロセス |
- タンパク質輸送
- エンドソーム輸送
- 多小胞体アセンブリ
- ウイルスのライフサイクル
- 多小胞体選別経路
- ESCRT III複合体の分解
- マクロオートファジー
- 輸送
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_016485 NM_001286371 NM_001286372 |
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| RefSeq (タンパク質) | |
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NP_001273300 NP_001273301 NP_057569 |
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| 場所 (UCSC) | 6 章: 142.15 – 142.22 Mb | 10 章: 14.53 – 14.58 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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液胞タンパク質選別関連タンパク質VTA1ホモログは、ヒトではVTA1遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000009844 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000019868 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Shi J, Cai W, Chen X, Ying K, Zhang K, Xie Y (2001年8月). 「抑制サブトラクティブハイブリダイゼーションによるグリア細胞におけるドーパミン応答性mRNAの同定」. Brain Res . 910 ( 1– 2): 29– 37. doi :10.1016/S0006-8993(01)02393-9. PMID 11489251. S2CID 43814085.
- ^ 「Entrez Gene: C6orf55 染色体 6 オープンリーディングフレーム 55」。
さらに読む
- Andersson B、Wentland MA、Ricafrente JY、et al. (1996)。「改良されたショットガンライブラリ構築のための「ダブルアダプター」法」。Anal . Biochem . 236 (1): 107– 13. doi :10.1006/abio.1996.0138. PMID 8619474。
- Yu W, Andersson B, Worley KC, et al. (1997). 「大規模連結cDNAシークエンシング」Genome Res . 7 (4): 353–8 . doi :10.1101/gr.7.4.353. PMC 139146. PMID 9110174 .
- Zhang QH、Ye M、Wu XY、他 (2001)。「CD34+ 造血幹細胞/前駆細胞で発現する、これまで未定義であった 300 個の遺伝子のオープンリーディングフレームを持つ cDNA のクローニングと機能解析」。Genome Res . 10 (10): 1546– 60. doi :10.1101/gr.140200. PMC 310934 . PMID 11042152。
- Wiemann S、Weil B、Wellenreuther R、他 (2001)。「ヒト遺伝子およびタンパク質のカタログに向けて:ヒトcDNAをコードする500個の新規完全タンパク質の配列決定および分析」。Genome Res . 11 (3): 422– 35. doi :10.1101/gr.GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166 。
- Tchernev VT、Mansfield TA、Giot L、et al. (2002)。「Chediak-Higashiタンパク質はSNARE複合体およびシグナル伝達タンパク質と相互作用する」。Mol . Med . 8 (1): 56– 64. doi :10.1007/bf03402003. PMC 2039936. PMID 11984006 。
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932.
- 太田 孝文、鈴木 勇、西川 孝文、他 (2004)。「21,243 個の完全長ヒト cDNA の完全配列決定と特性解析」。Nat . Genet . 36 (1): 40–5 . doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039。
- 藤田 宏、梅月 裕、今村 和也、他(2005)。 「哺乳類のクラス E Vps タンパク質、SBP1 および mVps2/CHMP2A は、AAA-ATPase SKD1/Vps4B と相互作用し、その機能を調節します。」J.Cell Sci.117 (Pt 14): 2997–3009。土井: 10.1242/jcs.01170。PMID 15173323。
- Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの現状、品質、拡大: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。
- Rual JF、Venkatesan K、Hao T、他 (2005)。「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。Nature 437 ( 7062 ) : 1173– 8。Bibcode : 2005Natur.437.1173R。doi : 10.1038 / nature04209。PMID 16189514。S2CID 4427026。