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| U12 マイナースプライソソームRNA | |
|---|---|
| 識別子 | |
| シンボル | U12 |
| Rfam | RF00007 |
| その他のデータ | |
| RNAタイプ | 遺伝子; snRNA ;スプライシング |
| ドメイン | 真核生物 |
| 行く | GO:0000371 GO:0045131 GO:0005693 |
| それで | 0000399 0000000 |
| PDB構造 | PDBe |
U12マイナースプライソソームRNAは、 U12小核RNA(snRNA )から形成され、 U4atac / U6atac、U5、U11 snRNAおよび関連タンパク質とともに、低存在量のプレmRNAイントロンの異なるクラスを切断するスプライソソームを形成します。U12配列はU2の配列と大きく異なりますが、2つは機能的に類似しています。[1]
構造
U12 RNAの予測される二次構造は公開されています。[2]しかし、ここに示す3'末端の代替の単一ヘアピンは、異なるDrosophila melanogasterとArabidopsis thalianaの配列の配置とよりよく一致するようです。[3]スプライスアウトされたU12イントロンの配列は、U12イントロンデータベースと呼ばれる生物学的データベースに収集されます。
参考文献
- ^ Tarn WY 、 Steitz JA (1997年4月)。「プレmRNAスプライシング:新しいスプライソソームの発見により課題が倍増」。Trends in Biochemical Sciences。22 ( 4): 132–7。doi : 10.1016 /S0968-0004(97) 01018-9。PMID 9149533 。
- ^ Shukla GC、Padgett RA (1999年4月)。「脊椎動物と高等植物におけるU6atacおよびU12 snRNAの機能的特徴の保存」。RNA . 5 ( 4): 525–38. doi :10.1017/S1355838299982213. PMC 1369779 . PMID 10199569.
- ^ Otake LR、Scamborova P、Hashimoto C、Steitz JA (2002年2月)。「分岐したU12型スプライソソームはpre-mRNAスプライシングに必要であり、ショウジョウバエの発達に不可欠である」。Molecular Cell。9 ( 2 ) : 439–46。doi : 10.1016/S1097-2765(02)00441-0。PMID 11864616。
外部リンク
- Rfamの U12 マイナー スプライソソーム RNA のページ
