ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
ＶＰＳ４５ 識別子 エイリアス VPS45 、H1、H1SCN5、VPS45A、VPS45B、VPS54A、VSP45、VSP45A、液胞タンパク質選別45ホモログ 外部ID オミム ：610035; MGI : 891965; ホモロジーン ：5250; ジーンカード ：VPS45; OMA :VPS45 - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 染色体3（マウス） [2] バンド 3 F2.1|3 41.65 cM 始める 95,907,144 bp [2] 終わり 95,965,778 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 小脳皮質 小脳半球 小脳の右半球 右副腎皮質 神経節隆起 小脳虫部 左副腎 単球 左副腎皮質 アキレス腱
トップの表現 網膜の神経層 神経管 顔面運動核 海馬歯状回顆粒細胞 右腎臓 太ももの筋肉 神経節隆起 海馬のI領域 レンズ 視索上核
参照表現データの詳細
バイオGPS 参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー 分子機能 細胞成分
膜の不可欠な構成要素 エンドソーム ゴルジ体 エンドソーム膜 膜 ゴルジ膜 細胞成分 シナプス小胞 生物学的プロセス
タンパク質輸送 細胞内タンパク質輸送 血液凝固 小胞輸送 エキソサイトーシスに関与する小胞ドッキング 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_001279353 NM_001279354 NM_001279355 NM_007259
RefSeq (タンパク質) NP_001266282 NP_001266283 NP_009190
場所 (UCSC) 1 章: 150.07 – 150.15 Mb 3 章: 95.91 – 95.97 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
液胞タンパク質選別関連タンパク質45 は、ヒトでは VPS45 遺伝子によってコードされる タンパク質 である 。 [5] [6]
関数 小胞 を介した タンパク質選別は、細胞内分子を異なる 細胞小器官 に分離する上で重要な役割を果たしている 。酵母の遺伝子研究では、小胞の液胞への 輸送に関与する 液胞タンパク質選別 （VPS）遺伝子が40以上 特定されている。この遺伝子はSec1ドメインファミリーのメンバーであり、マウス、ラット、酵母のVps45と高い配列類似性を示している。この遺伝子の正確な機能は不明だが、末梢血単核細胞での高発現は、 炎症性メディエーター を含むタンパク質の輸送に関与していることを示唆している。 [6]
参考文献
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さらに読む
Maruyama K, Sugano S (1994). 「オリゴキャッピング：真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置き換える簡単な方法」 Gene . 138 (1–2): 171–4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298. Tellam JT、James DE、Stevens TH、Piper RC (1997)。「哺乳類ゴルジ体 Sec1p 様タンパク質 mVps45 の同定」。J . Biol. Chem . 272 (10): 6187–93. doi : 10.1074/jbc.272.10.6187 . PMID 9045632。 Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, et al. (1997). 「全長濃縮および5'末端濃縮cDNAライブラリーの構築と特性評価」. Gene . 200 (1–2): 149–56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149. Rajasekariah P、Eyre HJ、Stanley KK、他 (1999)。「ヒト白血球空胞タンパク質選別 (h1Vps45) をコードする cDNA の分子クローニングと特性評価」。Int . J. Biochem. Cell Biol . 31 (6): 683–94. doi :10.1016/S1357-2725(99)00017-5. PMID 10404641。 Nielsen E、Christophoridis S、Uttenweiler-Joseph S、et al. (2000)。「Rabenosyn-5、新規 Rab5 エフェクターは hVPS45 と複合し、FYVE フィンガードメインを介してエンドソームにリクルートされる」。J . Cell Biol . 151 (3): 601–12. doi :10.1083/jcb.151.3.601. PMC 2185588. PMID 11062261 。 de Renzis S、Sönnichsen B、Zerial M (2002)。「二価 Rab エフェクターは初期エンドソームのサブコンパートメント組織と分類を制御する」。Nat . Cell Biol . 4 (2): 124–33. doi :10.1038/ncb744. PMID 11788822. S2CID 6596498. Dulubova I、Yamaguchi T、Gao Y、et al. (2002)。「Tlg2p/シンタキシン16がVps45を「捕らえる」仕組み」。EMBO J. 21 (14): 3620–31. doi : 10.1093/emboj/cdf381. PMC 126126. PMID 12110575 . Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932 。 Kim BY、Ueda M、Kominami E、et al. (2004)。「マウス Vps16 の同定と哺乳類クラス C Vps 複合体の生化学的特徴」。Biochem . Biophys. Res. Commun . 311 (3): 577–82. doi :10.1016/j.bbrc.2003.10.030. PMID 14623309。 太田 孝文、鈴木 勇、西川 孝文、他 (2004)。「21,243 個の完全長ヒト cDNA の完全な配列決定と特性解析」。Nat . Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039。 Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの現状、品質、拡大: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。 Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。 Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, et al. (2006). 「転写調節の多様化: ヒト遺伝子の推定代替プロモーターの大規模な同定と特性評価」 Genome Res . 16 (1): 55–65. doi :10.1101/gr.4039406. PMC 1356129. PMID 16344560 .
