ＶＰＳ３９

ＶＰＳ３９
識別子
エイリアス	VPS39、TLP、VAM6、hVam6p、HOPS複合体サブユニット、HOPS複合体のVPS39サブユニット
外部ID	オミム：612188; MGI : 2443189;ホモロジーン：41025;ジーンカード：VPS39; OMA :VPS39 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
クロ。	15番染色体（ヒト）
終わり	42,208,307 bp
遺伝子の位置（マウス）
クロ。	染色体2（マウス）
終わり	120,183,618 bp
RNA発現パターン
	トップの表現
	右子宮管; ; 顆粒球; ; 胃粘膜; ; 脚の皮膚; ; 甲状腺の右葉; ; 腹部の皮膚; ; 甲状腺の左葉; ; 下垂体前葉; ; 心の頂点; ; 右副腎皮質;
	トップの表現
	受精卵; ; 二次卵母細胞; ; 一次視覚野; ; 性器結節; ; 網膜の神経層; ; 顔面運動核; ; 上前頭回; ; 小脳皮質; ; 運動ニューロン; ; 視索上核;
	参照表現データの詳細
	参照表現データの詳細
オルソログ
	23339
	269338
	ENSG00000166887
	ENSMUSG00000027291
	Q96JC1
	言語
	NM_001301138 ; NM_015289
	NM_147153 ; NM_178851 ; NM_001363053 ; NM_001363054
	NP_001288067 ; NP_056104
	NP_671495 ; NP_849182 ; NP_001349982 ; NP_001349983
	ウィキデータ
人間の表示/編集	マウスの表示/編集

hVamp6/Vps39様タンパク質は、ヒトではVPS39遺伝子によってコードされるタンパク質である。^[5]^[6]

この遺伝子は、後期エンドソームとリソソームのクラスター形成と融合を促進するタンパク質をコードしている。このタンパク質は、トランスフォーミング成長因子β受容体複合体をSmad経路に結合させることで、トランスフォーミング成長因子β応答を調節するアダプタータンパク質としても機能する可能性がある。^[6]

参考文献

^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000166887 – Ensembl、2017 年 5 月
^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000027291 – Ensembl、2017 年 5 月
^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ Caplan S, Hartnell LM, Aguilar RC, Naslavsky N, Bonifacino JS (2001 年 7 月). 「ヒト Vam6p は生体内でリソソームのクラスター化と融合を促進する」. J Cell Biol . 154 (1): 109–122. doi :10.1083/jcb.200102142. PMC 2196876. PMID 11448994 .
^ ab 「Entrez Gene: VPS39 液胞タンパク質選別 39 ホモログ (S. cerevisiae)」。

さらに読む

中島大将、岡崎直人、山川博司、他（2003年）。「KIAA 遺伝子の発現準備が整った cDNA クローンの構築: 330 個の KIAA cDNA クローンの手動キュレーション」。DNA研究所9 (3): 99-106。土井：10.1093/dnares/9.3.99。PMID 12168954。
Nagase T, Ishikawa K, Suyama M, et al. (1999). 「未確認ヒト遺伝子のコード配列の予測。XI. 試験管内で大きなタンパク質をコードする脳由来の 100 個の新しい cDNA クローンの完全な配列」。DNA Res . 5 (5): 277–286. doi : 10.1093/dnares/5.5.277 . PMID 9872452。
Hartley JL、Temple GF、Brasch MA (2001)。「in vitro 部位特異的組み換えを用いた DNA クローニング」。Genome Res . 10 (11): 1788–1795. doi :10.1101/gr.143000. PMC 310948. PMID 11076863 。
Wiemann S、Weil B、Wellenreuther R、他 (2001)。「ヒト遺伝子およびタンパク質のカタログに向けて：ヒトcDNAをコードする500個の新規完全タンパク質の配列決定および分析」。Genome Res . 11 (3): 422–435. doi :10.1101/gr.GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166 。
Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–16903。Bibcode :2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073 / pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
Felici A、Wurthner JU、Parks WT、et al. (2003)。「TGF-βシグナル伝達の新規モジュレーターTLPは、Smad2依存性およびSmad3依存性シグナル伝達に反対の効果をもたらす」。EMBO J. 22 ( 17): 4465–4477. doi :10.1093/emboj/cdg428. PMC 202370. PMID 12941698 。
Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの現状、品質、拡大: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121–2127. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。
Wiemann S, Arlt D, Huber W, et al. (2004). 「ORFeome から生物学へ: 機能ゲノミクスパイプライン」Genome Res . 14 (10B): 2136–2144. doi :10.1101/gr.2576704. PMC 528930. PMID 15489336 .
Rual JF、Venkatesan K、Hao T、他 (2005)。「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。Nature . 437 ( 7062 ) : 1173–1178。Bibcode : 2005Natur.437.1173R。doi : 10.1038/nature04209。PMID 16189514。S2CID 4427026。
Mehrle A、Rosenfelder H、 Schupp I、他 (2006)。「2006 年の LIFEdb データベース」。Nucleic Acids Res . 34 (データベース号): D415–D418。doi :10.1093 / nar/gkj139。PMC 1347501。PMID 16381901。

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000166887 – Ensembl、2017 年 5 月

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000027291 – Ensembl、2017 年 5 月

[3] 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[4] 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[pmid11448994-5] Caplan S, Hartnell LM, Aguilar RC, Naslavsky N, Bonifacino JS (2001 年 7 月). 「ヒト Vam6p は生体内でリソソームのクラスター化と融合を促進する」. J Cell Biol . 154 (1): 109–122. doi :10.1083/jcb.200102142. PMC 2196876. PMID 11448994 .

[entrez-6] 「Entrez Gene: VPS39 液胞タンパク質選別 39 ホモログ (S. cerevisiae)」。