U5 スプライソソームRNA

U5 スプライソソームRNA
U5 スプライソソームRNA
	U5の予測される二次構造と配列の保存
識別子
シンボル	U5
Rfam	RF00020
その他のデータ
RNAタイプ	遺伝子; snRNA ;スプライシング
ドメイン	真核生物
行く	GO:0000351 GO:0000353 GO:0005682 GO:0046540
それで	0000395 0000000
PDB構造	PDBe

U5 snRNAは、スプライソソームの構成要素としてRNA スプライシングに関与する小さな核 RNA (snRNA)です。これは、スプライソソーム内で最大かつ最も保存されているタンパク質である Prp8、スプライソソームの活性化に必要なヘリカーゼである Brr2 、Snu114、および 7 つの Sm タンパク質を含むいくつかのタンパク質と結合して、U5 snRNP (小さな核リボ核タンパク質) を形成します。^[1] U5 snRNA は、スプライソソームの活性部位に突き出る同軸に積み重ねられた一連のヘリックスを形成します。^[2]^[3]この一連のヘリックスを覆うループ 1 は、スプライシングの 2 つの化学反応中に 5' エクソンと 4 ～ 5 塩基対を形成します。^[4]^[5]この相互作用は、スプライシングのステップ 2 であるエクソン連結中に特に重要であると思われます。^[6]

参考文献

^ Stevens SW、Barta I、Ge HY、Moore RE、Young MK、Lee TD、Abelson J (2001 年 11 月)。「Saccharomyces cerevisiae 由来の U5、U6、および U4/U6 x U5 小型核リボ核タンパク質の生化学的および遺伝学的分析」。RNA。7 ( 11 ) : 1543–53。PMC 1370197。PMID 11720284。
^ グエン TH、ガレイ WP、バイ XC、サヴァ CG、ニューマン AJ、シェーレス SH、永井 K (2015 年 7 月)。「スプライソソーム U4/U6.U5 トリ snRNP の構造」。自然。523 (7558): 47–52。Bibcode :2015Natur.523...47N。土井：10.1038/nature14548. PMC 4536768。PMID 26106855。
^ Yan C, Hang J, Wan R, Huang M, Wong CC, Shi Y (2015 年 9 月). 「3.6 オングストロームの解像度での酵母スプライソソームの構造」. Science . 349 (6253): 1182–91. Bibcode :2015Sci...349.1182Y. doi :10.1126/science.aac7629. PMID 26292707. S2CID 22194712.
^ Newman AJ、Norman C (1992年2月)。「U5 snRNAは5 'および3'スプライス部位でエクソン配列と相互作用する」。Cell.68 ( 4):743–54.doi : 10.1016 / 0092-8674(92)90149-7.PMID 1739979.S2CID 3328508 .
^ Sontheimer EJ 、Steitz JA (1993 年12月)。「スプライソソームの活性部位成分としての U5 および U6 小型核 RNA」。Science。262 (5142): 1989–96。Bibcode : 1993Sci ...262.1989S。doi :10.1126/science.8266094。PMID 8266094 。
^ O'Keefe RT、Norman C、 Newman AJ (1996年8月)。「不変のU5 snRNAループ1配列は、酵母におけるプレmRNAスプライシングの最初の触媒ステップには不要である」。Cell。86 ( 4 ) : 679–89。doi : 10.1016/s0092-8674(00) 80140-3。PMID 8752221。S2CID 17484887 。

さらに読む

Zwieb C (1997 年 1 月). 「uRNA データベース」.核酸研究. 25 (1): 102–3. doi :10.1093/nar/25.1.102. PMC 146409. PMID 9016512 .
Thomas J、Lea K、Zucker - Aprison E、 Blumenthal T (1990 年 5 月) 。「Caenorhabditis elegans のスプライソソーム snRNA」。核酸研究。18 (9): 2633–42。doi :10.1093/ nar /18.9.2633。PMC 330746。PMID 2339054。

外部リンク

Rfamの U5 スプライソソーム RNA のページ

[1] Stevens SW、Barta I、Ge HY、Moore RE、Young MK、Lee TD、Abelson J (2001 年 11 月)。「Saccharomyces cerevisiae 由来の U5、U6、および U4/U6 x U5 小型核リボ核タンパク質の生化学的および遺伝学的分析」。RNA。7 ( 11 ) : 1543–53。PMC 1370197。PMID 11720284。

[2] グエン TH、ガレイ WP、バイ XC、サヴァ CG、ニューマン AJ、シェーレス SH、永井 K (2015 年 7 月)。「スプライソソーム U4/U6.U5 トリ snRNP の構造」。自然。523 (7558): 47–52。Bibcode :2015Natur.523...47N。土井：10.1038/nature14548. PMC 4536768。PMID 26106855。

[3] Yan C, Hang J, Wan R, Huang M, Wong CC, Shi Y (2015 年 9 月). 「3.6 オングストロームの解像度での酵母スプライソソームの構造」. Science . 349 (6253): 1182–91. Bibcode :2015Sci...349.1182Y. doi :10.1126/science.aac7629. PMID 26292707. S2CID 22194712.

[4] Newman AJ、Norman C (1992年2月)。「U5 snRNAは5 'および3'スプライス部位でエクソン配列と相互作用する」。Cell.68 ( 4):743–54.doi : 10.1016 / 0092-8674(92)90149-7.PMID 1739979.S2CID 3328508 .

[5] ^ Sontheimer EJ 、Steitz JA (1993 年12月)。「スプライソソームの活性部位成分としての U5 および U6 小型核 RNA」。Science。262 (5142): 1989–96。Bibcode : 1993Sci ...262.1989S。doi :10.1126/science.8266094。PMID 8266094 。

[6] ^ O'Keefe RT、Norman C、 Newman AJ (1996年8月)。「不変のU5 snRNAループ1配列は、酵母におけるプレmRNAスプライシングの最初の触媒ステップには不要である」。Cell。86 ( 4 ) : 679–89。doi : 10.1016/s0092-8674(00) 80140-3。PMID 8752221。S2CID 17484887 。