Protein-coding gene in the species Homo sapiens
ユビキチン結合酵素E2D1 は、ヒトでは UBE2D1 遺伝子によってコードされる タンパク質 である 。 [5] [6] [7]
関数
ユビキチンによるタンパク質の修飾は、異常なタンパク質や短寿命のタンパク質を分解の標的とする重要な細胞メカニズムです。ユビキチン化には、少なくとも 3 つのクラスの酵素が関与します。ユビキチン活性化酵素 (E1)、ユビキチン結合酵素 (E2)、ユビキチンタンパク質リガーゼ (E3) です。この遺伝子は、E2 ユビキチン結合酵素ファミリーのメンバーをコードしています。この酵素は鉄輸送刺激因子 (SFT) と密接に関連しており、遺伝性ヘモクロマトーシスでアップレギュレーションされます。また、E1 ユビキチン活性化酵素および E3 ユビキチンタンパク質リガーゼと相互作用することで、腫瘍抑制タンパク質 p53 および低酸素誘導性転写因子 HIF1alpha のユビキチン化にも機能します。 [7]
インタラクション
UBE2D1 は以下と相互作用する ことが示されています :
BARD1 、 [8] [9] [10] [11] [12] [13] [14] [15]
BRCA1 、 [8] [9] [10] [11] [12] [13] [14] [15] [16] [17] および
UBE3A . [18] [19]
参考文献
^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000072401 – Ensembl 、2017 年 5 月
^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000019927 – Ensembl 、2017 年 5 月
^ 「Human PubMed Reference:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。
^ 「マウス PubMed リファレンス:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。
^ Robinson PA、Leek JP、Ardley HC、Thompson J、Rose SA、Markham AF (1999年3月)。「In situハイブリダイゼーションによるUBE2D1のヒト染色体バンド10q11.2→q21への割り当て」。Cytogenet Cell Genet。83 ( 3–4 ) : 247–8。doi : 10.1159 / 000015195。PMID 10072594。S2CID 3059748 。
^ Jensen JP、Bates PW、Yang M、Vierstra RD、 Weissman AM (1996 年 1 月)。「密接に関連するヒトユビキチン結合酵素ファミリーの同定」。J Biol Chem . 270 (51): 30408– 14。doi : 10.1074/ jbc.270.51.30408。PMID 8530467 。
^ ab "Entrez Gene: UBE2D1 ユビキチン結合酵素 E2D 1 (UBC4/5 ホモログ、酵母)"。
^ ab Mallery DL、Vandenberg CJ 、Hiom K (2002年12月)。「ポリユビキチン鎖によるBRCA1/BARD1複合体のE3リガーゼ機能の活性化」。EMBO J. 21 (24): 6755– 62. doi :10.1093/emboj/cdf691. PMC 139111. PMID 12485996 。
^ ab Kentsis A, Gordon RE, Borden KL (2002年11月). 「超分子RINGドメイン自己組織化による生化学反応の制御」 Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (24): 15404– 9. Bibcode :2002PNAS...9915404K. doi : 10.1073/pnas.202608799 . PMC 137729 . PMID 12438698.
^ ab Chen A, Kleiman FE, Manley JL, Ouchi T, Pan ZQ (2002年6月). 「BRCA1*BARD1 RINGユビキチンリガーゼの自己ユビキチン化」. J. Biol. Chem . 277 (24): 22085– 92. doi : 10.1074/jbc.M201252200 . PMID 11927591.
^ ab Dong Y, Hakimi MA, Chen X, Kumaraswamy E, Cooch NS, Godwin AK, Shiekhattar R (2003 年 11 月). 「BRCA1 および BRCA2 を含むホロ酵素複合体 BRCC のシグナロソーム様サブユニットによる制御と DNA 修復における役割」. Mol. Cell . 12 (5): 1087– 99. doi : 10.1016/s1097-2765(03)00424-6 . PMID 14636569.
^ ab Sato K, Hayami R, Wu W, Nishikawa T, Nishikawa H, Okuda Y, Ogata H, Fukuda M, Ohta T (2004年7月). 「ヌクレオフォスミン/B23はBRCA1-BARD1ユビキチンリガーゼの候補基質である」 J. Biol. Chem . 279 (30): 30919– 22. doi : 10.1074/jbc.C400169200 . PMID 15184379.
^ ab Wu-Baer F、Lagrazon K、Yuan W、Baer R (2003 年 9 月)。 「BRCA1/BARD1ヘテロ二量体は、ユビキチンのリジン残基K6が関与する型破りな結合を介してポリユビキチン鎖を組み立てます。」 J.Biol.化学 。 278 (37): 34743– 6. 土井 : 10.1074/jbc.C300249200 。 PMID 12890688。
^ ab Vandenberg CJ、Gergely F、Ong CY、Pace P、Mallery DL、Hiom K、Patel KJ (2003年7月)。「BRCA1に依存しないFANCD2のユビキチン化」。Mol . Cell . 12 (1): 247– 54. doi : 10.1016/s1097-2765(03)00281-8 . PMID 12887909。
^ ab 橋爪 亮、福田 正之、前田 郁、西川 浩、小宅 大介、矢吹 勇、緒方 浩、太田 哲也 (2001 年 5 月)。「RING ヘテロダイマー BRCA1-BARD1 は乳がん由来の変異により不活性化されるユビキチンリガーゼである」。J . Biol. Chem . 276 (18): 14537– 40. doi : 10.1074/jbc.C000881200 . PMID 11278247。
^ Brzovic PS, Keeffe JR, Nishikawa H, Miyamoto K, Fox D, Fukuda M, Ohta T, Klevit R (2003 年 5 月). 「活性 BRCA1/BARD1 ユビキチンリガーゼ複合体の組み立てにおける結合と認識」 Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 100 (10): 5646– 51. Bibcode :2003PNAS..100.5646B. doi : 10.1073/pnas.0836054100 . PMC 156255 . PMID 12732733.
^ Nishikawa H, Ooka S, Sato K, Arima K, Okamoto J, Klevit RE, Fukuda M, Ohta T (2004年2月). 「質量分析と変異解析により、BRCA1-BARD1ユビキチンリガーゼによって触媒されるLys-6結合ポリユビキチン鎖が明らかになった」 J. Biol. Chem . 279 (6): 3916– 24. doi : 10.1074/jbc.M308540200 . PMID 14638690.
^ Nuber U、Schwarz S、Kaiser P、Schneider R、Scheffner M (1996 年 2 月)。「ヒトユビキチン結合酵素 UbcH6 および UbcH7 (E2-F1) のクローニングと E6-AP および RSP5 との相互作用の特性評価」。J . Biol. Chem . 271 (5): 2795– 800. doi : 10.1074/jbc.271.5.2795 . PMID 8576257。
^ Nuber U、Scheffner M (1999 年 3 月)。「hect E3 ユビキチン-タンパク質リガーゼ相互作用に必要な E2 ユビキチン結合酵素の決定因子の同定」。J . Biol. Chem . 274 (11): 7576– 82. doi : 10.1074/jbc.274.11.7576 . PMID 10066826。
さらに読む
Scheffner M、Huibregtse JM、Howley PM (1994)。「p53 の E6-AP 依存性ユビキチン化を媒介するヒトユビキチン結合酵素の同定」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 91 ( 19): 8797– 801。Bibcode : 1994PNAS ... 91.8797S。doi : 10.1073/ pnas.91.19.8797。PMC 44693。PMID 8090726 。
Bonaldo MF、Lennon G、Soares MB (1997)。「正規化と減算: 遺伝子発見を容易にする 2 つのアプローチ」。Genome Res . 6 (9): 791– 806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548。
Hatakeyama S, Jensen JP, Weissman AM (1997). 「哺乳類HECTファミリーユビキチンタンパク質リガーゼの細胞内局在とユビキチン結合酵素(E2)相互作用」 J. Biol. Chem . 272 (24): 15085– 92. doi : 10.1074/jbc.272.24.15085 . PMID 9182527.
Gutierrez JA、Yu J、Rivera S、Wessling-Resnick M (1997)。「Fe輸送刺激因子SFTの機能発現クローニングと特性評価」。J . Cell Biol . 139 (4): 895– 905. doi :10.1083/jcb.139.4.895. PMC 2139974. PMID 9362508 。
Gutierrez JA、Yu J、Wessling-Resnick M (1999)。「鉄輸送の刺激因子であるSFTのヒト遺伝子の特性評価と染色体マッピング」。Biochem . Biophys. Res. Commun . 253 (3): 739– 42. doi :10.1006/bbrc.1998.9836. PMID 9918797。
Nuber U、Scheffner M (1999)。「Hect E3ユビキチン-タンパク質リガーゼ相互作用に必要なE2ユビキチン結合酵素の決定因子の同定」。J . Biol. Chem . 274 (11): 7576– 82. doi : 10.1074/jbc.274.11.7576 . PMID 10066826。
Kamura T, Sato S, Iwai K, Czyzyk-Krzeska M, Conaway RC, Conaway JW (2000). 「再構成されたフォン・ヒッペル・リンドウ(VHL)腫瘍抑制因子複合体によるHIF1αユビキチン化の活性化」 Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 97 (19): 10430– 5. Bibcode :2000PNAS...9710430K. doi : 10.1073/pnas.190332597 . PMC 27041 . PMID 10973499.
Pringa E、Martinez-Noel G、Muller U、Harbers K (2001)。「核ドットタンパク質のリングフィンガー関連Uボックスモチーフとユビキチン結合酵素との相互作用」。J . Biol. Chem . 276 (22): 19617– 23. doi : 10.1074/jbc.M100192200 . PMID 11274149。
橋爪 亮, 福田 正之, 前田 郁, 西川 秀, 小宅 大介, 矢吹 勇, 緒方 秀, 太田 哲也 (2001). 「RINGヘテロダイマーBRCA1-BARD1は乳がん由来の変異により不活性化されるユビキチンリガーゼである」. J. Biol. Chem . 276 (18): 14537– 40. doi : 10.1074/jbc.C000881200 . PMID 11278247.
Matsuzawa SI, Reed JC (2001). 「Siah-1、SIP、Ebi は p53 応答に関連するベータカテニン分解の新しい経路で協力する」 Mol. Cell . 7 (5): 915– 26. doi : 10.1016/S1097-2765(01)00242-8 . PMID 11389839.
Jiang J、Ballinger CA、Wu Y、Dai Q、Cyr DM、Höhfeld J、Patterson C (2001)。「CHIP は U ボックス依存性 E3 ユビキチンリガーゼ:ユビキチン化のターゲットとしての Hsc70 の特定」。J. Biol. Chem . 276 (46): 42938– 44. doi : 10.1074/jbc.M101968200 . PMID 11557750。
Chen A, Kleiman FE, Manley JL, Ouchi T, Pan ZQ (2002). 「BRCA1*BARD1 RINGユビキチンリガーゼの自己ユビキチン化」 J. Biol. Chem . 277 (24): 22085–92 . doi : 10.1074/jbc.M201252200 . PMID 11927591.
Badciong JC、Haas AL (2003)。「MdmX は、Mdm2 のユビキチン化を相乗的に促進できる RING フィンガーユビキチンリガーゼです」。J . Biol. Chem . 277 (51): 49668– 75. doi : 10.1074/jbc.M208593200 . PMID 12393902。
Kentsis A, Gordon RE, Borden KL (2003). 「超分子RINGドメインの自己組織化による生化学反応の制御」 Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (24): 15404– 9. Bibcode :2002PNAS...9915404K. doi : 10.1073/pnas.202608799 . PMC 137729 . PMID 12438698.
Gehrke SG、Riedel HD、Herrmann T、Hadaschik B、Bents K、Veltkamp C、Stremmel W (2003)。「ヒト E2 ユビキチン結合酵素のメンバーである UbcH5A は、鉄輸送の刺激因子である SFT と密接に関連しており、遺伝性ヘモクロマトーシスでアップレギュレーションされる」。Blood。101 ( 8 ) : 3288–93。doi : 10.1182 / blood -2002-07-2192。PMID 12480712 。
Mallery DL、Vandenberg CJ 、Hiom K (2004)。「ポリユビキチン鎖によるBRCA1/BARD1複合体のE3リガーゼ機能の活性化」。EMBO J. 21 (24): 6755– 62. doi :10.1093/emboj/cdf691. PMC 139111. PMID 12485996 。
Takeyama K, Aguiar RC, Gu L, He C, Freeman GJ, Kutok JL, Aster JC, Shipp MA (2003). 「BAL 結合タンパク質 BBAP および関連する Deltex ファミリーメンバーは、ユビキチンタンパク質イソペプチドリガーゼ活性を示す」 J. Biol. Chem . 278 (24): 21930– 7. doi : 10.1074/jbc.M301157200 . PMID 12670957.