ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| USP53 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | USP53、ユビキチン特異的ペプチダーゼ53 |
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| 外部ID | オミム:617431; MGI : 2139607;ホモロジーン: 34521;ジーンカード:USP53; OMA :USP53 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 染色体3(マウス)[2] |
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| | バンド | 3|3 G1 | 始める | 122,725,142 bp [2] |
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| 終わり | 122,778,159 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - アキレス腱
- 脛骨神経
- 胃粘膜
- 右肺
- 胚上皮
- 腓骨神経
- 肺の下葉
- 結腸上皮
- 三叉神経節
- 脛骨
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| | トップの表現 | - 原腸胚
- 脱落膜
- 脊髄の腰椎部分
- 胃の上皮
- 結膜円蓋
- 左結腸
- 中央隆起
- 肋間筋
- 精子細胞
- 精母細胞
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 | | | 細胞成分 |
- 細胞間結合
- 二細胞タイトジャンクション
- 細胞接合
- 細胞成分
| | 生物学的プロセス |
- タンパク質の脱ユビキチン化
- 聴覚
- 活動電位
- アポトーシスの過程
- 聴覚刺激に対する反応
- ニューロンのアポトーシス過程
- 生物学的プロセス
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | NM_019050 NM_001371395 NM_001371396 NM_001371397 NM_001371398
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NM_001371399 |
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| RefSeq (タンパク質) | NP_061923 NP_001358324 NP_001358325 NP_001358326 NP_001358327
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NP_001358328 |
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| 場所 (UCSC) | 4 章: 119.21 – 119.3 Mb | 3 章: 122.73 – 122.78 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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不活性ユビキチンカルボキシル末端加水分解酵素53は、ヒトではUSP53遺伝子によってコードされるタンパク質である。 [5]
USP53 は、このグループの
他のプロテアーゼとの配列相同性に基づいて脱ユビキチン化酵素に分類されていますが、触媒ドメインに機能的に必須のヒスチジンが欠如しており、活性アッセイではUSP53が触媒的に不活性であることが示唆されています。 [6] [7] [8] USP53 は触媒活性を欠いていますが、重要な生理学的機能を果たしています。Usp53 の変異は、マウスで進行性の難聴を引き起こすことが示されています[8]。また、ヒトでは遅発性の難聴と胆汁うっ滞を引き起こします[9]。USP53は細胞のタイトジャンクション
に局在し、タイトジャンクションタンパク質 2 (TJP2)と相互作用します。 [8] TJP2の変異は、聴覚障害[10]と胆汁うっ滞を引き起こすことも示されています[11] 。
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000145390 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000039701 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 永瀬 剛、菊野 亮、石川 紀、広沢 正、小原 修 (2000 年 2 月)。「未確認ヒト遺伝子のコード配列の予測。XVI。in vitro で大型タンパク質をコードする脳由来の 150 個の新しい cDNA クローンの完全配列」。DNA研究。7 ( 1): 65–73。doi : 10.1093/ dnares /7.1.65。PMID 10718198。
- ^ ケサダ V、ディアス=ペラレス A、グティエレス=フェルナンデス A、ガラバヤ C、カル S、ロペス=オティン C (2004 年 1 月)。 「22の新規ヒトユビキチン特異的プロテアーゼのクローニングと酵素分析」。生化学および生物物理学研究コミュニケーション。314 (1): 54–62。土井:10.1016/j.bbrc.2003.12.050。PMID 14715245。
- ^ 「Entrez Gene: USP53 ユビキチン特異的ペプチダーゼ 53」。
- ^ abc Kazmierczak M、Harris SL、 Kazmierczak P、Shah P、Starovoytov V、Ohlemiller KK、Schwander M (2015年11月)。「Usp53に変異を持つマウスの進行性難聴」。The Journal of Neuroscience。35 ( 47): 15582–98。doi : 10.1523 /JNEUROSCI.1965-15.2015。PMC 4659823。PMID 26609154。
- ^ マディレヴラ S、アルヘビ H、アルカハタニ A、アルグフィ T、アルサイフ HS、イブラヒム N、アブドゥルワハブ F、バール M、アルザイダン H、アルメハイデブ A、アルサシ O、アルハシェム A、フサイニ HA、ワリ S、アルクラヤ FS (2018 年 9 月)。 「KIF12、PPM1F、USP53、LSR、およびWDR83OS病原性バリアントによって定義される小児胆汁うっ滞性肝疾患の新規遺伝子座の同定」。医学における遺伝学。21 (5): 1164–1172。土井:10.1038/s41436-018-0288-x。PMID 30250217。S2CID 52811525 。
- ^ Wang HY、Zhao YL、Liu Q、Yuan H、Gao Y、Lan L、Yu L、Wang DY、Guan J、Wang QJ (2015年12月)。「無条件常染色体優性非症候性遺伝性聴覚障害を有する中国人家族における2つの疾患原因遺伝子TJP2およびGJB2の同定」。中国 医学雑誌。128 ( 24): 3345–51。doi : 10.4103 / 0366-6999.171440。PMC 4797511。PMID 26668150。
- ^ Sambrotta M、Strautnieks S、Papouli E、Rushton P、Clark BE、Parry DA、Logan CV、Newbury LJ、Kamath BM、Ling S、Grammatikopoulos T、Wagner BE、Magee JC、Sokol RJ、Mieli-Vergani G、Smith JD、Johnson CA、McClean P、Simpson MA、Knisely AS、Bull LN、Thompson RJ (2014 年 10 月)。「TJP2 の変異が進行性胆汁うっ滞性肝疾患を引き起こす」。Nature Genetics . 46 (4): 326–328. doi :10.1038/ng.2918. PMC 4061468 . PMID 24614073。
さらに読む
- 木村和也、若松A、鈴木裕、太田隆、西川隆、山下R、山本J、関根正、釣谷和、若栗博、石井S、杉山隆、斉藤和久、磯野裕、入江R、櫛田直、米山隆、大塚 R、神田 K、横井 T、近藤 H、我妻 M、村川 K、石田 S、石橋 T、高橋-藤井 A、棚瀬 T、永井 K、菊池 H、中井 K、磯貝 哲、菅野 S(2006年1月)。 「転写調節の多様化: ヒト遺伝子の推定上の代替プロモーターの大規模な同定と特性評価」。ゲノム研究。16 (1): 55-65。土井:10.1101/gr.4039406。PMC 1356129。PMID 16344560。
- ルアル JF、ヴェンカテサン K、ハオ T、弘實=岸川 T、ドリコット A、リー N、ベリス GF、ギボンズ FD、ドレーゼ M、アイヴィ=グエデフスー N、クリットゴード N、サイモン C、ボクセム M、ミルスタイン S、ローゼンバーグ J、ゴールドバーグDS、チャン LV、ウォン SL、フランクリン G、リー S、アルバラ JS、リム J、フロートン C、ラモサス E、セビック S、ベックス C、ラメシュ P、シコルスキー RS、ヴァンデンハウト J、ゾグビ HY、スモリャル A、ボサック S、セケーラ R、ドゥセット スタム L、キュージック ME、ヒル DE、ロス FP、ビダル M ( 2005 年 10 月)。 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。自然。437 (7062): 1173–8. Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
- Ozyildirim AM、Wistow GJ、Gao J、Wang J、Dickinson DP、Frierson HF、Laurie GW (2005 年 5 月)。「涙腺トランスクリプトームは、稀少で特徴づけの不十分な遺伝子トランスクリプトの非常に豊富なソースです」。Investigative Ophthalmology & Visual Science。46 ( 5): 1572–80。CiteSeerX 10.1.1.123.3574。doi : 10.1167 /iovs.04-1380。PMID 15851553 。